seq1 = pF1KB7446.tfa, 933 bp
seq2 = pF1KB7446/gi568815586f_55231701.tfa (gi568815586f:55231701_55432633), 200933 bp

>pF1KB7446 933
>gi568815586f:55231701_55432633 (Chr12)

1-933  (100001-100933)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACCACACAATGGTCACAGAGTTTGTCCTCCTGGGCCTTTCTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACCACACAATGGTCACAGAGTTTGTCCTCCTGGGCCTTTCTGATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCCTGACCTTCAGATTGTGATTTTTCTCTTTTTATTTATCACGTATATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCCTGACCTTCAGATTGTGATTTTTCTCTTTTTATTTATCACGTATATAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TAAGTGTTACTGGAAACCTGACTATCATCACCCTAACCTTTGTGGACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TAAGTGTTACTGGAAACCTGACTATCATCACCCTAACCTTTGTGGACTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CATCTGCAGACACCTATGTATTTCTTCCTCCGGAACTTCTCTTTCTTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CATCTGCAGACACCTATGTATTTCTTCCTCCGGAACTTCTCTTTCTTAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AATCTCATTTACAACCGTATGCATCCCCAGATTTCTGGGGGCAATTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AATCTCATTTACAACCGTATGCATCCCCAGATTTCTGGGGGCAATTATCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCAGGAATAAGACTATTTCCTATAACAACTGTGCAGCCCAACTCTTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCAGGAATAAGACTATTTCCTATAACAACTGTGCAGCCCAACTCTTTTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTTATCTTCATGGGGGTGACTGAATTTTACATTTTAACTGCCATGTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTTATCTTCATGGGGGTGACTGAATTTTACATTTTAACTGCCATGTCCTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGACCGCTATGTTGCCATCTGCAAGCCCCTTCATTACACATCCATCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGACCGCTATGTTGCCATCTGCAAGCCCCTTCATTACACATCCATCATGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACAGGAAACTCTGCACTCTACTTGTGCTGTGTGCCTGGCTAAGTGGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACAGGAAACTCTGCACTCTACTTGTGCTGTGTGCCTGGCTAAGTGGGTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGACCATTTTCCCACCCCTTATGCTTCTCCTCCAGCTGGATTACTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGACCATTTTCCCACCCCTTATGCTTCTCCTCCAGCTGGATTACTGTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTCCAACGTCATTGATCACTTTGCATGTGACTATTTTCCCCTCTTACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTCCAACGTCATTGATCACTTTGCATGTGACTATTTTCCCCTCTTACAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TATCTTGTTCAGATACATGGCTCCTAGAAGTAATTGGTTTTTACTTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TATCTTGTTCAGATACATGGCTCCTAGAAGTAATTGGTTTTTACTTTGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTGGTTACTTTGCTGTTCACTTTGGCATTAGTGATTTTATCTTACATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTGGTTACTTTGCTGTTCACTTTGGCATTAGTGATTTTATCTTACATGTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CATTATCAGGACCATTTTGAGAATCCCGTCTGCCAGTCAAAGAAAAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CATTATCAGGACCATTTTGAGAATCCCGTCTGCCAGTCAAAGAAAAAAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTTTCTCCACTTGTTCTTCTCACATGATTGTCATTTCCATTTCTTATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CTTTCTCCACTTGTTCTTCTCACATGATTGTCATTTCCATTTCTTATGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AGCTGTATATTCATGTATGCTAATCCATCTGCAAAAGAAAAGGCATCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AGCTGTATATTCATGTATGCTAATCCATCTGCAAAAGAAAAGGCATCATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GACAAAAGGAATAGCTATTCTCAATACATCTGTTGCCCCCATGCTGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GACAAAAGGAATAGCTATTCTCAATACATCTGTTGCCCCCATGCTGAACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCTTCATTTACACTCTGAGAAACCAGCAAGTAAAACAAGCCTTCAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCTTCATTTACACTCTGAGAAACCAGCAAGTAAAACAAGCCTTCAAAAAT

    900     .    :    .    :    .    :
    901 GTGGTCCACAAAGTTGTGTTTTATGCAAATCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GTGGTCCACAAAGTTGTGTTTTATGCAAATCAA