seq1 = pF1KB7571.tfa, 615 bp
seq2 = pF1KB7571/gi568815587f_65819502.tfa (gi568815587f:65819502_66021432), 201931 bp

>pF1KB7571 615
>gi568815587f:65819502_66021432 (Chr11)

1-42  (100001-100042)   100% ->
43-115  (100279-100351)   100% ->
116-209  (100447-100540)   100% ->
210-329  (100842-100961)   100% ->
330-423  (101068-101161)   100% ->
424-512  (101383-101471)   100% ->
513-615  (101829-101931)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGAGCAAGAAGAAGAAGTACAACGCGCGGTTCCCGCCG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100001 ATGCCGAGCAAGAAGAAGAAGTACAACGCGCGGTTCCCGCCGGTG...CA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     43  GCGCGGATCAAGAAGATCATGCAGACGGACGAAGAGATTGGGAAGGTGG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100278 GGCGCGGATCAAGAAGATCATGCAGACGGACGAAGAGATTGGGAAGGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGGCGGCGGTGCCTGTCATCATCT         CCCGGGCGCTCGAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100328 CGGCGGCGGTGCCTGTCATCATCTGTA...CAGCCCGGGCGCTCGAGCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TTCCTAGAGTCGCTGTTGAAGAAGGCCTGCCAGGTGACCCAGTCGCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100464 TTCCTAGAGTCGCTGTTGAAGAAGGCCTGCCAGGTGACCCAGTCGCGGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CGCGAAGACCATGACCACATCCCACCT         GAAGCAGTGCATCG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100514 CGCGAAGACCATGACCACATCCCACCTGTG...CAGGAAGCAGTGCATCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AGCTGGAGCAGCAGTTTGACTTCTTGAAGGACCTGGTGGCATCTGTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100856 AGCTGGAGCAGCAGTTTGACTTCTTGAAGGACCTGGTGGCATCTGTTCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GACATGCAGGGGGACGGGGAAGACAACCACATGGATGGGGACAAGGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100906 GACATGCAGGGGGACGGGGAAGACAACCACATGGATGGGGACAAGGGCGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCGCAG         GGGCCGGAAGCCAGGCAGCGGCGGCCGGAAGAACG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100956 CCGCAGGTG...AAGGGGCCGGAAGCCAGGCAGCGGCGGCCGGAAGAACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GTGGGATGGGAACGAAAAGCAAGGACAAGAAGCTGTCCGGGACAGACTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101103 GTGGGATGGGAACGAAAAGCAAGGACAAGAAGCTGTCCGGGACAGACTCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GAGCAGGAG         GATGAATCTGAGGACACAGATACTGATGGGGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 101153 GAGCAGGAGGTG...CAGGATGAATCTGAGGACACAGATACTGATGGGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 AGAGGAGACATCACAACCCCCACCCCAGGCCAGCCACCCCTCTGCCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101415 AGAGGAGACATCACAACCCCCACCCCAGGCCAGCCACCCCTCTGCCCACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TTCAGAG         CCCCCCGACACCCTTCCTGCCCTTCGCCTCTACT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101465 TTCAGAGGTG...CAGCCCCCCGACACCCTTCCTGCCCTTCGCCTCTACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 CTGCCTTTGCCCCCAGCGCCCCCGGGCCCCTCAGCACCTGATGAAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101863 CTGCCTTTGCCCCCAGCGCCCCCGGGCCCCTCAGCACCTGATGAAGAGGA

    650     .    :    .
    597 CGAAGAAGATTACGACTCC
        |||||||||||||||||||
 101913 CGAAGAAGATTACGACTCC