seq1 = pF1KB7394.tfa, 612 bp
seq2 = pF1KB7394/gi568815592r_43205817.tfa (gi568815592r:43205817_43408792), 202976 bp

>pF1KB7394 612
>gi568815592r:43205817_43408792 (Chr6)

(complement)

1-43  (100001-100043)   100% ->
44-138  (100384-100478)   100% ->
139-196  (100897-100954)   100% ->
197-328  (101050-101181)   100% ->
329-400  (102276-102347)   100% ->
401-495  (102480-102574)   100% ->
496-553  (102669-102726)   100% ->
554-612  (102918-102976)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCTGGACCTGTCCGCGTTGCCAGCAACCTGTTTTCTTCG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100001 ATGAGCTGGACCTGTCCGCGTTGCCAGCAACCTGTTTTCTTCGGTG...C

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     44   CTGAGAAGGTGAGCTCCCTGGGCAAGAACTGGCACCGCTTCTGCCTGA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100382 AGCTGAGAAGGTGAGCTCCCTGGGCAAGAACTGGCACCGCTTCTGCCTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AATGTGAGCGCTGCCACAGCATCCTGTCCCCTGGCGGGCATGCAGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100432 AATGTGAGCGCTGCCACAGCATCCTGTCCCCTGGCGGGCATGCAGAGGTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    139       CACAATGGGAGGCCATACTGCCACAAGCCATGCTATGGGGCTCT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100482 ...CAGCACAATGGGAGGCCATACTGCCACAAGCCATGCTATGGGGCTCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CTTTGGACCCAGGG         GGGTGAACATTGGTGGTGTAGGCTCCT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100941 CTTTGGACCCAGGGGTA...CAGGGGTGAACATTGGTGGTGTAGGCTCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 ACTTGTACAATCCCCCCACTCCCAGCCCTGGCTGCACCACTCCTCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101077 ACTTGTACAATCCCCCCACTCCCAGCCCTGGCTGCACCACTCCTCTCAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CCCAGCAGCTTCAGCCCTCCCAGGCCAAGGACTGGCCTCCCCCAAGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101127 CCCAGCAGCTTCAGCCCTCCCAGGCCAAGGACTGGCCTCCCCCAAGGCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GAAAA         GCCCTCCCCATATGAAGACATTCACTGGGGAGACCT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101177 GAAAAGTA...AAGGCCCTCCCCATATGAAGACATTCACTGGGGAGACCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CGCTGTGCCCTGGCTGTGGGGAGCCCGTCTATTTTG         CTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 102312 CGCTGTGCCCTGGCTGTGGGGAGCCCGTCTATTTTGGTA...CAGCTGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 AAGGTGATGTCATTAGGCAGAAATTGGCACCGACCGTGTCTGAGGTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102485 AAGGTGATGTCATTAGGCAGAAATTGGCACCGACCGTGTCTGAGGTGCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GCGTTGCCACAAGACCCTGACTGCTGGGAGTCATGCTGAG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 102535 GCGTTGCCACAAGACCCTGACTGCTGGGAGTCATGCTGAGGTG...CAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 ATGATGGAGTCCCCTACTGCCACGTCCCCTGCTACGGCTACCTGTTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102670 ATGATGGAGTCCCCTACTGCCACGTCCCCTGCTACGGCTACCTGTTTGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 CCCAAAG         GTGTGAACATTGGCGATGTGGGCTGCTACATCTA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102720 CCCAAAGGTG...CAGGTGTGAACATTGGCGATGTGGGCTGCTACATCTA

    650     .    :    .    :    .
    588 TGACCCAGTGAAGATAAAATTCAAA
        |||||||||||||||||||||||||
 102952 TGACCCAGTGAAGATAAAATTCAAA