seq1 = pF1KB7580.tfa, 852 bp
seq2 = pF1KB7580/gi568815575f_73347254.tfa (gi568815575f:73347254_73554582), 207329 bp

>pF1KB7580 852
>gi568815575f:73347254_73554582 (ChrX)

1-502  (100001-100502)   100% ->
503-648  (106264-106409)   100% ->
649-852  (107126-107329)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTACGGAAGCTGTCTTTTGGAGAAAGAAGCAGGCATGTACCCGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTACGGAAGCTGTCTTTTGGAGAAAGAAGCAGGCATGTACCCGGGCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTCATGAGCCCTGGGGGCGACGGCACAGCTGGGACAGGCGGCACAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTCATGAGCCCTGGGGGCGACGGCACAGCTGGGACAGGCGGCACAGGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGGTGGGAGTCCGATGCCAGCCTCCAATTTCGCTGCGGCACCGGCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGGTGGGAGTCCGATGCCAGCCTCCAATTTCGCTGCGGCACCGGCTTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCGCACTATATGGGGTATCCTCATATGCCCAGCATGGATCCTCACTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCGCACTATATGGGGTATCCTCATATGCCCAGCATGGATCCTCACTGGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTCTCTGGGAGTCTGGGGCTCACCCTACAGTCCCCCGCGAGAAGACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTCTCTGGGAGTCTGGGGCTCACCCTACAGTCCCCCGCGAGAAGACTGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCGTGTATCCTGGGCCGTCTAGTACAATGGGCACAGTGCCGGTGAACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCGTGTATCCTGGGCCGTCTAGTACAATGGGCACAGTGCCGGTGAACGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGACCTCTAGCCCCGCCGCTTTCTGCTCGACCGACTACAGCAACTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGACCTCTAGCCCCGCCGCTTTCTGCTCGACCGACTACAGCAACTTGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCCTGTGGGCGGTGGAACTAGCGGCAGCAGCCTACCAGGCCAGGCTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCCTGTGGGCGGTGGAACTAGCGGCAGCAGCCTACCAGGCCAGGCTGGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGTCGCTTGTCCCGACGGACGCAGGCGCCGCCAAGGCCAGTTCCCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGTCGCTTGTCCCGACGGACGCAGGCGCCGCCAAGGCCAGTTCCCCCAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGGAGCCGCCACAGCCCCTATGCATGGATGCGCAAGACGGTGCAGGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGGAGCCGCCACAGCCCCTATGCATGGATGCGCAAGACGGTGCAGGTGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GG         GGAAAACCAGGACAAAAGAAAAGTATCGTGTAGTTTACA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGGTG...CAGGGAAAACCAGGACAAAAGAAAAGTATCGTGTAGTTTACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CTGATCATCAAAGATTGGAGCTGGAAAAGGAATTCCATTGCAATAGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106303 CTGATCATCAAAGATTGGAGCTGGAAAAGGAATTCCATTGCAATAGATAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 ATCACCATCCAGAGAAAATCAGAGCTGGCAGTTAACCTGGGCCTTTCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106353 ATCACCATCCAGAGAAAATCAGAGCTGGCAGTTAACCTGGGCCTTTCCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GAGACAG         GTGAAAATCTGGTTTCAGAATCGCAGAGCCAAGG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106403 GAGACAGGTA...CAGGTGAAAATCTGGTTTCAGAATCGCAGAGCCAAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AGAGAAAGATGATCAAAAAGAAAATCTCCCAGTTTGAGAATAGTGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107160 AGAGAAAGATGATCAAAAAGAAAATCTCCCAGTTTGAGAATAGTGGAGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 TCGGTGCAAAGTGACTCTGACTCCATCAGCCCTGGGGAACTACCTAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107210 TCGGTGCAAAGTGACTCTGACTCCATCAGCCCTGGGGAACTACCTAACAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TTTTTTCACCACACCATCTGCTGTTCGTGGATTTCAACCTATTGAGATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107260 TTTTTTCACCACACCATCTGCTGTTCGTGGATTTCAACCTATTGAGATAC

    850     .    :    .    :
    833 AGCAGGTTATAGTCTCCGAA
        ||||||||||||||||||||
 107310 AGCAGGTTATAGTCTCCGAA