seq1 = pF1KB7447.tfa, 816 bp
seq2 = pF1KB7447/gi568815594r_163428751.tfa (gi568815594r:163428751_163713504), 284754 bp

>pF1KB7447 816
>gi568815594r:163428751_163713504 (Chr4)

(complement)

1-191  (100001-100191)   100% ->
192-372  (127576-127756)   100% ->
373-520  (167762-167909)   100% ->
521-816  (184459-184754)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCAGCAGCCACGTTTGTTGTAATTTTTTAAATATGTGGAAAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCAGCAGCCACGTTTGTTGTAATTTTTTAAATATGTGGAAAAAAAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAGATATCAACCATGTATTACCTTAACCAAGATGCCAAATTATCTAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAGATATCAACCATGTATTACCTTAACCAAGATGCCAAATTATCTAACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTTTCTCCAGGCAAGCAGCCCAACAACAGGGACAGCTCCCAGGAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTTTCTCCAGGCAAGCAGCCCAACAACAGGGACAGCTCCCAGGAGCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCAAGGTTGTCTGTCTGTCCATCCACTCAGGACATCTGCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100151 TCAAGGTTGTCTGTCTGTCCATCCACTCAGGACATCTGCAGGTA...CAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AATCTGTCACTGCGAAGGGGATGAAGAGAGCCCCCTCATCACACCCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127576 AATCTGTCACTGCGAAGGGGATGAAGAGAGCCCCCTCATCACACCCTGTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCTGCACTGGGACACTGCGCTTTGTCCACCAGTCCTGCCTCCACCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127626 GCTGCACTGGGACACTGCGCTTTGTCCACCAGTCCTGCCTCCACCAGTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATAAAGAGCTCAGATACACGCTGCTGTGAGCTCTGCAAGTATGACTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127676 ATAAAGAGCTCAGATACACGCTGCTGTGAGCTCTGCAAGTATGACTTCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AATGGAGACCAAGCTCAAACCCCTCCGGAAG         TGGGAGAAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 127726 AATGGAGACCAAGCTCAAACCCCTCCGGAAGGTA...CAGTGGGAGAAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TACAGATGACCACAAGTGAAAGGAGGAAAATATTCTGCTCTGTCACATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167772 TACAGATGACCACAAGTGAAAGGAGGAAAATATTCTGCTCTGTCACATTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CACGTAATCGCGATCACCTGTGTGGTTTGGTCTTTGTATGTATTGATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167822 CACGTAATCGCGATCACCTGTGTGGTTTGGTCTTTGTATGTATTGATAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCGGACAGCGGAGGAAATCAAGCAAGGCAATGACAATG         GTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 167872 CCGGACAGCGGAGGAAATCAAGCAAGGCAATGACAATGGTA...AAGGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCCTTGAATGGCCATTTTGGACAAAACTGGTTGTGGTAGCCATTGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184462 TCCTTGAATGGCCATTTTGGACAAAACTGGTTGTGGTAGCCATTGGCTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ACAGGAGGTCTTGTCTTCATGTACGTACAGTGTAAAGTCTATGTTCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184512 ACAGGAGGTCTTGTCTTCATGTACGTACAGTGTAAAGTCTATGTTCAGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GTGGCGCAGGCTGAAGGCCTACAACCGTGTGATCTTTGTACAAAATTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184562 GTGGCGCAGGCTGAAGGCCTACAACCGTGTGATCTTTGTACAAAATTGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CAGACACTGCCAAAAAACTGGAGAAGAACTTCTCATGTAATGTAAACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184612 CAGACACTGCCAAAAAACTGGAGAAGAACTTCTCATGTAATGTAAACACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GACATCAAAGATGCTGTGGTAGTGCCTGTACCACAAACAGGTGCAAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184662 GACATCAAAGATGCTGTGGTAGTGCCTGTACCACAAACAGGTGCAAATTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :
    774 ACTGCCATCTGCAGAGGGTGGCCCCCCTGAAGTTGTATCAGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184712 ACTGCCATCTGCAGAGGGTGGCCCCCCTGAAGTTGTATCAGTC