seq1 = pF1KB7445.tfa, 1494 bp
seq2 = pF1KB7445/gi568815590f_43192485.tfa (gi568815590f:43192485_43456892), 264408 bp

>pF1KB7445 1494
>gi568815590f:43192485_43456892 (Chr8)

1-299  (100001-100299)   100% ->
300-414  (104536-104650)   100% ->
415-588  (104802-104975)   100% ->
589-695  (108034-108140)   100% ->
696-833  (109489-109626)   100% ->
834-904  (112215-112285)   100% ->
905-975  (123407-123477)   100% ->
976-1020  (124870-124914)   100% ->
1021-1187  (125972-126138)   100% ->
1188-1218  (149395-149425)   100% ->
1219-1360  (149703-149844)   100% ->
1361-1494  (164275-164408)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGGCTGAGGTTTCTCCAAAGCTGGCTGCCTCCCCTATGAAGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGGCTGAGGTTTCTCCAAAGCTGGCTGCCTCCCCTATGAAGAAGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTTGGCTTCAGGGGCAAGATGGGCAAGTGGTGCTGCTGCTGCTTCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTTGGCTTCAGGGGCAAGATGGGCAAGTGGTGCTGCTGCTGCTTCCCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTGCAGGGGAAGCGGCAAGAACAACATGGGTGCTTGGAGAGACCACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTGCAGGGGAAGCGGCAAGAACAACATGGGTGCTTGGAGAGACCACGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACAGCGCCTTCACGGAGCCAAGGTATCACGTCCGTCGAGAAGATCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACAGCGCCTTCACGGAGCCAAGGTATCACGTCCGTCGAGAAGATCTGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAAGCTCCACAGAGCTGCCTGGTGGGGTGAAGTCCCCAGAGCGGATCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAAGCTCCACAGAGCTGCCTGGTGGGGTGAAGTCCCCAGAGCGGATCTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCGTCATGCTCAGGGGCCCTGGCATTAACAAAAGGGACAAGAAGAAGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100251 TCGTCATGCTCAGGGGCCCTGGCATTAACAAAAGGGACAAGAAGAAGAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    300         GACTGCTCTACACTTGGCCTGTGCCAATGGCAATTCAGAAGT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TA...TAGGACTGCTCTACACTTGGCCTGTGCCAATGGCAATTCAGAAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGTAAGTCTTCTGCTGGACAGACAATGTCAACTTCATGTCTTTGACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104578 AGTAAGTCTTCTGCTGGACAGACAATGTCAACTTCATGTCTTTGACAGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AAAAGAGGACAGCTCTGATAAAG         GCCGTACAATGCCAGGAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 104628 AAAAGAGGACAGCTCTGATAAAGGTA...CAGGCCGTACAATGCCAGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GATGAATGTGCGTTAATGTTGCTACAACATGGCACTGATCCAAATCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104820 GATGAATGTGCGTTAATGTTGCTACAACATGGCACTGATCCAAATCTTCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AGATATGTATGGGAATACTGCTCTACACTATGCAGTCTACAATGAAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104870 AGATATGTATGGGAATACTGCTCTACACTATGCAGTCTACAATGAAGATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AATTAATGGCCAAAACACTGCTTTTATACGGTGCTGACATTGAATCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104920 AATTAATGGCCAAAACACTGCTTTTATACGGTGCTGACATTGAATCAAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AACAAG         GGTGGCCTCACACCACTTTTGCTTGCTGTACATGG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104970 AACAAGGTA...CAGGGTGGCCTCACACCACTTTTGCTTGCTGTACATGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 ACAAAAACAGCGAATGGTGAAATTTTTAATCAAGAAAAAAGCTAATTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108069 ACAAAAACAGCGAATGGTGAAATTTTTAATCAAGAAAAAAGCTAATTTAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ATGCACTTGATAGGTTTGGAAG         AACTGCCCTCATACTTGCT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 108119 ATGCACTTGATAGGTTTGGAAGGTA...TAGAACTGCCCTCATACTTGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GTACGTTGTGGATCAGCAAGTATAGTTAGTCTTCTACTTCAGCAAAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109508 GTACGTTGTGGATCAGCAAGTATAGTTAGTCTTCTACTTCAGCAAAATAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TGATGTATTTTCTCAAGATGTATTTGGACAAACTGCTGAAGATTATGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109558 TGATGTATTTTCTCAAGATGTATTTGGACAAACTGCTGAAGATTATGCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TTTCTAGTCATCATAGTAT         AATTTGCCAATTACTTTCTGAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 109608 TTTCTAGTCATCATAGTATGTA...TAGAATTTGCCAATTACTTTCTGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TACAAAGAAAACCAGATGCCAAACAACTCTTCTGGAAATAGCAATCCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 112237 TACAAAGAAAACCAGATGCCAAACAACTCTTCTGGAAATAGCAATCCAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    905         AACAAGACTTAAAGCTGACATCAGAGGAAGAGCCACAAAGGC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112287 TA...CAGAACAAGACTTAAAGCTGACATCAGAGGAAGAGCCACAAAGGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TTAAAGGAAGTGAAAATAGTCAGCATGAG         AAAGTGACTCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 123449 TTAAAGGAAGTGAAAATAGTCAGCATGAGGCA...CAGAAAGTGACTCAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GAACCAGACATAAATAAGGATTGCGATAGAGAG         GTTGAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 124882 GAACCAGACATAAATAAGGATTGCGATAGAGAGGTA...AAGGTTGAAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 AGAAATGCAGAAGCATGGAAGTAATAATGTGGGATTATCAGAAAACCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125980 AGAAATGCAGAAGCATGGAAGTAATAATGTGGGATTATCAGAAAACCTGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CTGATGGTGCTGCTGCTGGCAATGGTGATGGTGGATTAGTTCCACAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126030 CTGATGGTGCTGCTGCTGGCAATGGTGATGGTGGATTAGTTCCACAAAGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 AAGAGCAGAAAGCATGAAAATCAGCAATTTCCTAACACAGAGATTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126080 AAGAGCAGAAAGCATGAAAATCAGCAATTTCCTAACACAGAGATTGAAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GTATCACAG         GCCTGAAAAGAAATCTAATGAAAAGAACAAG 
        |||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||>
 126130 GTATCACAGGTA...CAGGCCTGAAAAGAAATCTAATGAAAAGAACAAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1219         GTCAAAAGCCAAATACATTCAGTGGATAACCTTGATGACATA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149427 TA...CAGGTCAAAAGCCAAATACATTCAGTGGATAACCTTGATGACATA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 ACATGGCCATCAGAAATAGCGTCAGAGGATTATGATTTGCTTTTCTCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149745 ACATGGCCATCAGAAATAGCGTCAGAGGATTATGATTTGCTTTTCTCTAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TTATGAGACTTTTACATTGCTCATTGAACAACTCAAAATGGATTTTAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149795 TTATGAGACTTTTACATTGCTCATTGAACAACTCAAAATGGATTTTAACG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361          ATTCTGCTAGCCTATCAAAAATCCAGGATGCAGTTATTTCA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149845 GTA...CAGATTCTGCTAGCCTATCAAAAATCCAGGATGCAGTTATTTCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GAAGAACACTTACTAGAACTCAAAAATAGCCACTATGAGCAACTTACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164316 GAAGAACACTTACTAGAACTCAAAAATAGCCACTATGAGCAACTTACAGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 AGAAGTTGAACAAATGGAAAATATGGTTCATGTACTACAAAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164366 AGAAGTTGAACAAATGGAAAATATGGTTCATGTACTACAAAAA