seq1 = pF1KB7358.tfa, 1257 bp
seq2 = pF1KB7358/gi568815593r_146414857.tfa (gi568815593r:146414857_146616113), 201257 bp

>pF1KB7358 1257
>gi568815593r:146414857_146616113 (Chr5)

(complement)

1-1257  (100001-101257)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGCAGCTGCCTTTGCAGACTCTAACTCCAGCAGCATGAATGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGGCAGCTGCCTTTGCAGACTCTAACTCCAGCAGCATGAATGTGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTTGCTCACCTCCACTTTGCCGGAGGGTACCTGCCCTCTGATTCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTTGCTCACCTCCACTTTGCCGGAGGGTACCTGCCCTCTGATTCCCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTGGAGAACCATCATCCCGGCTCTCTTGGTGGCTGTCTGCCTGGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTGGAGAACCATCATCCCGGCTCTCTTGGTGGCTGTCTGCCTGGTGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCGTGGGAAACCTGTGTGTGATTGGCATCCTCCTTCACAATGCTTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCGTGGGAAACCTGTGTGTGATTGGCATCCTCCTTCACAATGCTTGGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGGAAAGCCATCCATGATCCACTCCCTGATTCTGAATCTCAGCCTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGGAAAGCCATCCATGATCCACTCCCTGATTCTGAATCTCAGCCTGGCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATCTCTCCCTCCTGCTGTTTTCTGCACCTATCCGAGCTACGGCGTACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATCTCTCCCTCCTGCTGTTTTCTGCACCTATCCGAGCTACGGCGTACTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAAAGTGTTTGGGATCTAGGCTGGTTTGTCTGCAAGTCCTCTGACTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAAAGTGTTTGGGATCTAGGCTGGTTTGTCTGCAAGTCCTCTGACTGGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TATCCACACATGCATGGCAGCCAAGAGCCTGACAATCGTTGTGGTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TATCCACACATGCATGGCAGCCAAGAGCCTGACAATCGTTGTGGTGGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AAGTATGCTTCATGTATGCAAGTGACCCAGCCAAGCAAGTGAGTATCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AAGTATGCTTCATGTATGCAAGTGACCCAGCCAAGCAAGTGAGTATCCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AACTACACCATCTGGTCAGTGCTGGTGGCCATCTGGACTGTGGCTAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AACTACACCATCTGGTCAGTGCTGGTGGCCATCTGGACTGTGGCTAGCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTTACCCCTGCCGGAATGGTTCTTTAGCACCATCAGGCATCATGAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTTACCCCTGCCGGAATGGTTCTTTAGCACCATCAGGCATCATGAAGGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGGAAATGTGCCTCGTGGATGTACCAGCTGTGGCTGAAGAGTTTATGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGGAAATGTGCCTCGTGGATGTACCAGCTGTGGCTGAAGAGTTTATGTCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATGTTTGGTAAGCTCTACCCACTCCTGGCATTTGGCCTTCCATTATTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATGTTTGGTAAGCTCTACCCACTCCTGGCATTTGGCCTTCCATTATTTTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGCCAGCTTTTATTTCTGGAGAGCTTATGACCAATGTAAAAAACGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGCCAGCTTTTATTTCTGGAGAGCTTATGACCAATGTAAAAAACGAGGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTAAGACTCAAAATCTTAGAAACCAGATACGCTCAAAGCAAGTCACAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CTAAGACTCAAAATCTTAGAAACCAGATACGCTCAAAGCAAGTCACAGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATGCTGCTGAGCATTGCCATCATCTCTGCTCTCTTGTGGCTCCCCGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATGCTGCTGAGCATTGCCATCATCTCTGCTCTCTTGTGGCTCCCCGAATG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGTAGCTTGGCTGTGGGTATGGCATCTGAAGGCTGCAGGCCCGGCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGTAGCTTGGCTGTGGGTATGGCATCTGAAGGCTGCAGGCCCGGCCCCAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CACAAGGTTTCATAGCCCTGTCTCAAGTCTTGATGTTTTCCATCTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CACAAGGTTTCATAGCCCTGTCTCAAGTCTTGATGTTTTCCATCTCTTCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GCAAATCCTCTCATTTTTCTTGTGATGTCGGAAGAGTTCAGGGAAGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GCAAATCCTCTCATTTTTCTTGTGATGTCGGAAGAGTTCAGGGAAGGCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GAAAGGTGTATGGAAATGGATGATAACCAAAAAACCTCCAACTGTCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GAAAGGTGTATGGAAATGGATGATAACCAAAAAACCTCCAACTGTCTCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGTCTCAGGAAACACCAGCTGGCAACTCAGAGGGTCTTCCTGACAAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGTCTCAGGAAACACCAGCTGGCAACTCAGAGGGTCTTCCTGACAAGGTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CCATCTCCAGAATCCCCAGCATCCATACCAGAAAAAGAGAAACCCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CCATCTCCAGAATCCCCAGCATCCATACCAGAAAAAGAGAAACCCAGCTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TCCCTCCTCTGGCAAAGGGAAAACTGAGAAGGCAGAGATTCCCATCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TCCCTCCTCTGGCAAAGGGAAAACTGAGAAGGCAGAGATTCCCATCCTTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CTGACGTAGAGCAGTTTTGGCATGAGAGGGACACAGTCCCTTCTGTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CTGACGTAGAGCAGTTTTGGCATGAGAGGGACACAGTCCCTTCTGTACAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GACAATGACCCTATCCCCTGGGAACATGAAGATCAAGAGACAGGGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GACAATGACCCTATCCCCTGGGAACATGAAGATCAAGAGACAGGGGAAGG

   1250     .
   1251 TGTTAAA
        |||||||
 101251 TGTTAAA