seq1 = pF1KB7430.tfa, 1488 bp
seq2 = pF1KB7430/gi568815592r_118391635.tfa (gi568815592r:118391635_118751269), 359635 bp

>pF1KB7430 1488
>gi568815592r:118391635_118751269 (Chr6)

(complement)

1-73  (100001-100073)   100% ->
74-232  (118659-118817)   100% ->
233-1020  (184954-185741)   100% ->
1021-1139  (227350-227468)   100% ->
1140-1257  (239855-239972)   100% ->
1258-1488  (259405-259635)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGGGGCGCTTCCTGGCTCCGGAGGCCAGCGGCCGGGATAGCCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGGGGCGCTTCCTGGCTCCGGAGGCCAGCGGCCGGGATAGCCCCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGAGCCCGCAGCTTCCCTGCCG         GCCCAGATTATTCATCAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100051 CGGAGCCCGCAGCTTCCCTGCCGGTA...TAGGCCCAGATTATTCATCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CATGGCTACCTGCTAATGAATCATTGTGGCAGGCCACAACTGTTCCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118677 CATGGCTACCTGCTAATGAATCATTGTGGCAGGCCACAACTGTTCCATCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AACCATCGAAATAACCATATCAGGAGACACAGTATAGCTTCTGACAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118727 AACCATCGAAATAACCATATCAGGAGACACAGTATAGCTTCTGACAGTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGACACTGGCATTGGAACTTCCTGTTCTGATAGCGTGGAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 118777 AGACACTGGCATTGGAACTTCCTGTTCTGATAGCGTGGAAGGTG...CAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATCATTCAACTTCAAGTGGCACATTATCTTTTAAGCCTAGTCAATCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184954 ATCATTCAACTTCAAGTGGCACATTATCTTTTAAGCCTAGTCAATCATTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATTACTCTTCCTACTGCCCATGTGATGCCGTCTAATTCCAGCGCTTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185004 ATTACTCTTCCTACTGCCCATGTGATGCCGTCTAATTCCAGCGCTTCAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTCCAAACTTAGGGAATCATTGACACCAGATGGCTCAAAATGGAGTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185054 TTCCAAACTTAGGGAATCATTGACACCAGATGGCTCAAAATGGAGTACAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCCTCATGCAAACATTGGGAAACCACAGTAGGGGGGAGCAGGACTCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185104 GCCTCATGCAAACATTGGGAAACCACAGTAGGGGGGAGCAGGACTCTTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTAGACATGAAGGACTTCCGGCCACTTCGGAAATGGTCATCTTTATCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185154 CTAGACATGAAGGACTTCCGGCCACTTCGGAAATGGTCATCTTTATCCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ACTCACTGCCCCGGATAACTGTGGCCAGGGTGGCACTGTATGCAGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185204 ACTCACTGCCCCGGATAACTGTGGCCAGGGTGGCACTGTATGCAGAGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGTCAAGGAATGGTTTGGAGAAGATAGGGAAGGCTAAGGCTTTAACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185254 AGTCAAGGAATGGTTTGGAGAAGATAGGGAAGGCTAAGGCTTTAACATCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CAACTGAGGACAATTGGGCCTAGCTGTTTACATGATAGTATGGAGATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185304 CAACTGAGGACAATTGGGCCTAGCTGTTTACATGATAGTATGGAGATGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TAGGTTAGAGGACAAGGAAATAAATAAAAAACGGTCATCAACTCTGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185354 TAGGTTAGAGGACAAGGAAATAAATAAAAAACGGTCATCAACTCTGGACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GCAAGTATAAATTTGAGAGCTGTAGCAAGGAGGACTTTAGAGCCTCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185404 GCAAGTATAAATTTGAGAGCTGTAGCAAGGAGGACTTTAGAGCCTCTTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 TCTACTCTTAGGAGACAGCCTGTAGACATGACATATAGTGCCTTACCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185454 TCTACTCTTAGGAGACAGCCTGTAGACATGACATATAGTGCCTTACCTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 AAGCAAGCCCATTATGACAAGCTCAGAGGCTTTTGAACCTCCAAAATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185504 AAGCAAGCCCATTATGACAAGCTCAGAGGCTTTTGAACCTCCAAAATATT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TAATGCTTGGTCAACAGGCAGTAGGTGGAGTTCCCATTCAGCCTTCCGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185554 TAATGCTTGGTCAACAGGCAGTAGGTGGAGTTCCCATTCAGCCTTCCGTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 AGGACTCAGATGTGGCTTACAGAGCAGCTGCGGACAAATCCTTTGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185604 AGGACTCAGATGTGGCTTACAGAGCAGCTGCGGACAAATCCTTTGGAAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 TAGAAATACAGAGGATTCTTACAGTTTAGCTCCTTGGCAACAGCAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185654 TAGAAATACAGAGGATTCTTACAGTTTAGCTCCTTGGCAACAGCAGCAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TTGAAGACTTTCGACAAGGAAGTGAAACACCAATGCAG         GTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 185704 TTGAAGACTTTCGACAAGGAAGTGAAACACCAATGCAGGTA...CAGGTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 TTGACTGGATCATCTCGTCAAAGTTATTCACCTGGCTATCAGGATTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 227353 TTGACTGGATCATCTCGTCAAAGTTATTCACCTGGCTATCAGGATTTCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 TAAGTGGGAATCAATGTTGAAAATAAAAGAAGGACTTCTAAGGCAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 227403 TAAGTGGGAATCAATGTTGAAAATAAAAGAAGGACTTCTAAGGCAGAAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 AAATTGTAATCGATCG         GCAGAAGCAACAAATTACCCACCTG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 227453 AAATTGTAATCGATCGGTG...CAGGCAGAAGCAACAAATTACCCACCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 CATGAGAGGATAAGGGATAATGAATTACGGGCTCAACATGCCATGTTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239880 CATGAGAGGATAAGGGATAATGAATTACGGGCTCAACATGCCATGTTAGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 ACATTATGTAAATTGTGAGGATTCTTATGTGGCTAGTTTGCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 239930 ACATTATGTAAATTGTGAGGATTCTTATGTGGCTAGTTTGCAGGTA...C

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1258   CCACAATATGAGAACACTTCACTCCAGACACCATTTTCAGAGGAATCA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 259403 AGCCACAATATGAGAACACTTCACTCCAGACACCATTTTCAGAGGAATCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 GTTTCCCATTCCCAACAAGGGGAATTTGAGCAAAAGCTTGCATCTACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 259453 GTTTCCCATTCCCAACAAGGGGAATTTGAGCAAAAGCTTGCATCTACTGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 GAAAGAAGTTTTACAGCTTAATGAGTTTCTCAAACAAAGACTAAGCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 259503 GAAAGAAGTTTTACAGCTTAATGAGTTTCTCAAACAAAGACTAAGCCTAT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 TTAGTGAAGAGAAGAAGAAACTAGAGGAAAAAGTAGGTTTTTCTAATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 259553 TTAGTGAAGAGAAGAAGAAACTAGAGGAAAAAGTAGGTTTTTCTAATAAA

   1500     .    :    .    :    .    :
   1456 GTTGAATTAGGTCAACAACATTTCCTCAGCATA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 259603 GTTGAATTAGGTCAACAACATTTCCTCAGCATA