seq1 = pF1KB7510.tfa, 726 bp
seq2 = pF1KB7510/gi568815587f_20264238.tfa (gi568815587f:20264238_20483202), 218965 bp

>pF1KB7510 726
>gi568815587f:20264238_20483202 (Chr11)

1-195  (100001-100195)   100% ->
196-303  (102937-103044)   100% ->
304-441  (112343-112480)   100% ->
442-503  (117941-118002)   100% ->
504-726  (118743-118965)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGAAACAGAAGCCCTGTCGAAGCTTCGGGAAGACTTCAGGATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGAAACAGAAGCCCTGTCGAAGCTTCGGGAAGACTTCAGGATGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAATAAATCCGTCTTTATTTTGGGCGCCAGCGGAGAAACCGGCAGAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAATAAATCCGTCTTTATTTTGGGCGCCAGCGGAGAAACCGGCAGAGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTTAAAGGAAATCCTGGAGCAGGGCCTGTTTTCCAAAGTCACGCTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTTAAAGGAAATCCTGGAGCAGGGCCTGTTTTCCAAAGTCACGCTCATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCCGGAGGAAGCTCACCTTCGACGAGGAAGCTTATAAAAATGTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100151 GGCCGGAGGAAGCTCACCTTCGACGAGGAAGCTTATAAAAATGTGGTG..

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    196     AATCAAGAAGTGGTGGACTTTGAAAAGTTGGATGACTACGCCTCTG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 .TAGAATCAAGAAGTGGTGGACTTTGAAAAGTTGGATGACTACGCCTCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCTTTCAAGGTCATGATGTTGGATTCTGTTGCCTGGGTACCACCAGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102983 CCTTTCAAGGTCATGATGTTGGATTCTGTTGCCTGGGTACCACCAGAGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAAGCTGGGGCG         GAGGGATTTGTTCGTGTTGACCGAGATTA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103033 AAAGCTGGGGCGGTA...TAGGAGGGATTTGTTCGTGTTGACCGAGATTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGTGCTGAAGTCTGCAGAGCTGGCAAAAGCTGGAGGGTGCAAACATTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112372 TGTGCTGAAGTCTGCAGAGCTGGCAAAAGCTGGAGGGTGCAAACATTTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACTTGCTATCCTCTAAAGGAGCTGATAAATCAAGCAATTTTTTATATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112422 ACTTGCTATCCTCTAAAGGAGCTGATAAATCAAGCAATTTTTTATATCTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CAAGTTAAG         GGAGAAGTAGAAGCCAAGGTTGAAGAATTAAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 112472 CAAGTTAAGGTT...TAGGGAGAAGTAGAAGCCAAGGTTGAAGAATTAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ATTTGATCGTTACTCTGTATTTAGGCCTGG         AGTTCTGTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 117973 ATTTGATCGTTACTCTGTATTTAGGCCTGGGTA...TAGAGTTCTGTTAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GTGATAGGCAAGAATCTCGCCCAGGTGAATGGCTGGTTAGAAAGTTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118754 GTGATAGGCAAGAATCTCGCCCAGGTGAATGGCTGGTTAGAAAGTTCTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GGCTCCTTACCAGACTCTTGGGCCAGGGGGCATTCTGTGCCTGTGGTGAC
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 118804 GGCTCCTTACCAGACTCTTGGGCCAGTGGGCATTCTGTGCCTGTGGTGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CGTGGTTAGAGCAATGCTGAACAATGTGGTGAGACCAAGAGACAAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118854 CGTGGTTAGAGCAATGCTGAACAATGTGGTGAGACCAAGAGACAAGCAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGGAACTGCTGGAGAACAAGGCCATCCATGACCTGGGGAAAGCGCATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118904 TGGAACTGCTGGAGAACAAGGCCATCCATGACCTGGGGAAAGCGCATGGC

    750     .    :
    715 TCTCTCAAGCCA
        ||||||||||||
 118954 TCTCTCAAGCCA