seq1 = pF1KB7398.tfa, 975 bp
seq2 = pF1KB7398/gi568815592r_31011384.tfa (gi568815592r:31011384_31212555), 201172 bp

>pF1KB7398 975
>gi568815592r:31011384_31212555 (Chr6)

(complement)

1-67  (100001-100067)   100% ->
68-975  (100265-101172)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGGGCCGCGTGGCAGGGAGCTGCGCTCCTCTGGGCCTGCTCCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGGGCCGCGTGGCAGGGAGCTGCGCTCCTCTGGGCCTGCTCCTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGTCTTCATCTCCCAG         GCCTCTTTGCCCGGAGCATCGGTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGTCTTCATCTCCCAGGTA...CAGGCCTCTTTGCCCGGAGCATCGGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGTGGAGGAGAAAGTTTCCCAAAACTTGGGGACCAACTTGCCTCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100289 TTGTGGAGGAGAAAGTTTCCCAAAACTTGGGGACCAACTTGCCTCAGCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGACAACCTTCCTCCACTGGCCCCTCTAACTCTGAACATCCGCAGCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100339 GGACAACCTTCCTCCACTGGCCCCTCTAACTCTGAACATCCGCAGCCCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCTGGACCCTAGGTCTAATGACTTGGCAAGGGTTCCTCTGAAGCTCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100389 TCTGGACCCTAGGTCTAATGACTTGGCAAGGGTTCCTCTGAAGCTCAGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGCCTGCATCAGATGGCTTCCCACCTGCAGGAGGTTCTGCAGTGCAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100439 TGCCTGCATCAGATGGCTTCCCACCTGCAGGAGGTTCTGCAGTGCAGAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TGGCCTCCATCGTGGGGGCTGCCTGCCATGGATTCCTGGCCCCCTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100489 TGGCCTCCATCGTGGGGGCTGCCTGCCATGGATTCCTGGCCCCCTGAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TCCTTGGCAGATGATGGCTGCTGCGGCTGAGGACCGCCTGGGGGAAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100539 TCCTTGGCAGATGATGGCTGCTGCGGCTGAGGACCGCCTGGGGGAAGCGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGCCTGAAGAACTCTCTTACCTCTCCAGTGCTGCGGCCCTCGCTCCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100589 TGCCTGAAGAACTCTCTTACCTCTCCAGTGCTGCGGCCCTCGCTCCGGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AGTGGCCCTTTGCCTGGGGAGTCTTCTCCCGATGCCACAGGCCTCTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100639 AGTGGCCCTTTGCCTGGGGAGTCTTCTCCCGATGCCACAGGCCTCTCACC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CAAGGCTTCACTCCTCCACCAGGACTCGGAGTCCAGACGACTGCCCCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100689 CAAGGCTTCACTCCTCCACCAGGACTCGGAGTCCAGACGACTGCCCCGTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CTAATTCACTGGGAGCCGGGGGAAAAATCCTTTCCCAACGCCCTCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100739 CTAATTCACTGGGAGCCGGGGGAAAAATCCTTTCCCAACGCCCTCCCTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TCTCTCATCCACAGGGTTCTGCCTGATCACCCCTGGGGTACCCTGAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100789 TCTCTCATCCACAGGGTTCTGCCTGATCACCCCTGGGGTACCCTGAATCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CAGTGTGTCCTGGGGAGGTGGAGGCCCTGGGACTGGTTGGGGAACGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100839 CAGTGTGTCCTGGGGAGGTGGAGGCCCTGGGACTGGTTGGGGAACGAGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CCATGCCACACCCTGAGGGAATCTGGGGTATCAATAATCAACCCCCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100889 CCATGCCACACCCTGAGGGAATCTGGGGTATCAATAATCAACCCCCAGGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 ACCAGCTGGGGAAATATTAATCGGTATCCAGGAGGCAGCTGGGGAAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100939 ACCAGCTGGGGAAATATTAATCGGTATCCAGGAGGCAGCTGGGGAAATAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TAATCGGTATCCAGGAGGCAGCTGGGGGAATATTAATCGGTATCCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100989 TAATCGGTATCCAGGAGGCAGCTGGGGGAATATTAATCGGTATCCAGGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GCAGCTGGGGGAATATTCATCTATACCCAGGTATCAATAACCCATTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101039 GCAGCTGGGGGAATATTCATCTATACCCAGGTATCAATAACCCATTTCCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CCTGGAGTCCTCCGCCCTCCTGGCTCTTCTTGGAACATCCCAGCTGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101089 CCTGGAGTCCTCCGCCCTCCTGGCTCTTCTTGGAACATCCCAGCTGGCTT

    950     .    :    .    :    .    :
    942 CCCTAATCCTCCAAGCCCTAGGTTGCAGTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101139 CCCTAATCCTCCAAGCCCTAGGTTGCAGTGGGGC