seq1 = pF1KB7574.tfa, 843 bp
seq2 = pF1KB7574/gi568815596r_11346480.tfa (gi568815596r:11346480_11565879), 219400 bp

>pF1KB7574 843
>gi568815596r:11346480_11565879 (Chr2)

(complement)

1-108  (100001-100108)   100% ->
109-163  (108647-108701)   100% ->
164-380  (112082-112298)   100% ->
381-541  (114074-114234)   98% ->
542-651  (115759-115868)   100% ->
652-799  (118106-118253)   100% ->
800-843  (119357-119400)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTCAGCAGCGGCCGGCGAGGAAGTTACCCAGTCTCCTCCTGGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTCAGCAGCGGCCGGCGAGGAAGTTACCCAGTCTCCTCCTGGACCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACGGAGGAGACGGTTCGCCGTCGGTGCCGAGACCCCATCAACGTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACGGAGGAGACGGTTCGCCGTCGGTGCCGAGACCCCATCAACGTGGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCTGCTG         CCATCAAAAATAAGGATTAATTTAGAAGATAAT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCTGCTGGTA...CAGCCATCAAAAATAAGGATTAATTTAGAAGATAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTACAATATGTGTCCATGAGAA         AAGCTCTAAAAGTGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 108680 GTACAATATGTGTCCATGAGAAGTA...CAGAAGCTCTAAAAGTGAAGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 ACCTCGTTTTGATGTATCGCTGGTTTATTTAACTCGAAAATTTATGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112101 ACCTCGTTTTGATGTATCGCTGGTTTATTTAACTCGAAAATTTATGGATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGTCAGATCTGCTCCCGGGGGTATTCTTGACTTAAACAAGGTTGCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112151 TTGTCAGATCTGCTCCCGGGGGTATTCTTGACTTAAACAAGGTTGCAACG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAACTGGGAGTCCGAAAGCGGAGAGTGTATGACATCACCAATGTCTTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112201 AAACTGGGAGTCCGAAAGCGGAGAGTGTATGACATCACCAATGTCTTAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGGAATCGACCTCGTTGAAAAGAAATCCAAGAACCATATTAGATGGAT  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 112251 TGGAATCGACCTCGTTGAAAAGAAATCCAAGAACCATATTAGATGGATGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    381        AGGATCTGATCTTAGCAATTTTGGAGCAGTTCCCCAACAAAAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112301 G...AAGAGGATCTGATCTTAGCAATTTTGGAGCAGTTCCCCAACAAAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGCTACAGGAGGAACTTTCTGACTTATCAGCAATGGAAGATGCTTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114117 AAGCTACAGGAGGAACTTTCTGACTTATCAGCAATGGAAGATGCTTTGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGAGTTAATTAAGGATTGTGCTCAGCAGCTGTTTGAGTTAACAGATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114167 TGAGTTAATTAAGGATTGTGCTCAGCAGCTGTTTGAGTTAACAGATGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AAGAAAATGAAAGACTA G         CATATGTGACCTATCAAGACAT
        ||||||||||||||-||- >>>...>>>||||||||||||||||||||||
 114217 AAGAAAATGAAAGA TATCCTT...TAGCATATGTGACCTATCAAGACAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    564 TCATAGCATTCAGGCCTTCCATGAACAGATCGTCATTGCAGTTAAAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115781 TCATAGCATTCAGGCCTTCCATGAACAGATCGTCATTGCAGTTAAAGCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    614 CAGCAGAAACCAGATTGGATGTTCCAGCTCCCAGAGAA         GAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 115831 CAGCAGAAACCAGATTGGATGTTCCAGCTCCCAGAGAAGTA...TAGGAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    655 TCTATCACAGTGCACATAAGGAGCACCAACGGACCTATCGATGTCTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118109 TCTATCACAGTGCACATAAGGAGCACCAACGGACCTATCGATGTCTATTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    705 GTGTGAAGTGGAGCAGGGTCAGACCAGTAACAAAAGGTCTGAAGGTGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118159 GTGTGAAGTGGAGCAGGGTCAGACCAGTAACAAAAGGTCTGAAGGTGTCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    755 GGACCTCTTCATCTGAGAGCACTCATCCAGAAGGCCCTGAGGAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 118209 GGACCTCTTCATCTGAGAGCACTCATCCAGAAGGCCCTGAGGAAGGTA..

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    800     AAGAAAATCCTCAGCAAAGTGAAGAATTGCTTGAAGTAAGCAAC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118259 .CAGAAGAAAATCCTCAGCAAAGTGAAGAATTGCTTGAAGTAAGCAAC