seq1 = pF1KB7574.tfa, 843 bp
seq2 = pF1KB7574/gi568815576f_21168218.tfa (gi568815576f:21168218_21368905), 200688 bp

>pF1KB7574 843
>gi568815576f:21168218_21368905 (Chr22)

69-157  (99992-100078)   95% ==
234-843  (100079-100688)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     69 CCGTCGGTGCCGAGACCCCATCAACGTGGAGGGCCTGCTGCCATCAAAAA
        ||| ||| |--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99992 CCGACGGAG  GAGACCCCATCAACGTGGAGGGCCTGCTGCCATCAAAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .
    119 TAAGGATTAATTTAGAAGATAATGTACAATATGTGTCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100040 TAAGGATTAATTTAGAAGATAATGTACAATATGTGTCCA

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    234 TGTCAGATCTGCTCCCGGGGGTATTCTTGACTTAAACAAGGTTGCAACGA
        ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100079 TGAGAAATCTGCTCCCGGGGGTATTCTTGACTTAAACAAGGTTGCAACGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    284 AACTGGGAGTCCGAAAGCGGAGAGTGTATGACATCACCAATGTCTTAGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 100129 AACTGGGAGTCCGAAAGCGGAGAGTGTATGACATCACCGATGTCTTAGAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    334 GGAATCGACCTCGTTGAAAAGAAATCCAAGAACCATATTAGATGGATAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100179 GGAATCGACCTCGTTGAAAAGAAATCCAAGAACCATATTAGATGGATAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    384 ATCTGATCTTAGCAATTTTGGAGCAGTTCCCCAACAAAAGAAGCTACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100229 ATCTGATCTTAGCAATTTTGGAGCAGTTCCCCAACAAAAGAAGCTACAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    434 AGGAACTTTCTGACTTATCAGCAATGGAAGATGCTTTGGATGAGTTAATT
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 100279 AGGAACTTTCTGACTTACCAGCAATGGAAGATGCTTTGGATGAGTTAATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    484 AAGGATTGTGCTCAGCAGCTGTTTGAGTTAACAGATGACAAAGAAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100329 AAGGATTGTGCTCAGCAGCTGTTTGAGTTAACAGATGACAAAGAAAATGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    534 AAGACTAGCATATGTGACCTATCAAGACATTCATAGCATTCAGGCCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100379 AAGACTAGCATATGTGACCTATCAAGACATTCATAGCATTCAGGCCTTCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    584 ATGAACAGATCGTCATTGCAGTTAAAGCTCCAGCAGAAACCAGATTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100429 ATGAACAGATCGTCATTGCAGTTAAAGCTCCAGCAGAAACCAGATTGGAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    634 GTTCCAGCTCCCAGAGAAGACTCTATCACAGTGCACATAAGGAGCACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100479 GTTCCAGCTCCCAGAGAAGACTCTATCACAGTGCACATAAGGAGCACCAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    684 CGGACCTATCGATGTCTATTTGTGTGAAGTGGAGCAGGGTCAGACCAGTA
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 100529 CGGACCTATCGATGTCTATTTGTGAGAAGTGGAGCAGGGTCAGACCAGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    734 ACAAAAGGTCTGAAGGTGTCGGGACCTCTTCATCTGAGAGCACTCATCCA
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 100579 ACAAAAGGTCTGAAGGTGTCAGGACCTCTTCATCTGAGAGCACTCATCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    784 GAAGGCCCTGAGGAAGAAGAAAATCCTCAGCAAAGTGAAGAATTGCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100629 GAAGGCCCTGAGGAAGAAGAAAATCCTCAGCAAAGTGAAGAATTGCTTGA

    600     .    :
    834 AGTAAGCAAC
        ||||||||||
 100679 AGTAAGCAAC