seq1 = pF1KB7382.tfa, 939 bp
seq2 = pF1KB7382/gi568815584f_21565083.tfa (gi568815584f:21565083_21766021), 200939 bp

>pF1KB7382 939
>gi568815584f:21565083_21766021 (Chr14)

1-939  (100001-100939)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACAGTCTAAACCAAACAAGAGTGACTGAATTTGTCTTCTTGGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACAGTCTAAACCAAACAAGAGTGACTGAATTTGTCTTCTTGGGACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACTGATAACCGGGTGCTGGAAATGCTGTTTTTCATGGCATTCTCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACTGATAACCGGGTGCTGGAAATGCTGTTTTTCATGGCATTCTCAGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTTATATGCTAACGCTTTCAGGGAACATTCTCATCATCATTGCCACAGTC
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTTATATGCTAACGCTTTCGGGGAACATTCTCATCATCATTGCCACAGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTTACTCCAAGTCTCCATACCCCCATGTATTTCTTCCTGAGCAATCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTTACTCCAAGTCTCCATACCCCCATGTATTTCTTCCTGAGCAATCTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTTATTGACATCTGCCACTCATCTGTCACTGTGCCTAAGATGTTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTTATTGACATCTGCCACTCATCTGTCACTGTGCCTAAGATGTTGGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTTTGCTTTTAGAAAGAAAGACCATTTCCTTTGACAACTGCATCACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTTTGCTTTTAGAAAGAAAGACCATTTCCTTTGACAACTGCATCACACAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCTTCTTCCTACATCTCTTTGCCTGTGCCGAGATCTTTCTGCTGATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTCTTCTTCCTACATCTCTTTGCCTGTGCCGAGATCTTTCTGCTGATCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGTGGCGTATGATCGTTACGTGGCTATCTGCACTCCACTCCACTACCCCA
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TATGGCGTATGATCGTTACGTGGCTATCTGCACTCCACTCCACTACCCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGTGATGAACATGAGAGTCTGTATACAGCTTGTCTTTGCTCTCTGGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGTGATGAACATGAGAGTCTGTATACAGCTTGTCTTTGCTCTCTGGTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGGGGTACTGTTCACTCACTAGGGCAGACCTTCTTGACTATTCGTCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGGGGTACTGTTCACTCACTAGGGCAGACCTTCTTGACTATTCGTCTACC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTACTGTGGCCCCAACATTATTGACAGCTACTTCTGTGATGTGCCTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTACTGTGGCCCCAACATTATTGACAGCTACTTCTGTGATGTGCCTCTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTATCAAGCTGGCCTGCACAGATACATACCTCACAGGAATACTGATTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTATCAAGCTGGCCTGCACAGATACATACCTCACAGGAATACTGATTGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACCAATAGTGGAACCATCTCCCTCTCCTGTTTCTTGGCCGTGGTCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACCAATAGTGGAACCATCTCCCTCTCCTGTTTCTTGGCCGTGGTCACCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTATATGGTCATCCTGGTTTCTCTTCGAAAACACTCAGCTGAAGGGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTATATGGTCATCCTGGTTTCTCTTCGAAAACACTCAGCTGAAGGGCGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGAAAGCCCTGTCTACCTGCTCGGCCCACTTCATGGTGGTTGCCCTCTTC
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGAAAGCCCTGTCTACCTGCTCGGCCCACTTCATGGTGGTTGCCCTCTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTTGGGCCATGTATCTTCATCTATACTCGGCCAGACACCAGCTTCTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTTGGGCCATGTATCTTCATCTATACTCGGCCAGACACCAGCTTCTCCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGACAAGGTGGTGTCTGTCTTCTACACAGTGGTCACCCCTTTGCTGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGACAAGGTGGTGTCTGTCTTCTACACAGTGGTCACCCCTTTGCTGAATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCTTCATTTACACCTTGAGGAATGAGGAGGTAAAAAGTGCCATGAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCTTCATTTACACCTTGAGGAATGAGGAGGTAAAAAGTGCCATGAAGCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 CTCAGGCAGAGACAAGTTTTTTTCACGAAATCATATACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTCAGGCAGAGACAAGTTTTTTTCACGAAATCATATACA