seq1 = pF1KB7412.tfa, 1017 bp
seq2 = pF1KB7412/gi568815586r_44916289.tfa (gi568815586r:44916289_45150927), 234639 bp

>pF1KB7412 1017
>gi568815586r:44916289_45150927 (Chr12)

(complement)

1-403  (100001-100403)   100% ->
404-499  (114814-114909)   100% ->
500-687  (127034-127221)   100% ->
688-1017  (134310-134639)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTCCCCAGCGCGGTCGCAGCCCACGCCGGTGCGTACTGGGACGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTCCCCAGCGCGGTCGCAGCCCACGCCGGTGCGTACTGGGACGTTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTTCCTCCGCGCTCCTCAACCTCCCCGCTGCGCCCGGCTTTGGCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTTCCTCCGCGCTCCTCAACCTCCCCGCTGCGCCCGGCTTTGGCAACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGGCAAGAGTTTCCTGATCGAGAATTTGCTGCGGGTCGGGGGCGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGGCAAGAGTTTCCTGATCGAGAATTTGCTGCGGGTCGGGGGCGCCCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACGCCCAGGCTGCAGCCGCCCGCGCCCCACGACCCGGCGACCGCCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACGCCCAGGCTGCAGCCGCCCGCGCCCCACGACCCGGCGACCGCCCTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CACCGCGGGCGCGCAGCTCCGGCCCCTGCCTGCTAGCCCAGTTCCCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CACCGCGGGCGCGCAGCTCCGGCCCCTGCCTGCTAGCCCAGTTCCCCTAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCTGTGCCCCGCAGCCGAACAAGTTAGCCCCGCCGGGGCGCCCTACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGCTGTGCCCCGCAGCCGAACAAGTTAGCCCCGCCGGGGCGCCCTACGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACGCGGTGGGCTTTTCAAGTGCTCAGTCCCTCTGCGGACAGTGCGAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACGCGGTGGGCTTTTCAAGTGCTCAGTCCCTCTGCGGACAGTGCGAGGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCCGGGCCGGGCTCCGGGGGACCGAGACTGTACCTTCCAGCCTTCAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCCGGGCCGGGCTCCGGGGGACCGAGACTGTACCTTCCAGCCTTCAGCGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CAG         CACCTTCCAAACCTTTCCTTCTGAGCACCCCGCCATTC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CAGGTG...CAGCACCTTCCAAACCTTTCCTTCTGAGCACCCCGCCATTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TACTCGGCGTGCTGCGGTGGGTCCTGTCGGCGCCCTGCATCCTCCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114852 TACTCGGCGTGCTGCGGTGGGTCCTGTCGGCGCCCTGCATCCTCCACTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TTTTCCAA         GAGAAGAGAGCATGCTGCCTCTCCTGACACAGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 114902 TTTTCCAAGTA...TAGGAGAAGAGAGCATGCTGCCTCTCCTGACACAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ACTCTAATTCCAAAGCTCGGAGGGGCATTTTAAGAAGAGCTGTCTTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127067 ACTCTAATTCCAAAGCTCGGAGGGGCATTTTAAGAAGAGCTGTCTTTTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GAGGACCAGAGAAAGGCTCTGGAGAAAATGTTTCAGAAACAGAAATATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127117 GAGGACCAGAGAAAGGCTCTGGAGAAAATGTTTCAGAAACAGAAATATAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CAGCAAAACAGACCGAAAGAAACTTGCCATCAACTTGGGACTAAAGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127167 CAGCAAAACAGACCGAAAGAAACTTGCCATCAACTTGGGACTAAAGGAAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CACAG         GTGAAAATTTGGTTTCAGAACAGGAGGATGAAATGG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127217 CACAGGTA...TAGGTGAAAATTTGGTTTCAGAACAGGAGGATGAAATGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CGGAATTCCAAAGAAAAGGAAGTGCTTTCCAACAGGTGTATCCAAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134346 CGGAATTCCAAAGAAAAGGAAGTGCTTTCCAACAGGTGTATCCAAGAAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 AGGTCTTCAAGAGGATCCCCTCTCACGGTCTGCTCTGGGTTTCCCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134396 AGGTCTTCAAGAGGATCCCCTCTCACGGTCTGCTCTGGGTTTCCCTTCTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CATGTCCTTCAATATGGGACGTCCCCCAACAGCACTCAAGTCCAAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134446 CATGTCCTTCAATATGGGACGTCCCCCAACAGCACTCAAGTCCAAGATGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 AGGGAGAATTCTCCAGAACCTTCAGAAAGACTAATCCAGGAGAGTTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134496 AGGGAGAATTCTCCAGAACCTTCAGAAAGACTAATCCAGGAGAGTTCAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 GGCACCACCCCCAGAAGCAAATTCACTGCAAGGTGCCTTATATTTATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134546 GGCACCACCCCCAGAAGCAAATTCACTGCAAGGTGCCTTATATTTATGTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CTGAAGAAGAAGCTGGAAGCAAGGGTGTACTTACTGGGGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134596 CTGAAGAAGAAGCTGGAAGCAAGGGTGTACTTACTGGGGCTGTC