seq1 = pF1KB7524.tfa, 747 bp
seq2 = pF1KB7524/gi568815586r_6551198.tfa (gi568815586r:6551198_6763101), 211904 bp

>pF1KB7524 747
>gi568815586r:6551198_6763101 (Chr12)

(complement)

1-37  (100001-100037)   100% ->
38-109  (106304-106375)   100% ->
110-276  (109706-109872)   100% ->
277-391  (110052-110166)   100% ->
392-500  (110332-110440)   100% ->
501-648  (110684-110831)   100% ->
649-710  (111717-111778)   100% ->
711-747  (111868-111904)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCGGGGATGTATTTGGAACATTATCTGGACA         GTAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100001 ATGGCTGCGGGGATGTATTTGGAACATTATCTGGACAGTA...TAGGTAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGAAAACCTTCCCTTTGAATTACAGAGAAACTTTCAGCTCATGAGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106308 TGAAAACCTTCCCTTTGAATTACAGAGAAACTTTCAGCTCATGAGGGACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TAGACCAAAGAACAGAGG         ACCTGAAGGCTGAAATTGACAAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 106358 TAGACCAAAGAACAGAGGGTA...TAGACCTGAAGGCTGAAATTGACAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TTGGCCACTGAGTATATGAGTAGTGCCCGCAGCCTGAGCTCCGAGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109729 TTGGCCACTGAGTATATGAGTAGTGCCCGCAGCCTGAGCTCCGAGGAAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 ATTGGCCCTTCTCAAACAGATCCAGGAAGCCTATGGCAAGTGCAAGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109779 ATTGGCCCTTCTCAAACAGATCCAGGAAGCCTATGGCAAGTGCAAGGAAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGGTGACGACAAGGTGCAGCTTGCCATGCAGACCTATGAGATG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 109829 TTGGTGACGACAAGGTGCAGCTTGCCATGCAGACCTATGAGATGGTA...

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    277    GTGGACAAACACATTCGGCGGCTGGACACAGACCTGGCCCGTTTTGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110049 CAGGTGGACAAACACATTCGGCGGCTGGACACAGACCTGGCCCGTTTTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGCTGATCTCAAGGAGAAACAGATTGAGTCAAGTGACTATGACAGCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110099 GGCTGATCTCAAGGAGAAACAGATTGAGTCAAGTGACTATGACAGCTCTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCAGCAAAGGCAAAAAGA         AAGGCCGGACTCAAAAGGAGAAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 110149 CCAGCAAAGGCAAAAAGAGTG...TAGAAGGCCGGACTCAAAAGGAGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAAGCTGCTCGTGCTCGTTCCAAAGGGAAAAACTCGGATGAAGAAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110355 AAAGCTGCTCGTGCTCGTTCCAAAGGGAAAAACTCGGATGAAGAAGCCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CAAGACTGCCCAGAAGAAGTTAAAGCTCGTGCGCAC         AAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 110405 CAAGACTGCCCAGAAGAAGTTAAAGCTCGTGCGCACGTG...CAGAAGTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CTGAGTATGGGATGCCCTCAGTGACCTTTGGCAGTGTCCACCCCTCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110689 CTGAGTATGGGATGCCCTCAGTGACCTTTGGCAGTGTCCACCCCTCTGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GTGTTGGATATGCCTGTGGATCCCAACGAACCCACCTATTGCCTTTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110739 GTGTTGGATATGCCTGTGGATCCCAACGAACCCACCTATTGCCTTTGTCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CCAGGTCTCCTATGGAGAGATGATTGGCTGTGACAACCCTGAT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 110789 CCAGGTCTCCTATGGAGAGATGATTGGCTGTGACAACCCTGATGTG...C

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    649   TGTTCCATTGAGTGGTTCCATTTTGCCTGTGTGGGGCTGACAACCAAG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111715 AGTGTTCCATTGAGTGGTTCCATTTTGCCTGTGTGGGGCTGACAACCAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CCTCGGGGGAAATG         GTTTTGCCCACGCTGCTCCCAAGAACG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 111765 CCTCGGGGGAAATGGTA...CAGGTTTTGCCCACGCTGCTCCCAAGAACG

    800     .    :
    738 GAAGAAGAAA
        ||||||||||
 111895 GAAGAAGAAA