seq1 = pF1KB7547.tfa, 555 bp
seq2 = pF1KB7547/gi568815595r_57098200.tfa (gi568815595r:57098200_57299918), 201719 bp

>pF1KB7547 555
>gi568815595r:57098200_57299918 (Chr3)

(complement)

1-157  (100001-100157)   100% ->
158-357  (100967-101166)   100% ->
358-459  (101427-101528)   100% ->
460-555  (101624-101719)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTCCCAGCCTTCAGGAAGGCGCTCAGCTCGGGGAAAACAAACCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTCCCAGCCTTCAGGAAGGCGCTCAGCTCGGGGAAAACAAACCCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AACTTGCTCCTTTTCAATTGAGAGAATCTTAGGACTGGACCAGAAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AACTTGCTCCTTTTCAATTGAGAGAATCTTAGGACTGGACCAGAAGAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTGTGTTCCATTAATGAAACCCCACAGGCCCTGGGCAGACACCTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTGTGTTCCATTAATGAAACCCCACAGGCCCTGGGCAGACACCTGCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCATCAG         GGAAAGATGGTAACTTATGTCTACATGTCCCAAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCATCAGGTA...TAGGGAAAGATGGTAACTTATGTCTACATGTCCCAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCCTCCCAGTGGGATTTCATTCCCTAGCGTGGTGGATCACCCAATGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TCCTCCCAGTGGGATTTCATTCCCTAGCGTGGTGGATCACCCAATGCCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAGAAAGAGCTTCGAAATATGAAAATTACTTTTCAGCCTCAGAAAGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AAGAAAGAGCTTCGAAATATGAAAATTACTTTTCAGCCTCAGAAAGACTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCTTTGAAAAGAGAGTTGAGTTGGTATAGAGGCCGAAGACCAAGAACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TCTTTGAAAAGAGAGTTGAGTTGGTATAGAGGCCGAAGACCAAGAACTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TTTTACTCAAAACCAG         ATTGAAGTGTTAGAAAATGTCTTTA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 101151 TTTTACTCAAAACCAGGTG...TAGATTGAAGTGTTAGAAAATGTCTTTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GAGTAAACTGCTATCCTGGTATCGATATTAGAGAAGACTTAGCTCAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101452 GAGTAAACTGCTATCCTGGTATCGATATTAGAGAAGACTTAGCTCAAAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TTGAATCTAGAGGAAGACAGAATCCAG         ATTTGGTTTCAAAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 101502 TTGAATCTAGAGGAAGACAGAATCCAGGTA...TAGATTTGGTTTCAAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TCGGCGTGCAAAACTGAAAAGGTCCCATAGAGAATCACAGTTTCTAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101638 TCGGCGTGCAAAACTGAAAAGGTCCCATAGAGAATCACAGTTTCTAATGG

    550     .    :    .    :    .    :
    524 CGAAAAAAAATTTCAACACAAATCTGCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 101688 CGAAAAAAAATTTCAACACAAATCTGCTGGAA