seq1 = pF1KB7388.tfa, 1080 bp
seq2 = pF1KB7388/gi568815589f_122561566.tfa (gi568815589f:122561566_122762645), 201080 bp

>pF1KB7388 1080
>gi568815589f:122561566_122762645 (Chr9)

1-1080  (100001-101080)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAAGAAACCACAATCCAGATAATTGTAATGTTTTAAATTTTTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAAGAAACCACAATCCAGATAATTGTAATGTTTTAAATTTTTTCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCTGATAAGAAGAATAAAAGGAGAAATTTTGGACAGATTGTATCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCTGATAAGAAGAATAAAAGGAGAAATTTTGGACAGATTGTATCAGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGGAAGAATCTGTTACAGTGTTAGTTTATCTTTAGGTGAACCCACAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTGGAAGAATCTGTTACAGTGTTAGTTTATCTTTAGGTGAACCCACAACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATGGGAAGAAATAACCTAACAAGACCCTCTGAATTCATCCTCCTTGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATGGGAAGAAATAACCTAACAAGACCCTCTGAATTCATCCTCCTTGGACT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTCCTCTCGACCTGAGGATCAGAAGCCGCTCTTTGCTGTGTTCCTCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTCCTCTCGACCTGAGGATCAGAAGCCGCTCTTTGCTGTGTTCCTCCCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTACCTTATCACAGTGATAGGAAACCTGCTTATCATCCTGGCCATCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCTACCTTATCACAGTGATAGGAAACCTGCTTATCATCCTGGCCATCCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCAGACACTCGTCTCCAGACGCCCATGTACTTCTTTCTAAGCATCCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TCAGACACTCGTCTCCAGACGCCCATGTACTTCTTTCTAAGCATCCTGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTTTGTTGACATTTGCTATGTGACAGTCATTATCCCTAAGATGCTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TTTTGTTGACATTTGCTATGTGACAGTCATTATCCCTAAGATGCTGGTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACTTCTTATCAGAGACAAAGACCATCTCTTACAGTGAGTGTCTGACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACTTCTTATCAGAGACAAAGACCATCTCTTACAGTGAGTGTCTGACCCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATGTACTTTTTCTTAGCCTTTGGAAACACAGACAGTTACCTGCTAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATGTACTTTTTCTTAGCCTTTGGAAACACAGACAGTTACCTGCTAGCAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CATGGCCATTGACCGCTATGTGGCCATATGTAATCCCTTCCACTACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CATGGCCATTGACCGCTATGTGGCCATATGTAATCCCTTCCACTACATCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCATTATGAGTCACAGATGCTGTGTCCTGCTTCTGGTTCTCTCCTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCATTATGAGTCACAGATGCTGTGTCCTGCTTCTGGTTCTCTCCTTCTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATTCCACATTTTCACTCCCTCCTGCACATTCTTCTGACTAATCAGCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATTCCACATTTTCACTCCCTCCTGCACATTCTTCTGACTAATCAGCTCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTTCTGTGCCTCAAATGTCATCCATCACTTTTTCTGCGATGATCAACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTTCTGTGCCTCAAATGTCATCCATCACTTTTTCTGCGATGATCAACCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGCTAAAATTGTCCTGTTCCTCCCATTTTGTCAAAGAAATCACAGTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGCTAAAATTGTCCTGTTCCTCCCATTTTGTCAAAGAAATCACAGTAATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ACAGAAGGCTTGGCTGTCATAATGACCCCGTTTTCATGCATCATCATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ACAGAAGGCTTGGCTGTCATAATGACCCCGTTTTCATGCATCATCATCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTATTTAAGAATCCTCATCACTGTTCTGAAGATTCCTTCAGCTGCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TTATTTAAGAATCCTCATCACTGTTCTGAAGATTCCTTCAGCTGCTGGAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGCGTAAAGCATTTTCTACCTGTGGCTCTCATCTCACAGTGGTGACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGCGTAAAGCATTTTCTACCTGTGGCTCTCATCTCACAGTGGTGACCCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTTTATGGAAGCATTAGCTATCTCTATTTTCAGCCCCTGTCCAACTATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTTTATGGAAGCATTAGCTATCTCTATTTTCAGCCCCTGTCCAACTATAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGTCAAGGATCAAATAGCAACAATTATCTACACCGTACTGACTCCTATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TGTCAAGGATCAAATAGCAACAATTATCTACACCGTACTGACTCCTATGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TAAATCCATTTATCTATAGTCTGAGGAACAAAGACATGAAGCAGGGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TAAATCCATTTATCTATAGTCTGAGGAACAAAGACATGAAGCAGGGTTTG

   1050     .    :    .    :    .    :
   1051 GCAAAGTTGATGCACAGGATGAAATGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GCAAAGTTGATGCACAGGATGAAATGTCAG