seq1 = pF1KB7379.tfa, 540 bp
seq2 = pF1KB7379/gi568815575r_143612038.tfa (gi568815575r:143612038_143820668), 208631 bp

>pF1KB7379 540
>gi568815575r:143612038_143820668 (ChrX)

(complement)

1-78  (100001-100078)   100% ->
79-540  (108170-108631)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAACAGCCGACTTCAAGCACCAATGGGGAGAAGAGGAAGAGCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAACAGCCGACTTCAAGCACCAATGGGGAGAAGAGGAAGAGCCCCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGAATCCAATAACAAAAAAAATGATGAG         ATGCAGGAGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100051 TGAATCCAATAACAAAAAAAATGATGAGGTA...CAGATGCAGGAGGCAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGAACAGGGTCTTAGCCCCCAAACAGAGCTTGCAAAAGACAAAAACAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108183 CGAACAGGGTCTTAGCCCCCAAACAGAGCTTGCAAAAGACAAAAACAATA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAATATCTAACAATAATAGTGTATTACTACAGGAAGCATACGAAAATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108233 GAATATCTAACAATAATAGTGTATTACTACAGGAAGCATACGAAAATAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTCAAATCAACTGGAGAAGGACCAGTCCCGAGAGAACTCCATCAATCCCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 108283 TTCAAATCAACTGGAGAAGGACCAGTCCCGAGAGAACTCCATCAATCCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCCAAGAGGAGGAGGACGAAGGCCTAGACTCAGCTGAAGGATCTTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108333 TCCAAGAGGAGGAGGACGAAGGCCTAGACTCAGCTGAAGGATCTTCACAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAGGACGAAGACCTGGACTCATCTGAAGGATCTTCACAGGAGGACGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108383 GAGGACGAAGACCTGGACTCATCTGAAGGATCTTCACAGGAGGACGAAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCTGGACTCATCTGAAGGATCTTCACAGGAGGACGAAGACCTGGACTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108433 CCTGGACTCATCTGAAGGATCTTCACAGGAGGACGAAGACCTGGACTCAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CTGAAGGATCTTCACAGGAGGACGAAGACCTGGACTCATCTGAAGGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108483 CTGAAGGATCTTCACAGGAGGACGAAGACCTGGACTCATCTGAAGGATCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TCACAGGAGGACGAAGACCTGGACCCACCTGAAGGATCTTCACAGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108533 TCACAGGAGGACGAAGACCTGGACCCACCTGAAGGATCTTCACAGGAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    492 CGAAGACCTAGACTCATCTGAAGGATCTTCACAGGAGGGTGGGGAGGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108583 CGAAGACCTAGACTCATCTGAAGGATCTTCACAGGAGGGTGGGGAGGAC