seq1 = pF1KB7378.tfa, 834 bp
seq2 = pF1KB7378/gi568815589r_38311403.tfa (gi568815589r:38311403_38524358), 212956 bp

>pF1KB7378 834
>gi568815589r:38311403_38524358 (Chr9)

(complement)

1-460  (99935-100394)   100% ->
461-570  (110156-110265)   100% ->
571-687  (111006-111122)   100% ->
688-834  (112810-112956)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGCGCTTGTCTCTGCTCTTGCCGCTGCTGCTTCTGCTGCTGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99935 ATGCCGCGCTTGTCTCTGCTCTTGCCGCTGCTGCTTCTGCTGCTGCTGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCTGCCGCCGCTGTCCCCGAGCCTTGGGATCCGCGACGTGGGCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99985 GCTGCTGCCGCCGCTGTCCCCGAGCCTTGGGATCCGCGACGTGGGCGGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCGCCCCAAGTGTGGTCCGTGCCGGCCAGAGGGCTGCCCGGCGCCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100035 GGCGCCCCAAGTGTGGTCCGTGCCGGCCAGAGGGCTGCCCGGCGCCTGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCTGCCCGGCGCCCGGGATCTCGGCGCTCGACGAGTGCGGCTGCTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100085 CCCTGCCCGGCGCCCGGGATCTCGGCGCTCGACGAGTGCGGCTGCTGCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGCTGCCTGGGAGCCGAGGGCGCGAGCTGCGGGGGCCGCGCCGGCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100135 CCGCTGCCTGGGAGCCGAGGGCGCGAGCTGCGGGGGCCGCGCCGGCGGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCTGTGGCCCCGGCCTGGTATGCGCGAGCCAGGCCGCTGGGGCAGCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100185 GCTGTGGCCCCGGCCTGGTATGCGCGAGCCAGGCCGCTGGGGCAGCGCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGGGCACCGGGCTCTGCGTGTGCGCGCAGCGCGGCACCGTCTGCGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100235 GAGGGCACCGGGCTCTGCGTGTGCGCGCAGCGCGGCACCGTCTGCGGCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGACGGTCGCTCGTACCCCAGCGTCTGCGCGCTGCGCCTGCGCGCTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100285 CGACGGTCGCTCGTACCCCAGCGTCTGCGCGCTGCGCCTGCGCGCTCGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACACGCCCCGCGCGCACCCCGGTCACCTGCACAAGGCGCGCGACGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100335 ACACGCCCCGCGCGCACCCCGGTCACCTGCACAAGGCGCGCGACGGCCCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TGCGAGTTCG         CTCCTGTGGTCGTCGTTCCTCCCCGAAGTGT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100385 TGCGAGTTCGGTG...TAGCTCCTGTGGTCGTCGTTCCTCCCCGAAGTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TCACAACGTCACCGGGGCGCAGGTGGGCCTGTCCTGTGAAGTGAGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110187 TCACAACGTCACCGGGGCGCAGGTGGGCCTGTCCTGTGAAGTGAGGGCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TGCCTACCCCAGTCATCACGTGGAGAAAG         GTCACGAAGTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 110237 TGCCTACCCCAGTCATCACGTGGAGAAAGGTA...TAGGTCACGAAGTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CCTGAGGGCACCCAAGCACTGGAGGAGCTGCCTGGGGACCATGTCAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111018 CCTGAGGGCACCCAAGCACTGGAGGAGCTGCCTGGGGACCATGTCAATAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 AGCTGTCCAAGTGCGAGGGGGCCCTTCTGACCATGAGGCCACGGCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111068 AGCTGTCCAAGTGCGAGGGGGCCCTTCTGACCATGAGGCCACGGCCTGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TTTTG         ATCAACCCCCTGCGAAAGGAGGATGAGGGTGTGTAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111118 TTTTGGTG...TAGATCAACCCCCTGCGAAAGGAGGATGAGGGTGTGTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CAGTGCCATGCAGCCAACATGGTGGGAGAGGCTGAGTCCCACAGCACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112846 CAGTGCCATGCAGCCAACATGGTGGGAGAGGCTGAGTCCCACAGCACAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GACGGTTCTAGATCTGAGTAAATACAGGAGCTTCCACTTCCCAGCTCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112896 GACGGTTCTAGATCTGAGTAAATACAGGAGCTTCCACTTCCCAGCTCCCG

    850     .    :
    824 ATGACCGCATG
        |||||||||||
 112946 ATGACCGCATG