seq1 = pF1KB7573.tfa, 636 bp
seq2 = pF1KB7573/gi568815592r_41807075.tfa (gi568815592r:41807075_42016940), 209866 bp

>pF1KB7573 636
>gi568815592r:41807075_42016940 (Chr6)

(complement)

14-169  (100001-100156)   100% ->
170-423  (107419-107672)   100% ->
424-636  (109654-109866)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     14 GTGTGTCCCAGATGCCTGTGGCCGAGGGCAAGAGTGTTCAGCAAACCGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 GTGTGTCCCAGATGCCTGTGGCCGAGGGCAAGAGTGTTCAGCAAACCGTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     64 GAGCTCCTTACCCGGAAATTGGAGATGCTTGGGGCAGAGAAGCAAGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAGCTCCTTACCCGGAAATTGGAGATGCTTGGGGCAGAGAAGCAAGGAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    114 ATTTTGTGTGGACTGTGAGACTTACCATACGGCCGCCTCTACCCTTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATTTTGTGTGGACTGTGAGACTTACCATACGGCCGCCTCTACCCTTGGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    164 GCCAAG         GTCAGACCGGGAAGCTGATGTATGTGATGCACAAC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCAAGGTC...CAGGTCAGACCGGGAAGCTGATGTATGTGATGCACAAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    205 TCAGAGTACCCATTGAGCTGTTTCGCCCTCTTTGAGAATGGCCCTTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107454 TCAGAGTACCCATTGAGCTGTTTCGCCCTCTTTGAGAATGGCCCTTGCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    255 TATTGCTGACACCAACTTTGATGTGCTTATGGTGAAGCTCAAGGGCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107504 TATTGCTGACACCAACTTTGATGTGCTTATGGTGAAGCTCAAGGGCTTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    305 TCCAGAGTGCTAAGGCCAGCAAGATTGAGACCCGGGGCACCAGGTACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107554 TCCAGAGTGCTAAGGCCAGCAAGATTGAGACCCGGGGCACCAGGTACCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    355 TACTGTGACTTCCTGGTGAAGGTGGGCACGGTCACAATGGGGCCCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107604 TACTGTGACTTCCTGGTGAAGGTGGGCACGGTCACAATGGGGCCCAGTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    405 CCGGGGCATCTCTGTGGAG         GTGGAGTATGGCCCCTGTGTGG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 107654 CCGGGGCATCTCTGTGGAGGTA...CAGGTGGAGTATGGCCCCTGTGTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    446 TAGCTAGTGACTGCTGGAGTCTGCTGCTCGAGTTCCTACAGAGTTTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109676 TAGCTAGTGACTGCTGGAGTCTGCTGCTCGAGTTCCTACAGAGTTTTCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    496 GGCAGCCACACACCAGGGGCTCCCGCAGTGTTTGGGAACAGACATGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109726 GGCAGCCACACACCAGGGGCTCCCGCAGTGTTTGGGAACAGACATGATGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    546 GGTCTACGGCCCAGCAGATACCATGGTCCAGTACATGGAACTCTTCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109776 GGTCTACGGCCCAGCAGATACCATGGTCCAGTACATGGAACTCTTCAACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :
    596 AGATCCGCAAGCAGCAGCAGGTGCCGGTGGCTGGGATTCGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109826 AGATCCGCAAGCAGCAGCAGGTGCCGGTGGCTGGGATTCGT