seq1 = pF1KB7356.tfa, 3531 bp
seq2 = pF1KB7356/gi568815579f_32631723.tfa (gi568815579f:32631723_32921180), 289458 bp

>pF1KB7356 3531
>gi568815579f:32631723_32921180 (Chr19)

1-24  (88351-88374)   100% ->
25-183  (100003-100161)   100% ->
184-320  (107134-107270)   100% ->
321-440  (111059-111178)   100% ->
441-496  (116754-116809)   100% ->
497-582  (118062-118147)   100% ->
583-772  (124270-124459)   100% ->
773-865  (125316-125408)   100% ->
866-963  (141031-141128)   100% ->
964-1040  (141734-141810)   100% ->
1041-1121  (145427-145507)   100% ->
1122-1182  (158809-158869)   100% ->
1183-1287  (159242-159346)   100% ->
1288-1473  (162906-163091)   100% ->
1474-1630  (166013-166169)   100% ->
1631-1758  (166586-166713)   100% ->
1759-1950  (168445-168636)   100% ->
1951-2079  (168922-169050)   100% ->
2080-2197  (170034-170151)   100% ->
2198-2331  (170934-171067)   100% ->
2332-2552  (171200-171420)   100% ->
2553-2652  (175827-175926)   100% ->
2653-2837  (178371-178555)   100% ->
2838-3048  (179488-179698)   100% ->
3049-3141  (181962-182054)   100% ->
3142-3314  (183726-183898)   100% ->
3315-3383  (186367-186435)   100% ->
3384-3531  (189311-189458)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTCCAGCTCCTGGTGCTGAAG         ATTGAAGATCCAGGTTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
  88351 ATGCTCCAGCTCCTGGTGCTGAAGGTG...CAGATTGAAGATCCAGGTTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CTTCTGGGTTATTATAAAAGGGTGTAGTCCCTTTTTAGATCATGATGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100020 CTTCTGGGTTATTATAAAAGGGTGTAGTCCCTTTTTAGATCATGATGTCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATTATCAAAAATTAAATAGTGCCATGAATGACTTCTACAACAGCACGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100070 ATTATCAAAAATTAAATAGTGCCATGAATGACTTCTACAACAGCACGTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAAGATATAGAAATAAAACCCTTAACATTGGAAGAAGGACAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100120 CAAGATATAGAAATAAAACCCTTAACATTGGAAGAAGGACAGGTA...CA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    184  GTGTGTGTGGTCTATTGTGAGGAGCTAAAGTGCTGGTGCAGGGCCATTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107133 GGTGTGTGTGGTCTATTGTGAGGAGCTAAAGTGCTGGTGCAGGGCCATTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCAAATCAATTACGTCTTCCGCAGACCAGTACCTGGCAGAATGTTTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107183 TCAAATCAATTACGTCTTCCGCAGACCAGTACCTGGCAGAATGTTTCCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTGGACTTTGCCAAGAACATTCCAGTCAAATCTAAAAA         CAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 107233 GTGGACTTTGCCAAGAACATTCCAGTCAAATCTAAAAAGTA...TAGCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCGAGTTGTAGTAGAATCGTTTATGCAGCTTCCCTATAGAGCAAAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111062 CCGAGTTGTAGTAGAATCGTTTATGCAGCTTCCCTATAGAGCAAAAAAAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCAGCCTGTACTGCACAAAGCCTGTCACATTACACATTGACTTCTGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111112 TCAGCCTGTACTGCACAAAGCCTGTCACATTACACATTGACTTCTGCCGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GACAGTACTGACATTGT         ACCTGCCAAGAAGTGGGACAATGC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 111162 GACAGTACTGACATTGTGTA...CAGACCTGCCAAGAAGTGGGACAATGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AGCTATTCAGTACTTTCAGAACCTTCTGAAAG         CAACTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 116778 AGCTATTCAGTACTTTCAGAACCTTCTGAAAGGTA...TAGCAACTACCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AGGTGGAAGCCAGATTATGTGCTGTGGAAGAAGATACATTTGAGGTTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118071 AGGTGGAAGCCAGATTATGTGCTGTGGAAGAAGATACATTTGAGGTTTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CTTTATGTAACTATAAAAGATGAAAAA         GTTTGTGTTAATGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 118121 CTTTATGTAACTATAAAAGATGAAAAAGTA...CAGGTTTGTGTTAATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 TGATCTTGTTGCAAAGAACTATGCTTGTTATATGTCACCTACAAAGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124284 TGATCTTGTTGCAAAGAACTATGCTTGTTATATGTCACCTACAAAGAATA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AAAACCTTGATTATTTAGAAAAACCAAGATTGAATATAAAATCAGCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124334 AAAACCTTGATTATTTAGAAAAACCAAGATTGAATATAAAATCAGCACCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TCCTTCAATAAACTCAATCCAGCACTTACACTCTGGCCAATGTTTTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124384 TCCTTCAATAAACTCAATCCAGCACTTACACTCTGGCCAATGTTTTTGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AGGAAAAGATGTTCAAGGAATGGAAG         ATTCACATGGTGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 124434 AGGAAAAGATGTTCAAGGAATGGAAGGTG...CAGATTCACATGGTGTAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 ATTTTCCGGCACAATCTCTGCAACATACATGGTGCAAGGGTATTGTCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125331 ATTTTCCGGCACAATCTCTGCAACATACATGGTGCAAGGGTATTGTCGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GACCTCAGGCCAACAGCCACAGCACAGG         ACAAAGCTGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 125381 GACCTCAGGCCAACAGCCACAGCACAGGGTG...CAGACAAAGCTGTAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 ATGTAATATGGATTCATTGAGAGATTCACCTAAAGACAAATCTGAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141044 ATGTAATATGGATTCATTGAGAGATTCACCTAAAGACAAATCTGAAAAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 AACACCATTGCATCTCTTTAAAAGATACAAATAAG         CGTGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 141094 AACACCATTGCATCTCTTTAAAAGATACAAATAAGGTT...CAGCGTGTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GAATCCTCAGTGTACTGGCCAGCAAAAAGAGGCATAACCATATATGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141740 GAATCCTCAGTGTACTGGCCAGCAAAAAGAGGCATAACCATATATGCTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TCCAGATGTACCAGAAGCAAG         TGCTTTAAGTCAGAAGTCAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 141790 TCCAGATGTACCAGAAGCAAGGTA...TAGTGCTTTAAGTCAGAAGTCAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 ATGAGAAACCTCTTAGATTGACTGAGAAGAAAGAATATGATGAGAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145447 ATGAGAAACCTCTTAGATTGACTGAGAAGAAAGAATATGATGAGAAGAAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 AGCTGTGTGAA         ATTACTGCAGTTTTTAAATCCTGATCCTTT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 145497 AGCTGTGTGAAGTA...CAGATTACTGCAGTTTTTAAATCCTGATCCTTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 GAGAGCTGACGGAATCTCTGATCTCCAGCAG         TTGCAGAAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 158839 GAGAGCTGACGGAATCTCTGATCTCCAGCAGGTA...CAGTTGCAGAAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 TGAAGGGCCTGCAGCCGCCCGTGGTAGTGCTCCGGAACAAGATCAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159252 TGAAGGGCCTGCAGCCGCCCGTGGTAGTGCTCCGGAACAAGATCAAGCCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 TGCTTAACCATTGACTCGTCGCCGCTGTCAGCAGACCTGAAGAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 159302 TGCTTAACCATTGACTCGTCGCCGCTGTCAGCAGACCTGAAGAAGGTA..

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288     GCTCTTCAAAGAAATAAGTTTCCGGGCCCCAGCCACACTGAATCTT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159352 .TAGGCTCTTCAAAGAAATAAGTTTCCGGGCCCCAGCCACACTGAATCTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1334 ACTCTTGGCCTCCCATAGCGCGTGGCTGTGATGTGGTTGTCATTTCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162952 ACTCTTGGCCTCCCATAGCGCGTGGCTGTGATGTGGTTGTCATTTCTCAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 TGTGAAAGCAACCCTTTGCTCTACCTCCTACCAGTGTTGACAGTTTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163002 TGTGAAAGCAACCCTTTGCTCTACCTCCTACCAGTGTTGACAGTTTTGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 AACAGGAGCCTGCTACAAGTCATTACCAAGTAGAAATGGA         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 163052 AACAGGAGCCTGCTACAAGTCATTACCAAGTAGAAATGGAGTA...CAGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1475 CTCTCGCAGTCATCGTGTGCCCTGGGTGGAAGAAGGCCCAATTTATTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166014 CTCTCGCAGTCATCGTGTGCCCTGGGTGGAAGAAGGCCCAATTTATTTTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 GAATTATTGGGAGAATATAGCATGTCCTCCAGGCCTCTTCATCCTGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166064 GAATTATTGGGAGAATATAGCATGTCCTCCAGGCCTCTTCATCCTGTGCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 ATTAACAATTGGGCTCCATAAAGAGGAAGCCAAAAATACAAAGCTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166114 ATTAACAATTGGGCTCCATAAAGAGGAAGCCAAAAATACAAAGCTTCCAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 GGGGCT         GTGATGTGATTGTTACGACCCCATACAGCCTGCTG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166164 GGGGCTGTA...CAGGTGATGTGATTGTTACGACCCCATACAGCCTGCTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 AGGCTTCTCGCCTGTCAGAGCCTGCTGTTCCTCAGGCTCTGCCACCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166621 AGGCTTCTCGCCTGTCAGAGCCTGCTGTTCCTCAGGCTCTGCCACCTGAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 CCTGGATGAGGTAGAGGTGCTATTCTTGGAAGCCAATGAACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 166671 CCTGGATGAGGTAGAGGTGCTATTCTTGGAAGCCAATGAACAGGTG...C

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1759   ATGTTTGCTATATTAGATAACTTTAAAAAAAATATTGAAGTTGAAGAA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168443 AGATGTTTGCTATATTAGATAACTTTAAAAAAAATATTGAAGTTGAAGAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1807 AGGGAATCTGCACCACATCAGATTGTTGCAGTTGGAGTTCATTGGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168493 AGGGAATCTGCACCACATCAGATTGTTGCAGTTGGAGTTCATTGGAACAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 ACATATAGAACATCTCATCAAAGAGTTCATGAATGATCCCTACATTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168543 ACATATAGAACATCTCATCAAAGAGTTCATGAATGATCCCTACATTGTGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 TCACAGCCATGGAAGAGGCTGCTCTCTATGGCAATGTCCAACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 168593 TCACAGCCATGGAAGAGGCTGCTCTCTATGGCAATGTCCAACAGGTA...

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951    GTAGTACATCTTTGCCTAGAATGTGAAAAAACTTCTTCTTTACTCCA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168919 CAGGTAGTACATCTTTGCCTAGAATGTGAAAAAACTTCTTCTTTACTCCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 AGCTCTTGATTTTATTCCAAGTCAGGCACAAAAGACCTTGATCTTCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168969 AGCTCTTGATTTTATTCCAAGTCAGGCACAAAAGACCTTGATCTTCACCT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 GCTCTGTAGCTGAAACAGAAATAGTGTGTAAG         GTAGTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 169019 GCTCTGTAGCTGAAACAGAAATAGTGTGTAAGGTG...TAGGTAGTAGAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2089 AGCAGTTCAATATTTTGCTTGAAGATGCATAAAGAAATGATTTTTAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170043 AGCAGTTCAATATTTTGCTTGAAGATGCATAAAGAAATGATTTTTAACTT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2139 ACAAAATGTTTTAGAACAGTGGAAGAAGAAGTTAAGTTCTGGCTCTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170093 ACAAAATGTTTTAGAACAGTGGAAGAAGAAGTTAAGTTCTGGCTCTCAAA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2189 TTATATTAG         CCCTCACAGACGACTGCGTCCCACTCTTGGCC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 170143 TTATATTAGGTA...CAGCCCTCACAGACGACTGCGTCCCACTCTTGGCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2230 ATCACCGATGCCACGTGTGTGATTCACTTCAGTTTCCCTGCCTCACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170966 ATCACCGATGCCACGTGTGTGATTCACTTCAGTTTCCCTGCCTCACCAAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2280 AGTTTTTGGTGGACGCCTGTATTGCATGTCTGATCATTTTCACGCTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171016 AGTTTTTGGTGGACGCCTGTATTGCATGTCTGATCATTTTCACGCTGAAC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2330 AG         GGTTCTCCTGCAGAACAGGGAGATAAGAAAGCCAAATCT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171066 AGGTT...CAGGGTTCTCCTGCAGAACAGGGAGATAAGAAAGCCAAATCT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2371 GTCTTGCTGCTGACGGAGAAAGATGCGAGCCATGCGGTGGGCGTCCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171239 GTCTTGCTGCTGACGGAGAAAGATGCGAGCCATGCGGTGGGCGTCCTGCG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2421 CTACTTGGAGCGAGCGGACGCCAAGGTCCCCGCAGAGCTGTACGAGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171289 CTACTTGGAGCGAGCGGACGCCAAGGTCCCCGCAGAGCTGTACGAGTTCA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2471 CCGCAGGAGTTCTGGAAGCCAAAGAAGATAAGAAAGCCGGAAGGCCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171339 CCGCAGGAGTTCTGGAAGCCAAAGAAGATAAGAAAGCCGGAAGGCCTCTT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2521 TGTCCATATCTGAAGGCTTTTGGTTTTTGCAA         AGACAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 171389 TGTCCATATCTGAAGGCTTTTGGTTTTTGCAAGTG...CAGAGACAAAAG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2562 GATCTGTCCTGACCGACACCGTATTAATCCAGAAACGGACTTGCCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175836 GATCTGTCCTGACCGACACCGTATTAATCCAGAAACGGACTTGCCCAGGA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2612 AACTGTCCAGCCAAGCCCTACCTTCATTTGGATACATTAAA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 175886 AACTGTCCAGCCAAGCCCTACCTTCATTTGGATACATTAAAGTA...CAG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2653 ATAATACCTTTTTATATTTTGAATGCAACAAATTACTTTGGCCGTATAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178371 ATAATACCTTTTTATATTTTGAATGCAACAAATTACTTTGGCCGTATAGT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2703 TGATAAACACATGGATCTTTATGCAACTCTCAATGCTGAAATGAATGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178421 TGATAAACACATGGATCTTTATGCAACTCTCAATGCTGAAATGAATGAGT

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2753 ATTTTAAGGATTCTAATAAAACAACTGTGGAAAAGGTGGAGAAGTTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178471 ATTTTAAGGATTCTAATAAAACAACTGTGGAAAAGGTGGAGAAGTTTGGA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2803 TTGTATGGATTAGCAGAAAAAACGCTTTTTCACAG         GGTTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 178521 TTGTATGGATTAGCAGAAAAAACGCTTTTTCACAGGTA...CAGGGTTCA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2844 GGTGTTGGAAGTGAACCAAAAAGAAGACGCCTGGGCCCTGGATGACATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179494 GGTGTTGGAAGTGAACCAAAAAGAAGACGCCTGGGCCCTGGATGACATCC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2894 TTGTAGAGTTCATCGATGAAGGCAGGACGGGGCTCGTCACAAGGGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179544 TTGTAGAGTTCATCGATGAAGGCAGGACGGGGCTCGTCACAAGGGACCAG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2944 CTGCTGCATCTCCCAGAACATTTCCACACACTTCCCCCGCAGGCTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179594 CTGCTGCATCTCCCAGAACATTTCCACACACTTCCCCCGCAGGCTGTGGA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2994 GTTTATTGTCTGTAGGGTGAAACCTGCTGACAACGAAATAGAATGGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179644 GTTTATTGTCTGTAGGGTGAAACCTGCTGACAACGAAATAGAATGGAATC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3044 CGAAG         GTTACTAGGTACATTCATCATAAAATTGTTGGAAAA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179694 CGAAGGTG...CAGGTTACTAGGTACATTCATCATAAAATTGTTGGAAAA

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3085 TTGCATGATGCAAAAGTGATCCTGGCTTTGGGAAATACAGTTTGGATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181998 TTGCATGATGCAAAAGTGATCCTGGCTTTGGGAAATACAGTTTGGATTGA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3135 TCCAATG         GTGCACATTACAAACCTTTCCAGTTTAAAAACCT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182048 TCCAATGGTA...AAGGTGCACATTACAAACCTTTCCAGTTTAAAAACCT

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3176 CTGTCATTGATTATAATGTTCGAGCTGAAATTTTGTCCATGGGCATGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183760 CTGTCATTGATTATAATGTTCGAGCTGAAATTTTGTCCATGGGCATGGGC

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3226 ATTGATAATCCAGAACACATAGAACAACTGAAAAAATTACGCGAAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183810 ATTGATAATCCAGAACACATAGAACAACTGAAAAAATTACGCGAAGATGC

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3276 TAAGATACCAGCTTGTGAAGAAAGCCTAAGCCAGACCCC         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 183860 TAAGATACCAGCTTGTGAAGAAAGCCTAAGCCAGACCCCGTA...CAGGC

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3317 CGAGGGTGACAGGGACCAGTCCTGCTCAAGACCAGGATCATCCATCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186369 CGAGGGTGACAGGGACCAGTCCTGCTCAAGACCAGGATCATCCATCCGAG

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3367 GAGCAGGGGGGGCAGGG         GACGCCTCCAGCAGAAGATGCTGC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 186419 GAGCAGGGGGGGCAGGGGTG...TAGGACGCCTCCAGCAGAAGATGCTGC

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3408 TTGCCTGCAGAGCCCCCAGCCTGAGGACACGGGTGCAGAAGGAGGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189335 TTGCCTGCAGAGCCCCCAGCCTGAGGACACGGGTGCAGAAGGAGGGGCTG

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3458 AGTCCAAGACGAGCTCAGAAAACCAGAAGCCTGGTGGGTACTTGGTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189385 AGTCCAAGACGAGCTCAGAAAACCAGAAGCCTGGTGGGTACTTGGTATTC

   3750     .    :    .    :
   3508 AAAAGATGGTTAAGTTCAAATCGT
        ||||||||||||||||||||||||
 189435 AAAAGATGGTTAAGTTCAAATCGT