seq1 = pF1KB7392.tfa, 1020 bp
seq2 = pF1KB7392/gi568815581r_3713047.tfa (gi568815581r:3713047_3922008), 208962 bp

>pF1KB7392 1020
>gi568815581r:3713047_3922008 (Chr17)

(complement)

1-56  (100001-100056)   100% ->
57-160  (100657-100760)   100% ->
161-470  (103437-103746)   100% ->
471-625  (105739-105893)   100% ->
626-787  (107526-107687)   100% ->
788-1020  (108730-108962)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAATATGGGAATCCAAATTATGGAGGCATGAAAGGAATTCTTAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAATATGGGAATCCAAATTATGGAGGCATGAAAGGAATTCTTAGCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTCATG         GAAGCGAAGATATCATTCCCGTCGTATTCAGCGGG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTCATGGTG...CAGGAAGCGAAGATATCATTCCCGTCGTATTCAGCGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACGTGATCAAGAAGAGAGCCCTGATTGGGGATGACGTTGGCTTGACGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100692 ACGTGATCAAGAAGAGAGCCCTGATTGGGGATGACGTTGGCTTGACGTCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TATAAACATCGACATTCTG         GGCTAGTGAATGTTCCCGAGGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100742 TATAAACATCGACATTCTGGTA...CAGGGCTAGTGAATGTTCCCGAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 ACCCATTGAAGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103459 ACCCATTGAAGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAGAAGACCAGGACATGGATGCAGATGACAGAGTGGTGGTAGAGTACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103509 AAGAAGACCAGGACATGGATGCAGATGACAGAGTGGTGGTAGAGTACCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGGAGCTCCCGGCTCTCAAGCAGCCCCGGGAGCGGAGCGCGTCTAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103559 GAGGAGCTCCCGGCTCTCAAGCAGCCCCGGGAGCGGAGCGCGTCTAGACG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ATCCAGTGCCAGCAGCTCAGACTCAGATGAAATGGACTATGATCTAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103609 ATCCAGTGCCAGCAGCTCAGACTCAGATGAAATGGACTATGATCTAGAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGAAAATGATTTCCACGCCTTCACCAAAGAAAAGCATGAAAATGACTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103659 TGAAAATGATTTCCACGCCTTCACCAAAGAAAAGCATGAAAATGACTATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TATGCTGACGAAGTGGAATCTCAGTTGAAAAATATTAG         GAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 103709 TATGCTGACGAAGTGGAATCTCAGTTGAAAAATATTAGGTA...AAGGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTCCATGAGGGCAGATAGTGTATCTTCAAGCAATATCAAAAACCGAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105742 CTCCATGAGGGCAGATAGTGTATCTTCAAGCAATATCAAAAACCGAATTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GTAACAAATTACCACCTGAGAAATTTGCAGATGTCCGACATCTATTAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105792 GTAACAAATTACCACCTGAGAAATTTGCAGATGTCCGACATCTATTAGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAGAAACGTCAGCACTCCCGTCCACGGCCACCAGTCAGCAGTACTAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105842 GAGAAACGTCAGCACTCCCGTCCACGGCCACCAGTCAGCAGTACTAAATC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AG         ATATACGCCAGCGGTTAGGAAAAAGACCACATTCTCCGG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105892 AGGTA...CAGATATACGCCAGCGGTTAGGAAAAAGACCACATTCTCCGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AAAAGGCTTTTAGTAGTAACCCCGTCGTTCGGAGAGAGCCCTCTTCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107565 AAAAGGCTTTTAGTAGTAACCCCGTCGTTCGGAGAGAGCCCTCTTCTGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GTGCATAGTAGGCTAGGTGTTCCCAGGCAGGATAGTAAAGGCCTCTACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107615 GTGCATAGTAGGCTAGGTGTTCCCAGGCAGGATAGTAAAGGCCTCTACGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CGATACTCGGGAGAAGAAATCAG         GTAATTTATGGACTCGCC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 107665 CGATACTCGGGAGAAGAAATCAGGTT...CAGGTAATTTATGGACTCGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TAGGATCTGCACCCAAGACCAAAGAAAAGAATACGAAGAAAGTGGATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108748 TAGGATCTGCACCCAAGACCAAAGAAAAGAATACGAAGAAAGTGGATCAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AGGGCGCCTGGCGCTGAGGAAGACGACTCTGAGCTGCAAAGGGCATGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108798 AGGGCGCCTGGCGCTGAGGAAGACGACTCTGAGCTGCAAAGGGCATGGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GGCTCTGATTAAGGAGAAAGAGCAGTCTCGCCAAAAGAAGAGCCGGTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108848 GGCTCTGATTAAGGAGAAAGAGCAGTCTCGCCAAAAGAAGAGCCGGTTAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 ATAACTTACCATCTCTCCAGATTGAAGTTAGTCGGGAAAGCAGCTCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108898 ATAACTTACCATCTCTCCAGATTGAAGTTAGTCGGGAAAGCAGCTCTGGT

   1050     .    :    .
   1006 TCAGAGGCAGAGTCC
        |||||||||||||||
 108948 TCAGAGGCAGAGTCC