seq1 = pF1KB7381.tfa, 1386 bp
seq2 = pF1KB7381/gi568815582f_67064812.tfa (gi568815582f:67064812_67269782), 204971 bp

>pF1KB7381 1386
>gi568815582f:67064812_67269782 (Chr16)

1-123  (100001-100123)   100% ->
124-232  (100711-100819)   100% ->
233-360  (100908-101035)   100% ->
361-485  (101135-101259)   100% ->
486-561  (101509-101584)   100% ->
562-626  (101747-101811)   100% ->
627-729  (102309-102411)   100% ->
730-868  (102650-102788)   100% ->
869-992  (103013-103136)   100% ->
993-1098  (104020-104125)   100% ->
1099-1164  (104225-104290)   100% ->
1165-1234  (104468-104537)   100% ->
1235-1386  (104820-104971)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGGAAGCGCCAGCTGCGCTGCCCACGGAGCCAGGCCCCAGCCCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGGAAGCGCCAGCTGCGCTGCCCACGGAGCCAGGCCCCAGCCCCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCTGCCTTCCTCGGCAAGCTATGGGCGCTGGTGGGGGACCCAGGCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCTGCCTTCCTCGGCAAGCTATGGGCGCTGGTGGGGGACCCAGGCACAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCACCTGATCCGCTGGAGCCCG         AGCGGGACCAGTTTCCTC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100101 ACCACCTGATCCGCTGGAGCCCGGTG...TAGAGCGGGACCAGTTTCCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTAAGCGACCAGAGCCGTTTCGCCAAGGAAGTGCTGCCCCAGTATTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100729 GTAAGCGACCAGAGCCGTTTCGCCAAGGAAGTGCTGCCCCAGTATTTCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCATAGCAACATGGCGAGCTTCGTGCGCCAACTCAACATGT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100779 GCATAGCAACATGGCGAGCTTCGTGCGCCAACTCAACATGTGTG...CAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACGGTTTTCGGAAGGTGGTGAGCATCGAGCAGGGCGGCCTGCTTAGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100908 ACGGTTTTCGGAAGGTGGTGAGCATCGAGCAGGGCGGCCTGCTTAGGCCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGCGCGACCACGTCGAGTTCCAGCACCCGAGCTTCGTGCGCGGCCGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100958 GAGCGCGACCACGTCGAGTTCCAGCACCCGAGCTTCGTGCGCGGCCGCGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCAGCTACTGGAGCGCGTGCGGCGCAAG         GTGCCCGCGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 101008 GCAGCTACTGGAGCGCGTGCGGCGCAAGGTG...CAGGTGCCCGCGCTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCGGCGACGACGGCCGCTGGCGCCCGGAGGACCTGGGTCGACTACTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101148 GCGGCGACGACGGCCGCTGGCGCCCGGAGGACCTGGGTCGACTACTGGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAGGTGCAGGCTTTGCGGGGAGTGCAGGAGAGCACCGAGGCGCGGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101198 GAGGTGCAGGCTTTGCGGGGAGTGCAGGAGAGCACCGAGGCGCGGCTGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGAGCTCAGGCA         GCAGAACGAGATCTTGTGGCGGGAGGTGG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 101248 GGAGCTCAGGCAGTG...CAGGCAGAACGAGATCTTGTGGCGGGAGGTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGACACTTCGGCAGAGCCACGGTCAGCAGCACCGGGTCATTGGCAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 101538 TGACACTTCGGCAGAGCCACGGTCAGCAGCACCGGGTCATTGGCAAGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    562       CTGATCCAGTGTCTCTTTGGGCCACTTCAGGCGGGGCCGAGCAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101588 ...CAGCTGATCCAGTGTCTCTTTGGGCCACTTCAGGCGGGGCCGAGCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGCAGGAGGCAAGAGAAAGCT         GTCCCTGATGCTGGATGAGG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 101791 TGCAGGAGGCAAGAGAAAGCTGTG...CAGGTCCCTGATGCTGGATGAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GGAGCTCATGCCCAACACCTGCCAAGTTCAACACCTGCCCTCTACCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102329 GGAGCTCATGCCCAACACCTGCCAAGTTCAACACCTGCCCTCTACCTGGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GCCCTTCTGCAGGACCCCTACTTCATCCAGTCG         CCTTCTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 102379 GCCCTTCTGCAGGACCCCTACTTCATCCAGTCGGTA...TAGCCTTCTAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TTACAGCCTCTCCCAGAGACAAATTTGGGCCTTAGCCCTCACAGGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102658 TTACAGCCTCTCCCAGAGACAAATTTGGGCCTTAGCCCTCACAGGGCCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GGGCCCCATCATCTCTGACATCCCAGAAGACTCTCCATCCCCTGAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102708 GGGCCCCATCATCTCTGACATCCCAGAAGACTCTCCATCCCCTGAGGGGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CCAGGCTTTCTCCCTCCAGTGATGGCAGGAG         CCCCCCCGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 102758 CCAGGCTTTCTCCCTCCAGTGATGGCAGGAGGTA...CAGCCCCCCCGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 ACTGCCTGTGGCTGTGGTGCAGGCCATCCTGGAAGGGAAAGGGAGCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103023 ACTGCCTGTGGCTGTGGTGCAGGCCATCCTGGAAGGGAAAGGGAGCTTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GCCCCGAGGGGCCCAGGAATGCCCAACAGCCTGAACCAGGGGATCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103073 GCCCCGAGGGGCCCAGGAATGCCCAACAGCCTGAACCAGGGGATCCCAGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GAGATACCTGACAG         GGGGCCTCTGGGCCTGGAAAGCGGGGA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 103123 GAGATACCTGACAGGTG...CAGGGGGCCTCTGGGCCTGGAAAGCGGGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CAGGAGCCCAGAGAGTCTGCTGCCTCCGATGCTGCTTCAGCCCCCTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104047 CAGGAGCCCAGAGAGTCTGCTGCCTCCGATGCTGCTTCAGCCCCCTCAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 AAAGTGTGGAACCTGCAGGGCCTCTAGAT         GTGCTGGGCCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 104097 AAAGTGTGGAACCTGCAGGGCCTCTAGATGTG...CAGGTGCTGGGCCCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 AGTCTCCAAGGGCGAGAATGGACCCTGATGGACTTGGACATGGAGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104237 AGTCTCCAAGGGCGAGAATGGACCCTGATGGACTTGGACATGGAGCTGTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 CTTG         ATGCAGCCCTTGGTTCCAGAGCGGGGTGAGCCTGAGC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104287 CTTGGTA...CAGATGCAGCCCTTGGTTCCAGAGCGGGGTGAGCCTGAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 TGGCGGTCAAGGGGTTAAATTCTCCAAGCCCAG         GGAAGGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 104505 TGGCGGTCAAGGGGTTAAATTCTCCAAGCCCAGGTA...TAGGGAAGGAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 CCCACGCTCGGGGCCCCACTCCTGCTGGATGTCCAGGCGGCCTTGGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104828 CCCACGCTCGGGGCCCCACTCCTGCTGGATGTCCAGGCGGCCTTGGGAGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 CCCAGCCCTGGGCCTGCCTGGGGCTTTAACCATTTATAGCACTCCTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104878 CCCAGCCCTGGGCCTGCCTGGGGCTTTAACCATTTATAGCACTCCTGAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 GCCGGACTGCCTCCTACTTGGGCCCGGAAGCCAGTCCCTCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104928 GCCGGACTGCCTCCTACTTGGGCCCGGAAGCCAGTCCCTCCCCC