seq1 = pF1KB7570.tfa, 837 bp
seq2 = pF1KB7570/gi568815587f_129276036.tfa (gi568815587f:129276036_129551399), 275364 bp

>pF1KB7570 837
>gi568815587f:129276036_129551399 (Chr11)

1-187  (100001-100187)   100% ->
188-488  (160716-161016)   100% ->
489-573  (166800-166884)   100% ->
574-837  (175101-175364)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCACTGCCACGCCGAGCTGAGGCTGAGCTCGCCCGGCCAGCTCAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCACTGCCACGCCGAGCTGAGGCTGAGCTCGCCCGGCCAGCTCAAAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCCAGGCGGCGCTACAAGACTTTCATGATCGACGAGATCCTCTCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGCCAGGCGGCGCTACAAGACTTTCATGATCGACGAGATCCTCTCCAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGACCTGCGATTACTTTGAGAAACTTTCCCTCTACTCCGTGTGCCCGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGACCTGCGATTACTTTGAGAAACTTTCCCTCTACTCCGTGTGCCCGTCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGTCGTGCGACCCAAGCCCCTGCATTCCTGTACGG         GCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100151 CTGGTCGTGCGACCCAAGCCCCTGCATTCCTGTACGGGTA...CAGGCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCCTTCCCTGCGGGCATATCCGCTCCTCTCGGTGATCACCCGCCAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160720 CCCTTCCCTGCGGGCATATCCGCTCCTCTCGGTGATCACCCGCCAGCCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTGTCATCTCCCACCTGGTCCCTGCCACCCCGGGAATCGCCCAGGCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160770 CTGTCATCTCCCACCTGGTCCCTGCCACCCCGGGAATCGCCCAGGCACTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCCTGCCACCAGGTCACCGAGGCGGTCTCTGCTGAGGCCCCAGGGGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160820 TCCTGCCACCAGGTCACCGAGGCGGTCTCTGCTGAGGCCCCAGGGGGCGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGCCCTAGCCAGCAGCGAGTCAGAGACGGAACAGCCCACGCCCCGACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160870 GGCCCTAGCCAGCAGCGAGTCAGAGACGGAACAGCCCACGCCCCGACAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGAAGCCCCGCCGGAGTCGCACCATCTTCACCGAGCTGCAGCTCATGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160920 AGAAGCCCCGCCGGAGTCGCACCATCTTCACCGAGCTGCAGCTCATGGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CTGGAGAAGAAATTCCAGAAGCAGAAGTATTTGTCAACCCCAGACAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 160970 CTGGAGAAGAAATTCCAGAAGCAGAAGTATTTGTCAACCCCAGACAGGTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    489       GTTGGACTTGGCTCAGTCTCTGGGACTCACTCAGCTGCAGGTGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161020 ...TAGGTTGGACTTGGCTCAGTCTCTGGGACTCACTCAGCTGCAGGTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGACCTGGTATCAGAATCGCAGGATGAAATGGAAGAAAATG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 166844 AGACCTGGTATCAGAATCGCAGGATGAAATGGAAGAAAATGGTA...TAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GTTCTTAAAGGTGGACAGGAAGCACCCACAAAACCTAAAGGTCGCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 175101 GTTCTTAAAGGTGGACAGGAAGCACCCACAAAACCCAAAGGTCGCCCCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GAAGAACTCCATCCCCACATCAGAAGAGATTGAAGCTGAAGAGAAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175151 GAAGAACTCCATCCCCACATCAGAAGAGATTGAAGCTGAAGAGAAGATGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ACAGCCAGGCCCAGGGTCAGGAGCAGCTGGAGCCCTCTCAGGGGCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175201 ACAGCCAGGCCCAGGGTCAGGAGCAGCTGGAGCCCTCTCAGGGGCAGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GAGCTCTGTGAAGCACAGGAACCGAAAGCACGTGATGTCCCCTTAGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175251 GAGCTCTGTGAAGCACAGGAACCGAAAGCACGTGATGTCCCCTTAGAGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GGCAGAGCCACCAGACCCGCCCCAGGAGTTGCCAATACCCTCTTCGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175301 GGCAGAGCCACCAGACCCGCCCCAGGAGTTGCCAATACCCTCTTCGGAAC

    850     .    :
    824 CCCCACCATTAAGC
        ||||||||||||||
 175351 CCCCACCATTAAGC