seq1 = pF1KB7369.tfa, 954 bp
seq2 = pF1KB7369/gi568815589r_104517251.tfa (gi568815589r:104517251_104718204), 200954 bp

>pF1KB7369 954
>gi568815589r:104517251_104718204 (Chr9)

(complement)

1-954  (100001-100954)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAATGGGAAAACCAAACCATTCTGGTGGAATTTTTTCTGAAGGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAATGGGAAAACCAAACCATTCTGGTGGAATTTTTTCTGAAGGGACA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTCTGTTCACCCAAGGCTTGAGTTACTCTTTTTTGTGCTAATCTTCATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTCTGTTCACCCAAGGCTTGAGTTACTCTTTTTTGTGCTAATCTTCATAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTATGTGGTCATCCTTCTGGGGAATGGTACTCTCATTTTAATCAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTATGTGGTCATCCTTCTGGGGAATGGTACTCTCATTTTAATCAGCATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGGACCCTCACCTTCACACCCCTATGTACTTCTTTCTGGGGAACCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGGACCCTCACCTTCACACCCCTATGTACTTCTTTCTGGGGAACCTCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTCTTGGACATCTGCTACACCACCACCTCTATTCCCTCCACACTAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTCTTGGACATCTGCTACACCACCACCTCTATTCCCTCCACACTAGTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCTTCCTTTCAGAAAGAAAGACCATTTCCTTTTCTGGCTGTGCAGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCTTCCTTTCAGAAAGAAAGACCATTTCCTTTTCTGGCTGTGCAGTGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGTTCCTTGGCTTGGCCATGGGGACAACAGAGTGTGTGCTTCTGGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGTTCCTTGGCTTGGCCATGGGGACAACAGAGTGTGTGCTTCTGGGCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATGGCCTTTGACCGCTATGTGGCTATCTGCAACCCTCTGAGATATCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GATGGCCTTTGACCGCTATGTGGCTATCTGCAACCCTCTGAGATATCCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCATCATGAGCAAGAATGCCTATGTACCCATGGCTGTTGGGTCCTGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCATCATGAGCAAGAATGCCTATGTACCCATGGCTGTTGGGTCCTGGTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCAGGGATTGTCAACTCTGCAGTACAAACTACATTTGTAGTACAATTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCAGGGATTGTCAACTCTGCAGTACAAACTACATTTGTAGTACAATTGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTTCTGCAGGAAGAATGTCATCAATCATTTCTCATGTGAAATTCTAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTTCTGCAGGAAGAATGTCATCAATCATTTCTCATGTGAAATTCTAGCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCATGAAGTTGGCCTGTGCTGACATCTCAGGCAATGAGTTCCTCATGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCATGAAGTTGGCCTGTGCTGACATCTCAGGCAATGAGTTCCTCATGCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTGGCCACAATATTGTTCACATTGATGCCACTGCTCTTGATAGTTATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTGGCCACAATATTGTTCACATTGATGCCACTGCTCTTGATAGTTATCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTACTCATTAATCATTTCCAGCATCCTCAAGATTCACTCCTCTGAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTACTCATTAATCATTTCCAGCATCCTCAAGATTCACTCCTCTGAGGGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GAAGCAAAGCTTTCTCTACCTGCTCAGCCCATCTGACTGTGGTCATAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GAAGCAAAGCTTTCTCTACCTGCTCAGCCCATCTGACTGTGGTCATAATA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTATGGGACCATCCTCTTCATGTATATGAAGCCCAAGTCTAAAGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTATGGGACCATCCTCTTCATGTATATGAAGCCCAAGTCTAAAGAGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 ACTTAATTCAGATGACTTGGATGCTACCGACAAAATTATATCCATGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 ACTTAATTCAGATGACTTGGATGCTACCGACAAAATTATATCCATGTTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATGGGGTGATGACTCCCATGATGAATCCTTTAATCTACAGTCTTAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATGGGGTGATGACTCCCATGATGAATCCTTTAATCTACAGTCTTAGAAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AAGGATGTGAAAGAGGCAGTAAAACACCTACCGAACAGAAGGTTCTTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAGGATGTGAAAGAGGCAGTAAAACACCTACCGAACAGAAGGTTCTTTAG

    950 
    951 CAAG
        ||||
 100951 CAAG