seq1 = pF1KB7362.tfa, 756 bp
seq2 = pF1KB7362/gi568815596r_240026566.tfa (gi568815596r:240026566_240236347), 209782 bp

>pF1KB7362 756
>gi568815596r:240026566_240236347 (Chr2)

(complement)

1-156  (100001-100156)   100% ->
157-229  (102343-102415)   100% ->
230-263  (105260-105293)   100% ->
264-381  (106320-106437)   100% ->
382-756  (109408-109782)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGCGCGCGCCGGAAGCGGCTCTGAGGCCGGAAGTGAGCCTAGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGCGCGCGCCGGAAGCGGCTCTGAGGCCGGAAGTGAGCCTAGAGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCGGCCCCGAGATGAAGCCGGCGGTGGACGAGATGTTCCCCGAGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGCGGCCCCGAGATGAAGCCGGCGGTGGACGAGATGTTCCCCGAGGGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGGGCCCTACGTGGACCTGGACGAGGTGGCACGGGCCCGGCGGGAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGGGCCCTACGTGGACCTGGACGAGGTGGCACGGGCCCGGCGGGAGTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCGAGC         GCGGGAGGCAGCACCGGGCTCTTGATGGACTTGGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCGAGCGTG...CAGGCGGGAGGCAGCACCGGGCTCTTGATGGACTTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGCCAATGAAAAGGCCGTTCATGCAGACTTTTTTAACG         ATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 102378 AGCCAATGAAAAGGCCGTTCATGCAGACTTTTTTAACGGTA...TAGATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGAAGATCTTTTTGATGATGATGACATCCA         CAGCTCAGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 105263 TTGAAGATCTTTTTGATGATGATGACATCCAGTG...CAGCAGCTCAGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CTGCCCAGGACAAGCCAGCAGTCCTCCATGGTTCCCGCACTGCAGCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106330 CTGCCCAGGACAAGCCAGCAGTCCTCCATGGTTCCCGCACTGCAGCGAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCAGTCGGAGCACGGGGTCCGTGGGAAGGCAGCAGAGCGGCCTGTGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106380 GCAGTCGGAGCACGGGGTCCGTGGGAAGGCAGCAGAGCGGCCTGTGGTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CGGAAGAG         AGATGTGAACTGAACGGGAGAGAAGTGGCAGCT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 106430 CGGAAGAGGTA...CAGAGATGTGAACTGAACGGGAGAGAAGTGGCAGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TTGGACAGAGCGTTTGGGAGCACAGGCCATGGGCAGGGGGCGGAGGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109441 TTGGACAGAGCGTTTGGGAGCACAGGCCATGGGCAGGGGGCGGAGGCGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AATGTTTACCAGATGCAGAGAACATCCGCTGTGTGGCACCAACAAAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109491 AATGTTTACCAGATGCAGAGAACATCCGCTGTGTGGCACCAACAAAGCAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CAAGTGAGGGGAAAATGGGCACAGGACGCTTAAGAAACAGTTTACGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109541 CAAGTGAGGGGAAAATGGGCACAGGACGCTTAAGAAACAGTTTACGGAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AACCAATCCAAGTGGCTGGGAAGTTATCTAGAGGTGCTCAGAACCACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109591 AACCAATCCAAGTGGCTGGGAAGTTATCTAGAGGTGCTCAGAACCACAAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AAGCAGGCGAGAGGTCAGCGAAGACAGCACAATATCAGTTTCTACTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109641 AAGCAGGCGAGAGGTCAGCGAAGACAGCACAATATCAGTTTCTACTCACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GGAGGGGTAAATGTTTTAAGAGTGATGAAACACCATCCGTTGCTGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109691 GGAGGGGTAAATGTTTTAAGAGTGATGAAACACCATCCGTTGCTGGTGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GAAGAAGGGAAGAAGACCACACAGCCATGCATAGATGTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109741 GAAGAAGGGAAGAAGACCACACAGCCATGCATAGATGTGAGG