seq1 = pF1KB7449.tfa, 564 bp
seq2 = pF1KB7449/gi568815575f_48009980.tfa (gi568815575f:48009980_48219631), 209652 bp

>pF1KB7449 564
>gi568815575f:48009980_48219631 (ChrX)

1-69  (100001-100069)   100% ->
70-184  (100504-100618)   100% ->
185-280  (101281-101376)   100% ->
281-330  (103214-103263)   100% ->
331-466  (107033-107168)   100% ->
467-564  (109555-109652)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACGGAGACGACGCCTTTGCAAAGAGACCCAGGGATGATGCTAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACGGAGACGACGCCTTTGCAAAGAGACCCAGGGATGATGCTAAAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCAGAGAAGAGAAGCAAG         GCCTTCGATGATATTGCCAAAT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100051 ATCAGAGAAGAGAAGCAAGGTG...TAGGCCTTCGATGATATTGCCAAAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACTTCTCTAAGGAAGAGTGGGAAAAGATGAAATTCTCGGAGAAAATCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100526 ACTTCTCTAAGGAAGAGTGGGAAAAGATGAAATTCTCGGAGAAAATCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGTGTGCATATGAAGAGAAAGTATGAGGCCATGACTAAACTAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100576 TGTGTGCATATGAAGAGAAAGTATGAGGCCATGACTAAACTAGGTA...T

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    185   GTTTCAACGTCACCCTCTCACTTTTCATGCGTAATAAACGGGCCACAG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101279 AGGTTTCAACGTCACCCTCTCACTTTTCATGCGTAATAAACGGGCCACAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACTCTCAGAGGAATGATTCTGATAATGACCGTAACCGTGGGAATGAGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 101329 ACTCTCAGAGGAATGATTCTGATAATGACCGTAACCGTGGGAATGAGGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    281        TTGAACGTCCTCAGATGACTTTTGGCAGGCTCCAGAGAATCAT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101379 G...CAGTTGAACGTCCTCAGATGACTTTTGGCAGGCTCCAGAGAATCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCCGAAG         ATCATGCCCGAGAAGCCAGCAGAGGAAGGAAGTG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103257 CCCGAAGGTG...AAGATCATGCCCGAGAAGCCAGCAGAGGAAGGAAGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ATTCGAAGGGAGTGCCAGAAGCATCTGGCCCACAGAACGATGGGAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107067 ATTCGAAGGGAGTGCCAGAAGCATCTGGCCCACAGAACGATGGGAAAAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTGTGCCCGCCGGGAAAAGCAAGTAGCTCTGAGAAGATTCACGAGAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107117 CTGTGCCCGCCGGGAAAAGCAAGTAGCTCTGAGAAGATTCACGAGAGATC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TG         GACCCAAAAGGGGGAAACATGCCTGGACCCACAGACTGC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107167 TGGTA...TAGGACCCAAAAGGGGGAAACATGCCTGGACCCACAGACTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GTGAGAGAAAGCAGCTGGTGATTTATGAAGAGATCAGCGACCCTGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109594 GTGAGAGAAAGCAGCTGGTGATTTATGAAGAGATCAGCGACCCTGAGGAA

    600     .
    556 GATGACAAG
        |||||||||
 109644 GATGACAAG