seq1 = pF1KB7552.tfa, 804 bp
seq2 = pF1KB7552/gi568815590r_48818810.tfa (gi568815590r:48818810_49021265), 202456 bp

>pF1KB7552 804
>gi568815590r:48818810_49021265 (Chr8)

(complement)

1-79  (100001-100079)   100% ->
80-625  (100825-101370)   100% ->
626-804  (102278-102456)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGCGCTCCTTCCTGGTCAAGAAGCATTTCAACGCCTCCAAAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGCGCTCCTTCCTGGTCAAGAAGCATTTCAACGCCTCCAAAAAGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAACTACAGCGAACTGGACACACATACAG         TGATTATTTCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100051 AAACTACAGCGAACTGGACACACATACAGGTA...CAGTGATTATTTCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGTATCTCTATGAGAGTTACTCCATGCCTGTCATACCACAACCAGAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100837 CGTATCTCTATGAGAGTTACTCCATGCCTGTCATACCACAACCAGAGATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTCAGCTCAGGAGCATACAGCCCCATCACTGTGTGGACTACCGCTGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100887 CTCAGCTCAGGAGCATACAGCCCCATCACTGTGTGGACTACCGCTGCTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATTCCACGCCCAGCTACCCAATGGCCTCTCTCCTCTTTCCGGATACTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100937 ATTCCACGCCCAGCTACCCAATGGCCTCTCTCCTCTTTCCGGATACTCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CATCTTTGGGGCGAGTGAGTCCCCCTCCTCCATCTGACACCTCCTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100987 CATCTTTGGGGCGAGTGAGTCCCCCTCCTCCATCTGACACCTCCTCCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GACCACAGTGGCTCAGAAAGCCCCATTAGTGATGAAGAGGAAAGACTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101037 GACCACAGTGGCTCAGAAAGCCCCATTAGTGATGAAGAGGAAAGACTACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GTCCAAGCTTTCAGACCCCCATGCCATTGAAGCTGAAAAGTTTCAGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101087 GTCCAAGCTTTCAGACCCCCATGCCATTGAAGCTGAAAAGTTTCAGTGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ATTTATGCAATAAGACCTATTCAACTTTTTCTGGGCTGGCCAAACATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101137 ATTTATGCAATAAGACCTATTCAACTTTTTCTGGGCTGGCCAAACATAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CAGCTGCACTGCGATGCCCAGTCTAGAAAATCTTTCAGCTGTAAATACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101187 CAGCTGCACTGCGATGCCCAGTCTAGAAAATCTTTCAGCTGTAAATACTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGACAAGGAATATGTGAGCCTGGGCGCCCTGAAGATGCATATTCGGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101237 TGACAAGGAATATGTGAGCCTGGGCGCCCTGAAGATGCATATTCGGACCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ACACATTACCTTGTGTTTGCAAGATCTGCGGCAAGGCGTTTTCCAGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101287 ACACATTACCTTGTGTTTGCAAGATCTGCGGCAAGGCGTTTTCCAGACCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TGGTTGCTTCAAGGACACATTAGAACTCACACGG         GGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 101337 TGGTTGCTTCAAGGACACATTAGAACTCACACGGGTA...CAGGGGAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GCCTTTTTCTTGCCCTCACTGCAACAGAGCATTTGCAGACAGGTCAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102285 GCCTTTTTCTTGCCCTCACTGCAACAGAGCATTTGCAGACAGGTCAAATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TGAGGGCTCATCTGCAGACCCATTCTGATGTAAAGAAATACCAGTGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102335 TGAGGGCTCATCTGCAGACCCATTCTGATGTAAAGAAATACCAGTGCAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AACTGCTCCAAAACCTTCTCCAGAATGTCTCTCCTGCACAAACATGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102385 AACTGCTCCAAAACCTTCTCCAGAATGTCTCTCCTGCACAAACATGAGGA

    800     .    :    .    :
    783 ATCTGGCTGCTGTGTAGCACAC
        ||||||||||||||||||||||
 102435 ATCTGGCTGCTGTGTAGCACAC