seq1 = pF1KB7449.tfa, 564 bp
seq2 = pF1KB7449/gi568815575f_52524998.tfa (gi568815575f:52524998_52860438), 335441 bp

>pF1KB7449 564
>gi568815575f:52524998_52860438 (ChrX)

1-69  (100001-100069)   98% ->
70-184  (100505-100619)   93% ->
185-280  (101295-101390)   85% ->
281-330  (103251-103300)   100% ->
331-466  (105274-105410)   90% ->
467-564  (107794-107891)   94%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACGGAGACGACGCCTTTGCAAAGAGACCCAGGGATGATGCTAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 100001 ATGAACGGAGACGACGCCTTTGCAAAGAGACCCAGGGATGATGATAAAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCAGAGAAGAGAAGCAAG         GCCTTCGATGATATTGCCAAAT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>|||||| |||||||||||| ||
 100051 ATCAGAGAAGAGAAGCAAGGTG...TAGGCCTTCAATGATATTGCCACAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACTTCTCTAAGGAAGAGTGGGAAAAGATGAAATTCTCGGAGAAAATCAGC
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 100527 ACTTCTCTAAGAAAGAGTGGGAAAAGATGAAATACTCGGAGAAAATCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGTGTGCATATGAAGAGAAAGTATGAGGCCATGACTAAACTAG       
        | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||>>>...>
 100577 TATGTGTATATGAAGAGAAACTATGAGGCCATGACTAAACTAGGTA...T

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    185   GTTTCAACGTCACCCTCTCACTTTTCATGCGTAATAAACGGGCCACAG
        >>||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||
 101293 AGGTTTCAATGTCACCCTCCCACCTTTCATGTGTAATAAACAGGCCACAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACT CTCAGAGGAATGATTCTGATAATGACCGTAACCGTGGGAATGAGG 
        |||-|-||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||| | |||>
 101343 ACTTC CAGGGGAATTATTTTGATAATGACCGTAACCGCAGGATTCAGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    281         TTGAACGTCCTCAGATGACTTTTGGCAGGCTCCAGAGAATCA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101392 TG...CAGTTGAACGTCCTCAGATGACTTTTGGCAGGCTCCAGAGAATCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    323 TCCCGAAG         ATCATGCCCGAGAAGCCAGCAGAGGAAGGAAGT
        ||||||||>>>...>>>||||||||| ||||||||||||||||||||| |
 103293 TCCCGAAGGTG...AAGATCATGCCCAAGAAGCCAGCAGAGGAAGGAAAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    364 GATTCGAAGGGAGTGCCAGAAGCATCTGGCCCACAGAACGATGGGAAAAA
        ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
 105307 GATTCGAAGGGAGTGTCAGAAGCATCTGGCCCACAGAACGATGGGAAACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    414 GCTGTGCC CGCCGGGAAAAGCAAGTAGCTCTGAGAAGATTCACGAGAGA
        |||| |||-| ||||||||||||| ||  |||||||||||| |  |||||
 105357 GCTGCGCCGCCCCGGGAAAAGCAAATACTTCTGAGAAGATTAATAAGAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    463 TCTG         GACCCAAAAGGGGGAAACATGCCTGGACCCACAGACT
        ||||>>>...>>>||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 105407 TCTGGTA...TAGGACCCAAAAGGGGGAGACATGCCTGGACCCACAGACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    504 GCGTGAGAGAAAGCAGCTGGTGATTTATGAAGAGATCAGCGACCCTGAGG
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 107831 GCGTGAGAGAAACCAGCTGGTGATTTATGAAGAGATCAGAGACCCTGAGG

    600     .    :
    554 AAGATGACAAG
        |||||||  ||
 107881 AAGATGATGAG