seq1 = pF1KB7544.tfa, 786 bp
seq2 = pF1KB7544/gi568815579f_50322472.tfa (gi568815579f:50322472_50528333), 205862 bp

>pF1KB7544 786
>gi568815579f:50322472_50528333 (Chr19)

1-23  (96492-96514)   100% ->
24-51  (97475-97502)   100% ->
52-124  (100002-100074)   100% ->
125-339  (100352-100566)   99% ->
340-490  (101134-101284)   100% ->
491-786  (105567-105862)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTCGCCCTGGAGGCTGCACA         GCTCGACGGGCCACACTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
  96492 ATGCTCGCCCTGGAGGCTGCACAGTA...CAGGCTCGACGGGCCACACTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CAGCTGTCTG         TACCCAGATGGCGTCTTCTATGACCTGGACA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
  97493 CAGCTGTCTGGTG...CAGTACCCAGATGGCGTCTTCTATGACCTGGACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 GCTGCAAGCATTCCAGCTACCCTGATTCAGAGGGGGCTCCTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100033 GCTGCAAGCATTCCAGCTACCCTGATTCAGAGGGGGCTCCTGGTG...CA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    125  ACTCCCTGTGGGACTGGACTGTGGCCCCACCTGTCCCAGCCACCCCCTA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GACTCCCTGTGGGACTGGACTGTGGCCCCACCTGTCCCAGCCACCCCCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 TGAAGCCTTCGACCCGGCAGCAGCCGCTTTTAGCCACCCCCAGGCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGAAGCCTTCGACCCGGCAGCAGCCGCTTTTAGCCACCCCCAGGCTGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AGCTCTGCTACGAACCCCCCACCTACAGCCCTGCAGGGAACCTCGAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGCTCTGCTACGAACCCCCCACCTACAGCCCTGCAGGGAACCTCGAACTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GCCCCCAGCCTGGAGGCCCCGGGGCCTGGCCTCCCCGCATACCCCACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 100501 GCCCCCAGCCTGGAGGCCCCGGGGCCTGGCCTCCCTGCATACCCCACGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GAACTTCGCTAGCCAG         ACCCTGGTTCCCCCGGCATATGCCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100551 GAACTTCGCTAGCCAGGTG...CAGACCCTGGTTCCCCCGGCATATGCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CGTACCCCAGCCCTGTGCTATCAGAGGAGGAAGACTTACCGTTGGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101159 CGTACCCCAGCCCTGTGCTATCAGAGGAGGAAGACTTACCGTTGGACAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CCTGCCCTGGAGGTCTCGGACAGCGAGTCGGATGAGGCCCTCGTGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101209 CCTGCCCTGGAGGTCTCGGACAGCGAGTCGGATGAGGCCCTCGTGGCTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCCCGAGGGGAAGGGATCCGAGGCAG         GGACTCGCAAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 101259 CCCCGAGGGGAAGGGATCCGAGGCAGGTA...CAGGGACTCGCAAGAAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TGCGCCTGTACCAGTTCCTGCTGGGGCTACTGACGCGCGGGGACATGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105582 TGCGCCTGTACCAGTTCCTGCTGGGGCTACTGACGCGCGGGGACATGCGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAGTGCGTGTGGTGGGTGGAGCCAGGCGCCGGCGTCTTCCAGTTCTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105632 GAGTGCGTGTGGTGGGTGGAGCCAGGCGCCGGCGTCTTCCAGTTCTCCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CAAGCACAAGGAACTCCTGGCGCGCCGCTGGGGCCAGCAGAAGGGGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105682 CAAGCACAAGGAACTCCTGGCGCGCCGCTGGGGCCAGCAGAAGGGGAACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GCAAGCGCATGACCTACCAGAAGCTGGCGCGCGCCCTCCGAAACTACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105732 GCAAGCGCATGACCTACCAGAAGCTGGCGCGCGCCCTCCGAAACTACGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAGACCGGCGAGATCCGCAAGGTCAAGCGCAAGCTCACCTACCAGTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105782 AAGACCGGCGAGATCCGCAAGGTCAAGCGCAAGCTCACCTACCAGTTCGA

    800     .    :    .    :    .    :
    756 CAGCGCGCTGCTGCCTGCAGTCCGCCGGGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 105832 CAGCGCGCTGCTGCCTGCAGTCCGCCGGGCC