seq1 = pF1KB7403.tfa, 1470 bp
seq2 = pF1KB7403/gi568815591f_90125083.tfa (gi568815591f:90125083_90332621), 207539 bp

>pF1KB7403 1470
>gi568815591f:90125083_90332621 (Chr7)

1-492  (100001-100492)   100% ->
493-1020  (101889-102416)   100% ->
1021-1185  (104790-104954)   100% ->
1186-1470  (107255-107539)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAATCAATCTCTATGATGGGAAGCCCTAAGAGCCTTAGTGAAACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAATCAATCTCTATGATGGGAAGCCCTAAGAGCCTTAGTGAAACTTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTACCTAATGGCATAAATGGTATCAAAGATGCAAGGAAGGTCACTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTACCTAATGGCATAAATGGTATCAAAGATGCAAGGAAGGTCACTGTAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGTGATTGGAAGTGGAGATTTTGCCAAATCCTTGACCATTCGACTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTGTGATTGGAAGTGGAGATTTTGCCAAATCCTTGACCATTCGACTTATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGATGCGGCTATCATGTGGTCATAGGAAGTAGAAATCCTAAGTTTGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGATGCGGCTATCATGTGGTCATAGGAAGTAGAAATCCTAAGTTTGCTTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGAATTTTTTCCTCATGTGGTAGATGTCACTCATCATGAAGATGCTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGAATTTTTTCCTCATGTGGTAGATGTCACTCATCATGAAGATGCTCTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CAAAAACAAATATAATATTTGTTGCTATACACAGAGAACATTATACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CAAAAACAAATATAATATTTGTTGCTATACACAGAGAACATTATACCTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGTGGGACCTGAGACATCTGCTTGTGGGTAAAATCCTGATTGATGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGTGGGACCTGAGACATCTGCTTGTGGGTAAAATCCTGATTGATGTGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAATAACATGAGGATAAACCAGTACCCAGAATCCAATGCTGAATATTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAATAACATGAGGATAAACCAGTACCCAGAATCCAATGCTGAATATTTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTTCATTATTCCCAGATTCTTTGATTGTCAAAGGATTTAATGTTGTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTTCATTATTCCCAGATTCTTTGATTGTCAAAGGATTTAATGTTGTCTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCTTGGGCACTTCAGTTAGGACCTAAGGATGCCAGCCGGCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100451 GCTTGGGCACTTCAGTTAGGACCTAAGGATGCCAGCCGGCAGGTA...CA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    493  GTTTATATATGCAGCAACAATATTCAAGCGCGACAACAGGTTATTGAAC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101888 GGTTTATATATGCAGCAACAATATTCAAGCGCGACAACAGGTTATTGAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TTGCCCGCCAGTTGAATTTCATTCCCATTGACTTGGGATCCTTATCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101938 TTGCCCGCCAGTTGAATTTCATTCCCATTGACTTGGGATCCTTATCATCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GCCAGAGAGATTGAAAATTTACCCCTACGACTCTTTACTCTCTGGAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101988 GCCAGAGAGATTGAAAATTTACCCCTACGACTCTTTACTCTCTGGAGAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GCCAGTGGTGGTAGCTATAAGCTTGGCCACATTTTTTTTCCTTTATTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102038 GCCAGTGGTGGTAGCTATAAGCTTGGCCACATTTTTTTTCCTTTATTCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TTGTCAGAGATGTGATTCATCCATATGCTAGAAACCAACAGAGTGACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102088 TTGTCAGAGATGTGATTCATCCATATGCTAGAAACCAACAGAGTGACTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 TACAAAATTCCTATAGAGATTGTGAATAAAACCTTACCTATAGTTGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102138 TACAAAATTCCTATAGAGATTGTGAATAAAACCTTACCTATAGTTGCCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TACTTTGCTCTCCCTAGTATACCTCGCAGGTCTTCTGGCAGCTGCTTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102188 TACTTTGCTCTCCCTAGTATACCTCGCAGGTCTTCTGGCAGCTGCTTATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 AACTTTATTACGGCACCAAGTATAGGAGATTTCCACCTTGGTTGGAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102238 AACTTTATTACGGCACCAAGTATAGGAGATTTCCACCTTGGTTGGAAACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TGGTTACAGTGTAGAAAACAGCTTGGATTACTAAGTTTTTTCTTCGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102288 TGGTTACAGTGTAGAAAACAGCTTGGATTACTAAGTTTTTTCTTCGCTAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GGTCCATGTTGCCTACAGCCTCTGCTTACCGATGAGAAGGTCAGAGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102338 GGTCCATGTTGCCTACAGCCTCTGCTTACCGATGAGAAGGTCAGAGAGAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 ATTTGTTTCTCAACATGGCTTATCAGCAG         GTTCATGCAAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 102388 ATTTGTTTCTCAACATGGCTTATCAGCAGGTA...TAGGTTCATGCAAAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 ATTGAAAACTCTTGGAATGAGGAAGAAGTTTGGAGAATTGAAATGTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104802 ATTGAAAACTCTTGGAATGAGGAAGAAGTTTGGAGAATTGAAATGTATAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 CTCCTTTGGCATAATGAGCCTTGGCTTACTTTCCCTCCTGGCAGTCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104852 CTCCTTTGGCATAATGAGCCTTGGCTTACTTTCCCTCCTGGCAGTCACTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 CTATCCCTTCAGTGAGCAATGCTTTAAACTGGAGAGAATTCAGTTTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104902 CTATCCCTTCAGTGAGCAATGCTTTAAACTGGAGAGAATTCAGTTTTATT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 CAG         TCTACACTTGGATATGTCGCTCTGCTCATAAGTACTTT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104952 CAGGTA...AAGTCTACACTTGGATATGTCGCTCTGCTCATAAGTACTTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CCATGTTTTAATTTATGGATGGAAACGAGCTTTTGAGGAAGAGTACTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107293 CCATGTTTTAATTTATGGATGGAAACGAGCTTTTGAGGAAGAGTACTACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 GATTTTATACACCACCAAACTTTGTTCTTGCTCTTGTTTTGCCCTCAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107343 GATTTTATACACCACCAAACTTTGTTCTTGCTCTTGTTTTGCCCTCAATT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 GTAATTCTGGGTAAGATTATTTTATTCCTTCCATGTATAAGCCGAAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107393 GTAATTCTGGGTAAGATTATTTTATTCCTTCCATGTATAAGCCGAAAGCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 AAAACGAATTAAAAAAGGCTGGGAAAAGAGCCAATTTCTGGAAGAAGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107443 AAAACGAATTAAAAAAGGCTGGGAAAAGAGCCAATTTCTGGAAGAAGGTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1424 TGGGAGGAACAATTCCTCATGTCTCCCCGGAGAGGGTCACAGTAATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107493 TGGGAGGAACAATTCCTCATGTCTCCCCGGAGAGGGTCACAGTAATG