seq1 = pF1KB7436.tfa, 441 bp
seq2 = pF1KB7436/gi568815574r_21972326.tfa (gi568815574r:21972326_22184839), 212514 bp

>pF1KB7436 441
>gi568815574r:21972326_22184839 (ChrY)

(complement)

1-69  (100001-100069)   100% ->
70-185  (102645-102760)   100% ->
186-441  (112259-112514)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAGCCACTGGGCTTGGCTTTCTACTTTCCTGGAGACAAGACAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAGCCACTGGGCTTGGCTTTCTACTTTCCTGGAGACAAGACAATTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAATGGCACTGACTGCCAG         GGATGCAATATTTTATACTTCT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100051 GAATGGCACTGACTGCCAGGTA...CAGGGATGCAATATTTTATACTTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTGAGACTACGGGGAGCATGTGTTCTGAACTTTCCTTGAACAGAGGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102667 CTGAGACTACGGGGAGCATGTGTTCTGAACTTTCCTTGAACAGAGGTCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGGCCAGAAGGAAGAAGGATCTTAAAGACTCATTTCTCTGGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 102717 GAGGCCAGAAGGAAGAAGGATCTTAAAGACTCATTTCTCTGGAGGTG...

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    186    ATATGGGAAGGTTGGCTGTATCTCACTTCCACTTCGTGAGATGACCG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112256 TAGATATGGGAAGGTTGGCTGTATCTCACTTCCACTTCGTGAGATGACCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCTGGATTAACCCACCCCAAATTTCAGAGATTTTCCAAGGCTACCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112306 CCTGGATTAACCCACCCCAAATTTCAGAGATTTTCCAAGGCTACCACCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGGGTGCACGGAGCTGATGCACTGAGCCTGCAAACCAACTCTCTGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112356 AGGGTGCACGGAGCTGATGCACTGAGCCTGCAAACCAACTCTCTGAGAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAGGTTATCTTCACAGTGCCTCGGACAGAGCTTCCTTCTCAGGACACTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112406 CAGGTTATCTTCACAGTGCCTCGGACAGAGCTTCCTTCTCAGGACACTCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGAGAGGCCGTGGTTTCAGGGCACTTGGGGACATCTGTGGCCACGTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112456 AGAGAGGCCGTGGTTTCAGGGCACTTGGGGACATCTGTGGCCACGTTCAT

    450     .
    433 GAAGAAGAC
        |||||||||
 112506 GAAGAAGAC