seq1 = pF1KB7401.tfa, 591 bp
seq2 = pF1KB7401/gi568815584r_104495096.tfa (gi568815584r:104495096_104704741), 209646 bp

>pF1KB7401 591
>gi568815584r:104495096_104704741 (Chr14)

(complement)

1-305  (100001-100305)   99% ->
306-443  (107615-107752)   100% ->
444-591  (109499-109646)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGCTCAACAATTTCCTTTTCGCTCAGTGCGCCTGCTACTTCTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGCTCAACAATTTCCTTTTCGCTCAGTGCGCCTGCTACTTCTTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCCTGTTCAGCTTCGTGGTGGTGGTCCCGCTGTCCGAGAACGGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCCTGTTCAGCTTCGTGGTGGTGGTCCCGCTGTCCGAGAACGGCCACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTTCCGCGGCCGCTGCCTGCTCTTCACCGAGGGCATGTGGCTGAGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTTCCGCGGCCGCTGCCTGCTCTTCACCGAGGGCATGTGGCTGAGCGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AACCTCACGGTGCAGGAGCGCGAGCGCTTCACGGTGCAGGAGTGGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AACCTCACGGTGCAGGAGCGCGAGCGCTTCACGGTGCAGGAGTGGGGCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCCGGCCGCCTGCCGCTTCAGCCTGCTCGCCAGCCTCCTGTCTCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCCGGCCGCCTGCCGCTTCAGCCTGCTCGCCAGCCTCCTGTCTCTGCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGCCGCCGCGCACGCCTGGCGCACGCTCTTCTTCCTATGCAAGGGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 100251 TGGCCGCCGCGCACGCCTGGCGCACGCTCTTCTTCCTCTGCAAGGGACAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGGG         CTCCTTCTTCTCCGCCTTCCTGAACCTCCTGGTCAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGGGGTA...CAGCTCCTTCTTCTCCGCCTTCCTGAACCTCCTGGTCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CGCCTTCGTGGTCTTCCTGGTCTTCATTGCCAGCACCATCGTGAGCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107651 CGCCTTCGTGGTCTTCCTGGTCTTCATTGCCAGCACCATCGTGAGCGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GCTTCACCATGTGGTGCGACACCATCACCGAGAAGGGCACCGTACCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107701 GCTTCACCATGTGGTGCGACACCATCACCGAGAAGGGCACCGTACCCCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AG         CTGTGAAGAGCTCCAGGACATCGACTTGGAGCTGGGCGT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107751 AGGTG...TAGCTGTGAAGAGCTCCAGGACATCGACTTGGAGCTGGGCGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGACAACTCCGCCTTCTACGATCAGTTTGCAATTGCCCAGGTAGGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109538 GGACAACTCCGCCTTCTACGATCAGTTTGCAATTGCCCAGGTAGGGGGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CTGGGCAAGAAGGGAGGCTTGCAATGCTGGGAGGGGGCCATTTACTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109588 CTGGGCAAGAAGGGAGGCTTGCAATGCTGGGAGGGGGCCATTTACTGCTG

    600     .
    583 GACATTTGC
        |||||||||
 109638 GACATTTGC