seq1 = pF1KB7566.tfa, 831 bp
seq2 = pF1KB7566/gi568815588r_132684919.tfa (gi568815588r:132684919_132885948), 201030 bp

>pF1KB7566 831
>gi568815588r:132684919_132885948 (Chr10)

(complement)

1-406  (100001-100406)   100% ->
407-579  (100497-100669)   100% ->
580-831  (100779-101030)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACACTAACCGCCCGGGCGCGTTCGTGCTGAGCAGTGCCCCGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACACTAACCGCCCGGGCGCGTTCGTGCTGAGCAGTGCCCCGCTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCGCTGCACAACATGGCCGAGATGAAGACGTCGCTGTTCCCCTACGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCGCTGCACAACATGGCCGAGATGAAGACGTCGCTGTTCCCCTACGCGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCAGGGTCCGGCCGGCTTCAAGGCGCCCGCGCTGGGGGGCCTGGGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCAGGGTCCGGCCGGCTTCAAGGCGCCCGCGCTGGGGGGCCTGGGCGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGCTCCCGCTCGGGACCCCGCACGGCATCAGCGACATCCTGGGCCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGCTCCCGCTCGGGACCCCGCACGGCATCAGCGACATCCTGGGCCGGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGTGGGCGCGGCGGGCGGGGGCCTCCTGGGGGGGCTGCCCCGGCTCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGTGGGCGCGGCGGGCGGGGGCCTCCTGGGGGGGCTGCCCCGGCTCAACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGCTCGCGTCGTCCGCCGGCGTTTACTTCGGGCCCGCGGCCGCTGTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGCTCGCGTCGTCCGCCGGCGTTTACTTCGGGCCCGCGGCCGCTGTGGCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGCGGCTACCCCAAGCCCCTGGCCGAGCTGCCGGGGCGCCCGCCCATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CGCGGCTACCCCAAGCCCCTGGCCGAGCTGCCGGGGCGCCCGCCCATCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTGGCCCGGCGTGGTGCAGGGCGCGCCCTGGAGGGACCCGCGTCTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTGGCCCGGCGTGGTGCAGGGCGCGCCCTGGAGGGACCCGCGTCTGGCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCCCGG         CCCCGGCCGGCGGCGTCCTGGACAAGGACGGGAAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCCCGGGTG...CAGCCCCGGCCGGCGGCGTCCTGGACAAGGACGGGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAGAAGCACTCGCGCCCGACCTTCTCGGGCCAGCAGATCTTCGCGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100532 AAGAAGCACTCGCGCCCGACCTTCTCGGGCCAGCAGATCTTCGCGCTGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GAAAACCTTCGAGCAGACCAAGTACCTGGCGGGCCCGGAGCGCGCGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100582 GAAAACCTTCGAGCAGACCAAGTACCTGGCGGGCCCGGAGCGCGCGCGTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TCGCCTACTCGCTGGGCATGACCGAGAGCCAGGTGAAG         GTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100632 TCGCCTACTCGCTGGGCATGACCGAGAGCCAGGTGAAGGTG...CAGGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TGGTTCCAGAACCGCCGGACCAAGTGGCGCAAGCGGCACGCGGCGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 100782 TGGTTCCAGAACCGCCGGACCAAGTGGCGCAAGCGGCACGCGGTGGAGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GGCGTCGGCCAAGAAGAAGCAGGACTCGGACGCCGAGAAGCTGAAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100832 GGCGTCGGCCAAGAAGAAGCAGGACTCGGACGCCGAGAAGCTGAAGGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GCGGCTCGGACGCGGAGGACGACGACGAATACAACCGGCCCCTGGACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100882 GCGGCTCGGACGCGGAGGACGACGACGAATACAACCGGCCCCTGGACCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AACTCGGACGACGAGAAGATCACGCGGCTGCTCAAGAAGCACAAACCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100932 AACTCGGACGACGAGAAGATCACGCGGCTGCTCAAGAAGCACAAACCCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    783 GAACTTGGCGCTGGTCAGCCCGTGCGGCGGCGGCGCGGGGGACGCCTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100982 GAACTTGGCGCTGGTCAGCCCGTGCGGCGGCGGCGCGGGGGACGCCTTG