seq1 = pF1KB7564.tfa, 825 bp
seq2 = pF1KB7564/gi568815578r_17924639.tfa (gi568815578r:17924639_18157634), 232996 bp

>pF1KB7564 825
>gi568815578r:17924639_18157634 (Chr20)

(complement)

1-100  (100001-100100)   100% ->
101-321  (100758-100978)   100% ->
322-511  (115912-116101)   100% ->
512-825  (132683-132996)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCAAAGTCTTCCTGGTGAAGAGGAGGAGCCTGGGGGTCTCGGTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCAAAGTCTTCCTGGTGAAGAGGAGGAGCCTGGGGGTCTCGGTCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCTGGGATGAGCTCCCGGATGAGAAAAGGGCAGACACCTACATCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGCTGGGATGAGCTCCCGGATGAGAAAAGGGCAGACACCTACATCCCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101          TGGGCCTAGGCCGCCTGCTCCACGACCCCCCCGAGGACTGC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTG...CAGTGGGCCTAGGCCGCCTGCTCCACGACCCCCCCGAGGACTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGCAGCGACGGCGGCAGCAGCAGCGGCAGCGGCAGCAGCAGCGCGGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100799 CGCAGCGACGGCGGCAGCAGCAGCGGCAGCGGCAGCAGCAGCGCGGGGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCCTGGAGGAGCAGAGAGCAGCTCGTCCCCGCACGCCCCCGAGAGCGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100849 GCCTGGAGGAGCAGAGAGCAGCTCGTCCCCGCACGCCCCCGAGAGCGAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCCCCGAGCCCGGCGACGCCGAGGGCCCCGATGGACACCTGGCGACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100899 CCCCCGAGCCCGGCGACGCCGAGGGCCCCGATGGACACCTGGCGACCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAGCGCCCGGTCGCCAGATCGAAAATCAAG         TTCACCACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100949 CAGCGCCCGGTCGCCAGATCGAAAATCAAGGTA...CAGTTCACCACAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CACGTGCAGCGACTCGGTGGTTCACAGCTGTGACCTGTGTGGCAAGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115923 CACGTGCAGCGACTCGGTGGTTCACAGCTGTGACCTGTGTGGCAAGGGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCCGTCTGCAGCGCATGCTGAACCGTCACCTCAAGTGCCACAACCAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115973 TCCGTCTGCAGCGCATGCTGAACCGTCACCTCAAGTGCCACAACCAGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAAAGACACCTGTGCACCTTCTGCGGCAAGGGCTTCAACGACACCTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116023 AAAAGACACCTGTGCACCTTCTGCGGCAAGGGCTTCAACGACACCTTCGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCTGAAGAGGCACGTCCGCACACACACAG         GCATTCGTCCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 116073 CCTGAAGAGGCACGTCCGCACACACACAGGTG...CAGGCATTCGTCCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACAAATGCAACGTCTGCAATAAAGCCTTCACCCAGCGCTGCTCTCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132695 ACAAATGCAACGTCTGCAATAAAGCCTTCACCCAGCGCTGCTCTCTGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TCCCACCTGAAGAAAATCCATGGGGTGCAGCAGCAGTATGCCTATAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132745 TCCCACCTGAAGAAAATCCATGGGGTGCAGCAGCAGTATGCCTATAAGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GCGGCGGGACAAGCTCTACGTCTGCGAGGATTGCGGCTACACGGGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132795 GCGGCGGGACAAGCTCTACGTCTGCGAGGATTGCGGCTACACGGGCCCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CCCAGGAGGACCTGTACCTGCACGTGAACAGTGCCCATCCGGGCAGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132845 CCCAGGAGGACCTGTACCTGCACGTGAACAGTGCCCATCCGGGCAGCTCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TTTCTCAAAAAGACATCTAAAAAACTGGCAGCCCTTCTGCAGGGCAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132895 TTTCTCAAAAAGACATCTAAAAAACTGGCAGCCCTTCTGCAGGGCAAGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GACATCCGCACACCAGGAGAATACCAGCCTGAGTGAGGAGGAGGAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132945 GACATCCGCACACCAGGAGAATACCAGCCTGAGTGAGGAGGAGGAGAGGA

    850 
    824 AG
        ||
 132995 AG