seq1 = pF1KB7514.tfa, 735 bp
seq2 = pF1KB7514/gi568815576f_34967088.tfa (gi568815576f:34967088_35185690), 218603 bp

>pF1KB7514 735
>gi568815576f:34967088_35185690 (Chr22)

1-229  (100001-100229)   100% ->
230-381  (115431-115582)   100% ->
382-498  (117296-117412)   100% ->
499-735  (118367-118603)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGTGCTGAGGTGGGCCCTGCTCTCTGCAGGGGTATGGAGAGAAATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGTGCTGAGGTGGGCCCTGCTCTCTGCAGGGGTATGGAGAGAAATAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTGGGGTGCTGTGAGGCCCCGAAGAAGCTGAGCCTGTCCTTCTCCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTGGGGTGCTGTGAGGCCCCGAAGAAGCTGAGCCTGTCCTTCTCCATTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGCGATCCTAAAGAGGCCTGCCAGGAGGAGTGATATGGACAGACCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGCGATCCTAAAGAGGCCTGCCAGGAGGAGTGATATGGACAGACCAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGGCCAGGTGAAGAGGGCCCCGGAGAAGCTGCGGCCTCAGGCTCTGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGGCCAGGTGAAGAGGGCCCCGGAGAAGCTGCGGCCTCAGGCTCTGGGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGAAAAGCCTCCAAAGGACCAGCCCCAGG         AAGGAAGGAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100201 AGAAAAGCCTCCAAAGGACCAGCCCCAGGGTA...CAGAAGGAAGGAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCAAGCGGAGGGTTCGTACCACCTTCACCACTGAGCAGCTGCATGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115443 GCAAGCGGAGGGTTCGTACCACCTTCACCACTGAGCAGCTGCATGAGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAGAAGATCTTCCACTTTACCCACTACCCAGACGTTCACATCCGCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115493 GAGAAGATCTTCCACTTTACCCACTACCCAGACGTTCACATCCGCAGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCTGGCAGCCAGGATCAACCTCCCAGAAGCTCGGGTGCAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 115543 GCTGGCAGCCAGGATCAACCTCCCAGAAGCTCGGGTGCAGGTA...CAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCTGGTTCCAGAATCAGCGAGCCAAGTGGCGGAAGCAGGAGAAGATTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117297 TCTGGTTCCAGAATCAGCGAGCCAAGTGGCGGAAGCAGGAGAAGATTGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AACCTGGGGGCTCCACAGCAGCTGAGTGAAGCCAGTGTGGCCCTGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117347 AACCTGGGGGCTCCACAGCAGCTGAGTGAAGCCAGTGTGGCCCTGCCCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AAATCTGGATGTGGCT         GGGCCCACGTGGACATCCACTGCTC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 117397 AAATCTGGATGTGGCTGTA...CAGGGGCCCACGTGGACATCCACTGCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGCGCAGGCTGGCTCCTCCCACGAGCTGTTGTCCATCGGCTCAAGATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118392 TGCGCAGGCTGGCTCCTCCCACGAGCTGTTGTCCATCGGCTCAAGATCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTGGCCTCTGCCTGGTTCCCTGCCTGGATCACCCTCCTCCCAGCGCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118442 CTGGCCTCTGCCTGGTTCCCTGCCTGGATCACCCTCCTCCCAGCGCACCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 ATGGGAAACACAGCCTGTCCCAGGTCTTCCCATCCATCAAACTTGCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118492 ATGGGAAACACAGCCTGTCCCAGGTCTTCCCATCCATCAAACTTGCATCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CTGTGCTATGCATCCTTCCACCTCCACACCCCAAATGGGGCAGCATCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118542 CTGTGCTATGCATCCTTCCACCTCCACACCCCAAATGGGGCAGCATCTGT

    750     .    :
    724 GCTACTTCAACA
        ||||||||||||
 118592 GCTACTTCAACA