seq1 = pF1KB7550.tfa, 801 bp
seq2 = pF1KB7550/gi568815587f_65687374.tfa (gi568815587f:65687374_65895338), 207965 bp

>pF1KB7550 801
>gi568815587f:65687374_65895338 (Chr11)

1-100  (100001-100100)   100% ->
101-318  (106658-106875)   100% ->
319-508  (107165-107354)   100% ->
509-801  (107673-107965)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCCGCGCGTTCCTGGTGAAGAAGCCGTGCGTCTCCACGTGCAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCCGCGCGTTCCTGGTGAAGAAGCCGTGCGTCTCCACGTGCAAGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAACTGGAGCGAGCTCCCCGACGAGGAGCGCGGCGAGATCTACGTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAACTGGAGCGAGCTCCCCGACGAGGAGCGCGGCGAGATCTACGTGCCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101          TCAGCCTGGGCTTCTGCCCACCACAGCCCTACCGGGAGCCG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTG...CAGTCAGCCTGGGCTTCTGCCCACCACAGCCCTACCGGGAGCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAACCCTCTGTGGCCGAACCCCCTTCCTGCCCGCTGGCTTTGAACATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106699 GAACCCTCTGTGGCCGAACCCCCTTCCTGCCCGCTGGCTTTGAACATGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCTTCGAGACTCTAGCTACAGCATGGCCCCCGGGCCCTGTGTGGTGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106749 CCTTCGAGACTCTAGCTACAGCATGGCCCCCGGGCCCTGTGTGGTGGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGCTGCCCTCTGAAGACATGGGCCACTTGACAGACCCCCAGAGCAGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106799 AGCTGCCCTCTGAAGACATGGGCCACTTGACAGACCCCCAGAGCAGAGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CATGGCTTCCTGCGCACCAAGATGAAG         GTGACCCTTGGGGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 106849 CATGGCTTCCTGCGCACCAAGATGAAGGTA...CAGGTGACCCTTGGGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAGTCCCAGTGGAGACCTGTTCACCTGCCGTGTCTGCCAGAAGGCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107179 CAGTCCCAGTGGAGACCTGTTCACCTGCCGTGTCTGCCAGAAGGCCTTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCTACCAGCGCATGCTGAACCGCCACATGAAGTGTCACAACGACGTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107229 CCTACCAGCGCATGCTGAACCGCCACATGAAGTGTCACAACGACGTCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AGGCACCTCTGCACGTACTGCGGGAAGGGCTTCAATGACACCTTCGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107279 AGGCACCTCTGCACGTACTGCGGGAAGGGCTTCAATGACACCTTCGACCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CAAGAGACACGTCCGAACTCACACTG         GCGTGCGGCCCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 107329 CAAGAGACACGTCCGAACTCACACTGGTA...CAGGCGTGCGGCCCTACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGTGCAGCCTGTGTGACAAGGCCTTCACGCAGCGCTGCTCTCTGGAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107688 AGTGCAGCCTGTGTGACAAGGCCTTCACGCAGCGCTGCTCTCTGGAGTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CACCTCAAGAAGATCCATGGTGTGCAGCAGAAGTACGCGTACAAGGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107738 CACCTCAAGAAGATCCATGGTGTGCAGCAGAAGTACGCGTACAAGGAGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GCGGGCCAAGCTGTACGTGTGTGAGGAGTGCGGCTGCACATCTGAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107788 GCGGGCCAAGCTGTACGTGTGTGAGGAGTGCGGCTGCACATCTGAGAGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGGAGGGCCACGTCCTGCACCTGAAGGAGCACCACCCTGACAGCCCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107838 AGGAGGGCCACGTCCTGCACCTGAAGGAGCACCACCCTGACAGCCCGCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CTGCGCAAGACCTCCAAGAAGGTGGCCGTGGCACTACAGAACACTGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107888 CTGCGCAAGACCTCCAAGAAGGTGGCCGTGGCACTACAGAACACTGTCAC

    800     .    :    .    :    .
    774 TTCCCTGCTGCAGGGCAGCCCCCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||
 107938 TTCCCTGCTGCAGGGCAGCCCCCACCTG