seq1 = pF1KB7384.tfa, 1392 bp
seq2 = pF1KB7384/gi568815580r_51076354.tfa (gi568815580r:51076354_51296735), 220382 bp

>pF1KB7384 1392
>gi568815580r:51076354_51296735 (Chr18)

(complement)

1-169  (100001-100169)   100% ->
170-1392  (119160-120382)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGGCGGCGATGCTGTCCCACGCCTACGGCCCCGGCGGTTGTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGGCGGCGATGCTGTCCCACGCCTACGGCCCCGGCGGTTGTGGGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGGCGGCCGCCCTGAACGGGGAGCAGGCGGCCCTGCTCCGGAGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCGGCGGCCGCCCTGAACGGGGAGCAGGCGGCCCTGCTCCGGAGAAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGTCAACACCACCGAGTGCGTCCCGGTGCCCAGCTCCGAGCACGTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGTCAACACCACCGAGTGCGTCCCGGTGCCCAGCTCCGAGCACGTCGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGATCGTCGGCCGCCAGG         GTTGTAAAATTAAAGCACTGAG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100151 GAGATCGTCGGCCGCCAGGGTG...CAGGTTGTAAAATTAAAGCACTGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGCCAAGACAAACACGTATATCAAGACTCCTGTTCGTGGTGAAGAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119182 AGCCAAGACAAACACGTATATCAAGACTCCTGTTCGTGGTGAAGAGCCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTTTTGTTGTCACTGGAAGGAAAGAAGATGTTGCCATGGCCAAAAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119232 TTTTTGTTGTCACTGGAAGGAAAGAAGATGTTGCCATGGCCAAAAGAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATCCTCTCAGCTGCAGAGCACTTCTCCATGATTCGTGCATCTCGAAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119282 ATCCTCTCAGCTGCAGAGCACTTCTCCATGATTCGTGCATCTCGAAACAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AAATGGGCCTGCCCTGGGAGGATTATCATGTAGTCCTAATCTGCCCGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119332 AAATGGGCCTGCCCTGGGAGGATTATCATGTAGTCCTAATCTGCCCGGTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AAACCACCGTCCAAGTCAGGGTCCCTTATCGTGTGGTAGGATTAGTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119382 AAACCACCGTCCAAGTCAGGGTCCCTTATCGTGTGGTAGGATTAGTGGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GGACCCAAAGGAGCAACTATTAAAAGAATTCAGCAGCAGACCCACACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119432 GGACCCAAAGGAGCAACTATTAAAAGAATTCAGCAGCAGACCCACACCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CATAGTAACTCCGAGCAGAGATAAGGAACCTGTCTTTGAAGTGACAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119482 CATAGTAACTCCGAGCAGAGATAAGGAACCTGTCTTTGAAGTGACAGGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TGCCTGAAAATGTTGACCGAGCACGGGAAGAAATAGAAATGCATATTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119532 TGCCTGAAAATGTTGACCGAGCACGGGAAGAAATAGAAATGCATATTGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 ATGCGTACAGGAAACTATATAGAGCTCAATGAAGAGAATGATTTCCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119582 ATGCGTACAGGAAACTATATAGAGCTCAATGAAGAGAATGATTTCCATTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CAATGGTACCGATGTAAGCTTTGAAGGTGGCACTCTTGGCTCTGCGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119632 CAATGGTACCGATGTAAGCTTTGAAGGTGGCACTCTTGGCTCTGCGTGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TCTCCTCCAATCCTGTTCCTCCTAGCCGCGCAAGAATGATATCCAATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119682 TCTCCTCCAATCCTGTTCCTCCTAGCCGCGCAAGAATGATATCCAATTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CGAAATGATAGTTCCAGTTCTCTAGGAAGTGGCTCTACAGATTCCTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119732 CGAAATGATAGTTCCAGTTCTCTAGGAAGTGGCTCTACAGATTCCTACTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TGGAAGCAATAGGCTGGCTGACTTTAGTCCAACAAGCCCATTTAGCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119782 TGGAAGCAATAGGCTGGCTGACTTTAGTCCAACAAGCCCATTTAGCACAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GAAACTTCTGGTTTGGAGATACACTACCATCTGTAGGCTCAGAAGACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119832 GAAACTTCTGGTTTGGAGATACACTACCATCTGTAGGCTCAGAAGACCTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GCAGTTGACTCTCCTGCCTTTGACTCTTTACCAACATCTGCTCAAACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119882 GCAGTTGACTCTCCTGCCTTTGACTCTTTACCAACATCTGCTCAAACTAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CTGGACTCCATTTGAACCAGTTAACCCACTCTCTGGCTTTGGGAGTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119932 CTGGACTCCATTTGAACCAGTTAACCCACTCTCTGGCTTTGGGAGTGATC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 CTTCTGGTAACATGAAGACTCAGCGCAGAGGAAGTCAGCCATCTACTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119982 CTTCTGGTAACATGAAGACTCAGCGCAGAGGAAGTCAGCCATCTACTCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CGTCTGTCTCCTACATTTCCTGAGAGCATAGAACATCCACTTGCTCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120032 CGTCTGTCTCCTACATTTCCTGAGAGCATAGAACATCCACTTGCTCGGAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GGTTAGGAGCGACCCACCTAGTACAGGCAACCATGTTGGCCTTCCAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120082 GGTTAGGAGCGACCCACCTAGTACAGGCAACCATGTTGGCCTTCCAATAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 ATATCCCTGCTTTTTCTAATGGTACCAATAGTTACTCCTCTTCCAATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120132 ATATCCCTGCTTTTTCTAATGGTACCAATAGTTACTCCTCTTCCAATGGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 GGTTCCACCTCTAGCTCACCTCCAGAATCAAGACGAAAGCACGACTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120182 GGTTCCACCTCTAGCTCACCTCCAGAATCAAGACGAAAGCACGACTGTGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 GATTTGCTTTGAGAATGAGGTTATTGCTGCCCTAGTTCCATGTGGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120232 GATTTGCTTTGAGAATGAGGTTATTGCTGCCCTAGTTCCATGTGGCCACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 ACCTCTTCTGCATGGAATGTGCCAACAAGATCTGTGAAAAGAGAACGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120282 ACCTCTTCTGCATGGAATGTGCCAACAAGATCTGTGAAAAGAGAACGCCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 TCATGTCCAGTTTGCCAGACAGCTGTTACTCAGGCAATCCAAATTCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120332 TCATGTCCAGTTTGCCAGACAGCTGTTACTCAGGCAATCCAAATTCACTC

   1400 
   1392 T
        |
 120382 T