seq1 = pF1KB7385.tfa, 951 bp
seq2 = pF1KB7385/gi568815587f_4445191.tfa (gi568815587f:4445191_4646141), 200951 bp

>pF1KB7385 951
>gi568815587f:4445191_4646141 (Chr11)

1-951  (100001-100951)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTCACTTTTCATAATGTCTGCTCAGTACCCAGCTCCTTCTGGCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTCACTTTTCATAATGTCTGCTCAGTACCCAGCTCCTTCTGGCTCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGCATCCCAGGGCTGGAGTCCCTACACGTCTGGCTCTCCATCCCCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGCATCCCAGGGCTGGAGTCCCTACACGTCTGGCTCTCCATCCCCTTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTCCATGTACCTGGTGGCTGTGGTGGGGAATGTGACCATCCTGGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTCCATGTACCTGGTGGCTGTGGTGGGGAATGTGACCATCCTGGCTGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTAAAGATAGAACGCAGCCTGCACCAGCCCATGTACTTTTTCTTGTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTAAAGATAGAACGCAGCCTGCACCAGCCCATGTACTTTTTCTTGTGCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTTGGCTGCCATTGACCTGGTTCTGTCTACTTCCACTATACCCAAACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTTGGCTGCCATTGACCTGGTTCTGTCTACTTCCACTATACCCAAACTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGGAATCTTCTGGTTCGGTGCTTGTGACATTGGCCTGGACGCCTGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGGAATCTTCTGGTTCGGTGCTTGTGACATTGGCCTGGACGCCTGCTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCCAAATGTTCCTTATCCACTGCTTTGCCACTGTTGAGTCAGGCATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCCAAATGTTCCTTATCCACTGCTTTGCCACTGTTGAGTCAGGCATCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTTGCCATGGCTTTTGATCGCTACGTGGCCATCTGCAACCCACTACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCTTGCCATGGCTTTTGATCGCTACGTGGCCATCTGCAACCCACTACGTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATAGCATGGTGCTCACTTATACAGTGGTGGGTCGTTTGGGGCTTGTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATAGCATGGTGCTCACTTATACAGTGGTGGGTCGTTTGGGGCTTGTTTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTCCTCCGGGGTGTTCTCTACATTGGACCTCTGCCTCTGATGATCCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTCCTCCGGGGTGTTCTCTACATTGGACCTCTGCCTCTGATGATCCGCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCGGCTGCCCCTTTATAAAACCCATGTTATCTCCCACTCCTACTGTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCGGCTGCCCCTTTATAAAACCCATGTTATCTCCCACTCCTACTGTGAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACATGGCTGTAGTTGCCTTGACATGTGGCGACAGCAGGGTCAATAATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACATGGCTGTAGTTGCCTTGACATGTGGCGACAGCAGGGTCAATAATGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TATGGGCTGAGCATCGGCTTTCTGGTGTTGATCCTGGACTCAGTGGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TATGGGCTGAGCATCGGCTTTCTGGTGTTGATCCTGGACTCAGTGGCTAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGCTGCATCCTATGTGATGATTTTCAGGGCCGTGATGGGGTTAGCCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGCTGCATCCTATGTGATGATTTTCAGGGCCGTGATGGGGTTAGCCACTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTGAGGCTAGGCTTAAAACCCTGGGGACATGCGCTTCTCACCTCTGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CTGAGGCTAGGCTTAAAACCCTGGGGACATGCGCTTCTCACCTCTGTGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATCCTGATCTTTTATGTTCCCATTGCTGTTTCTTCCCTGATTCACCGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATCCTGATCTTTTATGTTCCCATTGCTGTTTCTTCCCTGATTCACCGATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGGTCAGTGTGTGCCTCCTCCAGTCCACACTCTGCTGGCCAACTTCTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGGTCAGTGTGTGCCTCCTCCAGTCCACACTCTGCTGGCCAACTTCTATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCCTCATTCCTCCAATCCTCAATCCCATTGTCTATGCTGTTCGCACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCCTCATTCCTCCAATCCTCAATCCCATTGTCTATGCTGTTCGCACCAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CAGATCCGAGAGAGCCTTCTCCAAATACCAAGGATAGAAATGAAGATTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CAGATCCGAGAGAGCCTTCTCCAAATACCAAGGATAGAAATGAAGATTAG

    950 
    951 A
        |
 100951 A