seq1 = pF1KB7442.tfa, 1035 bp
seq2 = pF1KB7442/gi568815584f_20097336.tfa (gi568815584f:20097336_20298370), 201035 bp

>pF1KB7442 1035
>gi568815584f:20097336_20298370 (Chr14)

1-1035  (100001-101035)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCATTTTCTTTCCCAAAATGATTTAAATATAAATCTGATTCCCCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCATTTTCTTTCCCAAAATGATTTAAATATAAATCTGATTCCCCATCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATGTTTGCACCGTCATTCAGTAATTGCTGGTGCTTTTACAATTCACAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATGTTTGCACCGTCATTCAGTAATTGCTGGTGCTTTTACAATTCACAGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACATGAAAATCTTCAACAGCCCCAGCAACTCCAGCACCTTCACTGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACATGAAAATCTTCAACAGCCCCAGCAACTCCAGCACCTTCACTGGCTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCCTCCTGGGCTTCCCTTGCCCCAGGGAGGGGCAGATCCTCCTCTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCCTCCTGGGCTTCCCTTGCCCCAGGGAGGGGCAGATCCTCCTCTTTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTCTTCACTGTTGTTTACCTCCTGACCCTCATGGGCAATGGTTCCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTCTTCACTGTTGTTTACCTCCTGACCCTCATGGGCAATGGTTCCATCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTGTGCTGTGCACTGGGATCAGAGACTCCACGCCCCCATGTACATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCTGTGCTGTGCACTGGGATCAGAGACTCCACGCCCCCATGTACATCCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCGCCAACTTCTCCTTCTTGGAGATATGTTATGTCACCTCCACAGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTCGCCAACTTCTCCTTCTTGGAGATATGTTATGTCACCTCCACAGTCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGCATGCTGGCCAACTTCCTCTCTGACACCAAGATCATCTCGTTCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAGCATGCTGGCCAACTTCCTCTCTGACACCAAGATCATCTCGTTCTCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCTGCTTCCTCCAGTTCTACTTTTTCTTCTCCTTGGGCTCTACAGAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCTGCTTCCTCCAGTTCTACTTTTTCTTCTCCTTGGGCTCTACAGAATGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTTTTCCTGGCAGTTATGGCATTTGATCGATACCTTGCCATCTGTCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTTTTCCTGGCAGTTATGGCATTTGATCGATACCTTGCCATCTGTCGGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TCTACGCTATCCAACCATTATGACCAGACGTCTCTGTACCAATCTTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TCTACGCTATCCAACCATTATGACCAGACGTCTCTGTACCAATCTTGTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCAATTGCTGGGTACTTGGTTTCATCTGGTTCTTGATTCCTATCGTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCAATTGCTGGGTACTTGGTTTCATCTGGTTCTTGATTCCTATCGTCAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCTCCCAAATGTCCTTCTGTGGATCTAGGATTATTGACCACTTCCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCTCCCAAATGTCCTTCTGTGGATCTAGGATTATTGACCACTTCCTATG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGACCCAGCTCCTCTTCTAACTCTCACTTGCAAAAAAGGCCCTGTGATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGACCCAGCTCCTCTTCTAACTCTCACTTGCAAAAAAGGCCCTGTGATAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGCTTGTCTTTTCTGTCTTAAGTCCTCTGCCTGTCTTTATGCTCTTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGCTTGTCTTTTCTGTCTTAAGTCCTCTGCCTGTCTTTATGCTCTTTCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCATTGTGGGGTCCTATGCTCTGGTCGTGAGAGCTGTGTTGAGGGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCATTGTGGGGTCCTATGCTCTGGTCGTGAGAGCTGTGTTGAGGGTCCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTCAGCAGCTGGGAGAAGAAAGGCTTTCTCCACCTGTGGGTCTCACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TTCAGCAGCTGGGAGAAGAAAGGCTTTCTCCACCTGTGGGTCTCACCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CTGTGGTTTCACTGTTCTACGGCTCAGTACTGGTCATGTATGGGAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CTGTGGTTTCACTGTTCTACGGCTCAGTACTGGTCATGTATGGGAGCCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCATCTAAGAATGAAGCTGGAAAGCAGAAGACTGTGACTCTGTTTTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCATCTAAGAATGAAGCTGGAAAGCAGAAGACTGTGACTCTGTTTTATTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGTTGTTACCCCACTGCTTAACCCTGTGATATATAGTCTTAGGAACAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TGTTGTTACCCCACTGCTTAACCCTGTGATATATAGTCTTAGGAACAAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .
   1001 ATATGAGAAAAGCTCTGAAGAAATTTTGGGGAACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ATATGAGAAAAGCTCTGAAGAAATTTTGGGGAACA