seq1 = pF1KB7509.tfa, 336 bp
seq2 = pF1KB7509/gi568815583f_41457027.tfa (gi568815583f:41457027_41657430), 200404 bp

>pF1KB7509 336
>gi568815583f:41457027_41657430 (Chr15)

1-148  (100001-100150)   97% ->
149-336  (100217-100404)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGGAGAGGAGAAAACCTATGGTGGCTGTGAAGGACCTGATGCCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| 
 100001 ATGGATGGAGAGGAGAAAACCTATGGTGGCTGTGAAGGCCCTGATGCCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTATGTCAAATTGATATCATCTGATGGCCATGAATTTATTGTAAAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTATGTCAAATTGATATCATCTGATGGCCATGAATTTATTGTAAAAAGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AACATGCATTAACATCAGGCACGATAAAAGCCATGTTGAGTGGCCCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--
 100101 AACATGCATTAACATCAGGCACGATAAAAGCCATGTTGAGTGGCCCAGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    149          GTCAGTTTGCTGAGAACGAAACCAATGAGGTCAATTTTAGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTT...GAGGTCAGTTTGCTGAGAACGAAACCAATGAGGTCAATTTTAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    190 GAGATACCTTCACATGTGCTATCGAAAGTATGCATGTATTTTACGTACAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 100258 GAGATACCTTCACATGTGCTATCGAAAGTATGCATGTATTTTACCTACAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    240 GGTTCGCTACACTAACAGCTCCACCGAGATTCCTGAATTCCCAATTGCAC
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 100308 GGTTCGCTACACTAACAGCTCCATCGAGATTCCTGAATTCCCAATTGCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    290 CTGAAATTGCACTGGAACTGCTGATGGCTGCGAACTTCTTAGATTGT
        ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100358 CTGAAATTGTACTAGAACTGCTGATGGCTGCGAACTTCCTAGATTGT