seq1 = pF1KB7400.tfa, 915 bp
seq2 = pF1KB7400/gi568815587f_56600388.tfa (gi568815587f:56600388_56801302), 200915 bp

>pF1KB7400 915
>gi568815587f:56600388_56801302 (Chr11)

1-915  (100001-100915)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGAGGAGCAATCATACAGTGACTGAGTTTATACTGCTGGGCTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGAGGAGCAATCATACAGTGACTGAGTTTATACTGCTGGGCTTCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACAGACCCAGGAATGCAGCTGGGCCTCTTCGTGGTGTTCCTGGGCGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACAGACCCAGGAATGCAGCTGGGCCTCTTCGTGGTGTTCCTGGGCGTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTCTCTCACTGTGGTAGGAAATAGCACCCTCATCGTGTTGATCTGTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTCTCTCACTGTGGTAGGAAATAGCACCCTCATCGTGTTGATCTGTAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACTCCTGCCTCCACACACCCATGTATTTTTTCACTGGAAATCTGTCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACTCCTGCCTCCACACACCCATGTATTTTTTCACTGGAAATCTGTCGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCTGGATCTCTGGTATTCTTCTGTCTACACCCCAAAGATCCTAGTGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCTGGATCTCTGGTATTCTTCTGTCTACACCCCAAAGATCCTAGTGACCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCATCTCTGAAGACAAAAGCATCTCCTTTGCTGGCTGCCTGTGTCAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCATCTCTGAAGACAAAAGCATCTCCTTTGCTGGCTGCCTGTGTCAGTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCTTCTCTGCAGGGCTGGCCTATAGTGAGTGCTACCTGCTGGCTGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCTTCTCTGCAGGGCTGGCCTATAGTGAGTGCTACCTGCTGGCTGCCGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCTTATGACCGCTACGTGGCCATCTCCAAGCCCCTGCTTTATGCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCTTATGACCGCTACGTGGCCATCTCCAAGCCCCTGCTTTATGCCCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCATGTCCATAAAGCTGTGTGCATTGCTGGTAGCAGTCTCATATTGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCATGTCCATAAAGCTGTGTGCATTGCTGGTAGCAGTCTCATATTGTGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCTTTATTAACTCTTCAATCATCACCAAGAAAACGTTTTCCTTTAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGCTTTATTAACTCTTCAATCATCACCAAGAAAACGTTTTCCTTTAACTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTGCCGTGAAAACATCATTGATGACTTTTTCTGTGATTTGCTTCCCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTGCCGTGAAAACATCATTGATGACTTTTTCTGTGATTTGCTTCCCTTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGGAGCTGGCCTGTGGCGAGAAGGGCGGCTATAAAATTATGATGTACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGGAGCTGGCCTGTGGCGAGAAGGGCGGCTATAAAATTATGATGTACTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTGCTGGCCTCCAATGTCATCTGCCCCGCAGTGCTCATCCTGGCCTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTGCTGGCCTCCAATGTCATCTGCCCCGCAGTGCTCATCCTGGCCTCCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCTCTTTATCATCACCAGTGTCTTGAGGATCTCCTCCTCCAAGGGCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCTCTTTATCATCACCAGTGTCTTGAGGATCTCCTCCTCCAAGGGCTACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCAAAGCCTTCTCCACATGCTCCTCCCACCTGACCTCTGTCACTTTATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCAAAGCCTTCTCCACATGCTCCTCCCACCTGACCTCTGTCACTTTATAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TATGGCTCCATTCTCTACATCTACGCTCTCCCCAGATCTAGCTATTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TATGGCTCCATTCTCTACATCTACGCTCTCCCCAGATCTAGCTATTCTTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGATATGGACAAAATAGTTTCTACATTTTACACTGTGGTATTCCCCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGATATGGACAAAATAGTTTCTACATTTTACACTGTGGTATTCCCCATGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGAATCTCATGATCTACAGCCTAAGGAATAAGGATGTGAAAGAGGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGAATCTCATGATCTACAGCCTAAGGAATAAGGATGTGAAAGAGGCTCTG

    900     .    :    .
    901 AAAAAACTTCTCCCA
        |||||||||||||||
 100901 AAAAAACTTCTCCCA