seq1 = pF1KB7525.tfa, 450 bp
seq2 = pF1KB7525/gi568815595f_184263493.tfa (gi568815595f:184263493_184468291), 204799 bp

>pF1KB7525 450
>gi568815595f:184263493_184468291 (Chr3)

1-73  (100001-100073)   100% ->
74-157  (101474-101557)   100% ->
158-251  (101641-101734)   100% ->
252-335  (103225-103308)   100% ->
336-450  (104685-104799)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGGCATCCTGTTTGAGGATATTTTCGATGTGAAGGATATTGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGGCATCCTGTTTGAGGATATTTTCGATGTGAAGGATATTGACCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGGGCAAGAAGTTTGACCGAG         TGTCTCGACTGCATTGTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100051 GGAGGGCAAGAAGTTTGACCGAGGTA...CAGTGTCTCGACTGCATTGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGAGTGAATCTTTCAAGATGGATCTAATCTTAGATGTAAACATTCAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101492 AGAGTGAATCTTTCAAGATGGATCTAATCTTAGATGTAAACATTCAAATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TACCCTGTAGACTTGG         GTGACAAGTTTCGGTTGGTCATAGC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 101542 TACCCTGTAGACTTGGGTA...CAGGTGACAAGTTTCGGTTGGTCATAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TAGTACCTTGTATGAAGATGGTACCCTGGATGATGGTGAATACAACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101666 TAGTACCTTGTATGAAGATGGTACCCTGGATGATGGTGAATACAACCCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTGATGATAGGCCTTCCAG         GGCTGACCAGTTTGAGTATGTA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 101716 CTGATGATAGGCCTTCCAGGTG...TAGGGCTGACCAGTTTGAGTATGTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ATGTATGGAAAAGTGTACAGGATTGAGGGAGATGAAACTTCTACTGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103247 ATGTATGGAAAAGTGTACAGGATTGAGGGAGATGAAACTTCTACTGAAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGCAACACGCCT         CTCTGCGTACGTGTCCTATGGGGGCCTGC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103297 AGCAACACGCCTGTA...CAGCTCTGCGTACGTGTCCTATGGGGGCCTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TCATGAGGCTGCAGGGGGATGCCAACAACCTGCATGGATTCGAGGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104714 TCATGAGGCTGCAGGGGGATGCCAACAACCTGCATGGATTCGAGGTGGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .
    415 TCCAGAGTTTATCTCCTGATGAAGAAGCTAGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104764 TCCAGAGTTTATCTCCTGATGAAGAAGCTAGCCTTC