seq1 = pF1KB7428.tfa, 1236 bp
seq2 = pF1KB7428/gi568815589r_34521461.tfa (gi568815589r:34521461_34728014), 206554 bp

>pF1KB7428 1236
>gi568815589r:34521461_34728014 (Chr9)

(complement)

1-318  (100001-100318)   100% ->
319-391  (102201-102273)   100% ->
392-575  (103968-104151)   100% ->
576-865  (104301-104590)   100% ->
866-1048  (105486-105668)   100% ->
1049-1138  (105906-105995)   100% ->
1139-1236  (106457-106554)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGCCCTGCAGAAGCAGCAGGCAGCTCGGCTGGCCCAGGGGGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGCCCTGCAGAAGCAGCAGGCAGCTCGGCTGGCCCAGGGGGTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCATTGGCCCCTGCATGCCCGCTGCTGCCACCGCAGCCTCCCCTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCATTGGCCCCTGCATGCCCGCTGCTGCCACCGCAGCCTCCCCTGCCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCACCGGACCCTACAGGCCCCTGAGGGGGCCTTGGGGAATGTTGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCACCGGACCCTACAGGCCCCTGAGGGGGCCTTGGGGAATGTTGGGGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGAAGAGGAAGATGCTGAAGAAGATGAGGAGAAGCGGGAGGAAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGGAAGAGGAAGATGCTGAAGAAGATGAGGAGAAGCGGGAGGAAGCCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCAGAGGAGGAGGCAGCTGAGGAGAGCCGTCCAGGGGCCCAGGGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGCAGAGGAGGAGGCAGCTGAGGAGAGCCGTCCAGGGGCCCAGGGCCCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCTCGCCTTCTAGCCAGCCCCCTGGACTCCATCCCCACGAGTGGACCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCTCGCCTTCTAGCCAGCCCCCTGGACTCCATCCCCACGAGTGGACCTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGGAACAATTCAAGCAG         CTGTATGAGCTCGATGCAGACCC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100301 GAGGAACAATTCAAGCAGGTA...CAGCTGTATGAGCTCGATGCAGACCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAAGAGGAAGGAATTTCTGGATGACCTGTTTAGCTTCATGCAAAAGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102224 CAAGAGGAAGGAATTTCTGGATGACCTGTTTAGCTTCATGCAAAAGAGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392          GGACGCCAGTGAACCGCGTGCCCATCATGGCGAAGCAGGTG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102274 GTG...CAGGGACGCCAGTGAACCGCGTGCCCATCATGGCGAAGCAGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTCGACCTGTACGCTCTGTTTCGCCTGGTGACCGCCAAGGGCGGCCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104009 CTCGACCTGTACGCTCTGTTTCGCCTGGTGACCGCCAAGGGCGGCCTGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGAAGTCATCAACCGCAAAGTGTGGCGGGAAGTCACGCGCGGCCTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104059 GGAAGTCATCAACCGCAAAGTGTGGCGGGAAGTCACGCGCGGCCTCAGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TACCCACCACCATCACCTCGGCCGCCTTCACTCTACGCACCCA       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 104109 TACCCACCACCATCACCTCGGCCGCCTTCACTCTACGCACCCAGTG...T

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    576   GTACATGAAGTACCTGTACCCGTACGAGTGCGAGACTCGAGCGCTCAG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104299 AGGTACATGAAGTACCTGTACCCGTACGAGTGCGAGACTCGAGCGCTCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTCCCCAGGGGAGCTCCAGGCCGCCATAGACAGCAATCGGCGCGAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104349 CTCCCCAGGGGAGCTCCAGGCCGCCATAGACAGCAATCGGCGCGAGGGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GTCGCCAGGCTTACACCGCTACTCCGCTCTTCGGCTTGGCAGGGCCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104399 GTCGCCAGGCTTACACCGCTACTCCGCTCTTCGGCTTGGCAGGGCCGCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CCTCGGGGCGCTCAGGACCCAGCCTTGGGTCCCGGCCCCGCCCCTCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104449 CCTCGGGGCGCTCAGGACCCAGCCTTGGGTCCCGGCCCCGCCCCTCCGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GACCCAGTCCAGCCCTGGCCCAGCCCAGGGTTCCACCTCCGGCCTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104499 GACCCAGTCCAGCCCTGGCCCAGCCCAGGGTTCCACCTCCGGCCTGCCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CGCATGCATGCGCTCAGCTGAGTCCAAGCCCTATTAAGAAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 104549 CGCATGCATGCGCTCAGCTGAGTCCAAGCCCTATTAAGAAAGGTG...TA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    866  AGGAGAGTGGAATTCCAAACCCTTGTCTGGCACTGCCTGTGGGCCTGGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105485 GAGGAGAGTGGAATTCCAAACCCTTGTCTGGCACTGCCTGTGGGCCTGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 ACTGGGACCTACACGGGAGAAATTGGCACCAGAGGAGCCCCCAGAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105535 ACTGGGACCTACACGGGAGAAATTGGCACCAGAGGAGCCCCCAGAGAAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 GAGCTGTGCTGATGGGGCCTATGGACCCACCTCGACCTTGCATGCCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105585 GAGCTGTGCTGATGGGGCCTATGGACCCACCTCGACCTTGCATGCCCCCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 AGTTTCCTGCCCCGTGGCAAGGTTCCCCTGAGGG         AAGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 105635 AGTTTCCTGCCCCGTGGCAAGGTTCCCCTGAGGGGTG...CAGAAGAGCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GCTGGATGGGCCTCTTAATCTGGCAGGCAGTGGCATCAGCAGTATCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105913 GCTGGATGGGCCTCTTAATCTGGCAGGCAGTGGCATCAGCAGTATCAACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 TGGCCCTAGAGATCAACGGGGTGGTCTACACTG         GTGTCCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 105963 TGGCCCTAGAGATCAACGGGGTGGTCTACACTGGTA...CAGGTGTCCTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 TTTGCCCGCCGCCAGCCTGTGCCAGCTTCCCAGGGTCCAACCAACCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106465 TTTGCCCGCCGCCAGCCTGTGCCAGCTTCCCAGGGTCCAACCAACCCTGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 ACCCCCACCCTCCACAGGGCCCCCTTCCAGCATCTTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106515 ACCCCCACCCTCCACAGGGCCCCCTTCCAGCATCTTGCCC