seq1 = pF1KB7521.tfa, 432 bp
seq2 = pF1KB7521/gi568815586f_26922580.tfa (gi568815586f:26922580_27128458), 205879 bp

>pF1KB7521 432
>gi568815586f:26922580_27128458 (Chr12)

1-42  (100001-100042)   100% ->
43-157  (103841-103955)   100% ->
158-258  (104768-104868)   100% ->
259-432  (105706-105879)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGATCGGCTCACGCAGCTTCAGGACGCTGTGAATTCG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100001 ATGGCGGATCGGCTCACGCAGCTTCAGGACGCTGTGAATTCGGTG...AA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     43  CTTGCAGATCAGTTTTGTAATGCCATTGGAGTATTGCAGCAATGTGGTC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103840 GCTTGCAGATCAGTTTTGTAATGCCATTGGAGTATTGCAGCAATGTGGTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTCCTGCCTCTTTCAATAATATTCAGACAGCAATTAACAAAGACCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103890 CTCCTGCCTCTTTCAATAATATTCAGACAGCAATTAACAAAGACCAGCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCTAACCCTACAGAAG         AGTATGCCCAGCTTTTTGCAGCACT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 103940 GCTAACCCTACAGAAGGTA...TAGAGTATGCCCAGCTTTTTGCAGCACT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GATTGCACGAACAGCAAAAGACATTGATGTTTTGATAGATTCCTTACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104793 GATTGCACGAACAGCAAAAGACATTGATGTTTTGATAGATTCCTTACCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTGAAGAATCTACAGCTGCTTTACAG         GCTGCTAGCTTGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 104843 GTGAAGAATCTACAGCTGCTTTACAGGTA...AAGGCTGCTAGCTTGTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAGCTAGAAGAAGAAAACCATGAAGCTGCTACATGTCTGGAGGATGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105721 AAGCTAGAAGAAGAAAACCATGAAGCTGCTACATGTCTGGAGGATGTTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TTATCGAGGAGACATGCTTCTGGAGAAGATACAAAGCGCACTTGCTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105771 TTATCGAGGAGACATGCTTCTGGAGAAGATACAAAGCGCACTTGCTGATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTGCACAGTCACAGCTGAAGACAAGAAGTGGTACCCATAGCCAGTCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105821 TTGCACAGTCACAGCTGAAGACAAGAAGTGGTACCCATAGCCAGTCTCTT

    450     .
    424 CCAGACTCA
        |||||||||
 105871 CCAGACTCA