seq1 = pF1KB7557.tfa, 606 bp
seq2 = pF1KB7557/gi568815593f_160322313.tfa (gi568815593f:160322313_160528678), 206366 bp

>pF1KB7557 606
>gi568815593f:160322313_160528678 (Chr5)

1-91  (100001-100091)   100% ->
92-276  (100397-100581)   100% ->
277-370  (101925-102018)   100% ->
371-529  (105403-105561)   100% ->
530-606  (106290-106366)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTACTCTGATCTATGTTGATAAGGAAAATGGAGAACCAGGCACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTACTCTGATCTATGTTGATAAGGAAAATGGAGAACCAGGCACCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTGGTTGCTAAGGATGGGCTGAAGCTGGGGTCTGGACCTT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100051 TGTGGTTGCTAAGGATGGGCTGAAGCTGGGGTCTGGACCTTGTA...CAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAATCAAAGCCTTAGATGGGAGATCTCAAGTTTCAACACCACGTTTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100397 CAATCAAAGCCTTAGATGGGAGATCTCAAGTTTCAACACCACGTTTTGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAAACGTTCGATGCCCCACCAGCCTTACCTAAAGCTACTAGAAAGGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100447 AAAACGTTCGATGCCCCACCAGCCTTACCTAAAGCTACTAGAAAGGCTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGGAACTGTCAACAGAGCTACAGAAAAGTCTGTAAAGACCAAGGGACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100497 GGGAACTGTCAACAGAGCTACAGAAAAGTCTGTAAAGACCAAGGGACCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCAAACAAAAACAGCCAAGCTTTTCTGCCAAAAAG         ATGACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100547 TCAAACAAAAACAGCCAAGCTTTTCTGCCAAAAAGGTA...TAGATGACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGAAGACTGTTAAAGCAAAAAGCTCTGTTCCTGCCTCAGATGATGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101931 GAGAAGACTGTTAAAGCAAAAAGCTCTGTTCCTGCCTCAGATGATGCCTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCCAGAAATAGAAAAATTCTTTCCCTTCAATCCTCTAG         ACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 101981 TCCAGAAATAGAAAAATTCTTTCCCTTCAATCCTCTAGGTA...CAGACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTGAGAGTTTTGACCTGCCTGAAGAGCACCAGATTGCGCACCTCCCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105406 TTGAGAGTTTTGACCTGCCTGAAGAGCACCAGATTGCGCACCTCCCCTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGTGGAGTGCCTCTCATGATCCTTGACGAGGAGAGAGAGCTTGAAAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105456 AGTGGAGTGCCTCTCATGATCCTTGACGAGGAGAGAGAGCTTGAAAAGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTTTCAGCTGGGCCCCCCTTCACCTGTGAAGATGCCCTCTCCACCATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105506 GTTTCAGCTGGGCCCCCCTTCACCTGTGAAGATGCCCTCTCCACCATGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AATCCA         ATCTGTTGCAGTCTCCTTCAAGCATTCTGTCGACC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105556 AATCCAGTA...TAGATCTGTTGCAGTCTCCTTCAAGCATTCTGTCGACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTGGATGTTGAATTGCCACCTGTTTGCTGTGACATAGATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106325 CTGGATGTTGAATTGCCACCTGTTTGCTGTGACATAGATATT