seq1 = pF1KB7349.tfa, 3048 bp
seq2 = pF1KB7349/gi568815578r_36677777.tfa (gi568815578r:36677777_36939414), 261638 bp

>pF1KB7349 3048
>gi568815578r:36677777_36939414 (Chr20)

(complement)

1-198  (100001-100198)   100% ->
199-357  (110203-110361)   100% ->
358-420  (121946-122008)   100% ->
421-1602  (123108-124289)   100% ->
1603-1743  (126571-126711)   100% ->
1744-1869  (129308-129433)   100% ->
1870-2100  (130672-130902)   100% ->
2101-2205  (133458-133562)   100% ->
2206-2373  (134513-134680)   100% ->
2374-2625  (136308-136559)   100% ->
2626-2697  (141842-141913)   100% ->
2698-2768  (142463-142533)   100% ->
2769-2993  (144816-145040)   100% ->
2994-3048  (161584-161638)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGAGATGCGGGACGTCTATATGGAGGAGGACGTGTATCAGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGGAGATGCGGGACGTCTATATGGAGGAGGACGTGTATCAGCTGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGCTGCGACAGCAGCTGGACCAGGCCAGCAAGACCTGCCGCATCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGCTGCGACAGCAGCTGGACCAGGCCAGCAAGACCTGCCGCATCCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTACCGGCTGCGCAAAGCCGAGCGCCGCAGTCTCCGTGCCGCCCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGTACCGGCTGCGCAAAGCCGAGCGCCGCAGTCTCCGTGCCGCCCAGACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCCAGGTGGACGGCGAGCTTATCCGTGGTCTGGAGCAGGATGTCAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100151 GGCCAGGTGGACGGCGAGCTTATCCGTGGTCTGGAGCAGGATGTCAAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    199        GTCTCTAAGGACATCTCCATGCGGCTGCATAAGGAGCTCGAGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 C...CAGGTCTCTAAGGACATCTCCATGCGGCTGCATAAGGAGCTCGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGTGGAGAAGAAACGGGCGCGGCTGGAGGAGGAGAACGAAGAGCTTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110246 TGGTGGAGAAGAAACGGGCGCGGCTGGAGGAGGAGAACGAAGAGCTTCGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAGCGGCTCATCGAGACTGAGCTGGCTAAGCAGGTGCTGCAGACGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110296 CAGCGGCTCATCGAGACTGAGCTGGCTAAGCAGGTGCTGCAGACGGAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGAGCGACCGAGAGAG         CATTCCTTGAAGAAAAGAGGAACCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 110346 GGAGCGACCGAGAGAGGTG...CAGCATTCCTTGAAGAAAAGAGGAACCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCTCCCTGGGGAAGGCCGATAAGAAGACTTTGGTGCAG         GAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 121971 GCTCCCTGGGGAAGGCCGATAAGAAGACTTTGGTGCAGGTA...CAGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GACAGTGCAGACCTGAAGTGCCAGTTGCACTTTGCAAAGGAGGAGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123111 GACAGTGCAGACCTGAAGTGCCAGTTGCACTTTGCAAAGGAGGAGTCAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCTCATGTGCAAGAAGCTCACTAAGCTTGCCAAGGAGAATGACAGCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123161 CCTCATGTGCAAGAAGCTCACTAAGCTTGCCAAGGAGAATGACAGCATGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGGAGGAGCTGCTGAAGTACCGCTCGCTCTATGGGGACCTGGACAGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123211 AGGAGGAGCTGCTGAAGTACCGCTCGCTCTATGGGGACCTGGACAGCGCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTGTCAGCCGAGGAGCTGGCCGATGCCCCCCACTCGCGGGAGACCGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123261 CTGTCAGCCGAGGAGCTGGCCGATGCCCCCCACTCGCGGGAGACCGAGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GAAGGTGCACCTGAAGCTGGTGGAGGAGGAAGCCAACCTGCTGAGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123311 GAAGGTGCACCTGAAGCTGGTGGAGGAGGAAGCCAACCTGCTGAGCCGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GCATCGTGGAGCTGGAGGTGGAGAACCGAGGCCTGCGGGCTGAGATGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123361 GCATCGTGGAGCTGGAGGTGGAGAACCGAGGCCTGCGGGCTGAGATGGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GACATGAAGGATCATGGAGGTGGCTGTGGGGGTCCTGAGGCACGCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123411 GACATGAAGGATCATGGAGGTGGCTGTGGGGGTCCTGAGGCACGCCTGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CTTCTCCGCGCTGGGTGGCGGAGAGTGCGGGGAGAGCTTGGCAGAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123461 CTTCTCCGCGCTGGGTGGCGGAGAGTGCGGGGAGAGCTTGGCAGAGCTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GGCGACACCTGCAGTTTGTCGAAGAGGAGGCCGAGCTGCTGCGGCGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123511 GGCGACACCTGCAGTTTGTCGAAGAGGAGGCCGAGCTGCTGCGGCGCTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 TCTGCCGAGCTCGAGGACCAGAACAAGCTGCTGCTGAACGAGCTGGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123561 TCTGCCGAGCTCGAGGACCAGAACAAGCTGCTGCTGAACGAGCTGGCCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 GTTCCGCTCGGAGCACGAGCTGGACGTGGCGCTGTCGGAGGACAGTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123611 GTTCCGCTCGGAGCACGAGCTGGACGTGGCGCTGTCGGAGGACAGTTGTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CTGTGCTCAGCGAACCTTCACAGGAGGAGCTGGCGGCCGCCAAGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123661 CTGTGCTCAGCGAACCTTCACAGGAGGAGCTGGCGGCCGCCAAGCTGCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 ATCGGCGAGCTCAGCGGCAAGGTCAAGAAGCTGCAGTACGAGAACCGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123711 ATCGGCGAGCTCAGCGGCAAGGTCAAGAAGCTGCAGTACGAGAACCGCGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GCTCCTCTCCAACCTCCAGCGCTGTGACCTCGCCTCCTGCCAGAGTACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123761 GCTCCTCTCCAACCTCCAGCGCTGTGACCTCGCCTCCTGCCAGAGTACGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 GGCCCATGCTGGAGACGGACGCCGAGGCCGGGGACTCTGCCCAGTGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123811 GGCCCATGCTGGAGACGGACGCCGAGGCCGGGGACTCTGCCCAGTGTGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 CCTGCTCCCCTGGGCGAGACACACGAGTCCCATGCGGTCCGACTCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123861 CCTGCTCCCCTGGGCGAGACACACGAGTCCCATGCGGTCCGACTCTGCAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 AGCCAGGGAGGCCGAGGTGCTGCCTGGGCTGAGAGAGCAGGCCGCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123911 AGCCAGGGAGGCCGAGGTGCTGCCTGGGCTGAGAGAGCAGGCCGCCCTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 TCAGTAAGGCCATCGATGTCCTGGTGGCTGATGCCAATGGCTTCACGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123961 TCAGTAAGGCCATCGATGTCCTGGTGGCTGATGCCAATGGCTTCACGGCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 GGCCTCCGGCTGTGTCTGGACAACGAGTGTGCTGACTTCCGGCTGCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124011 GGCCTCCGGCTGTGTCTGGACAACGAGTGTGCTGACTTCCGGCTGCATGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 GGCCCCCGACAACAGCGAGGGCCCCAGGGACACCAAGCTCATCCATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124061 GGCCCCCGACAACAGCGAGGGCCCCAGGGACACCAAGCTCATCCATGCCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 TCCTGGTGCGCCTGAGCGTGCTGCAGCAGGAGCTGAATGCCTTCACGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124111 TCCTGGTGCGCCTGAGCGTGCTGCAGCAGGAGCTGAATGCCTTCACGCGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 AAGGCAGATGCAGTCCTCGGGTGCTCTGTCAAGGAACAGCAGGAGTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124161 AAGGCAGATGCAGTCCTCGGGTGCTCTGTCAAGGAACAGCAGGAGTCCTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 CTCATCACTGCCCCCCTTGGGCTCCCAGGGGCTCTCTAAGGAGATTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124211 CTCATCACTGCCCCCCTTGGGCTCCCAGGGGCTCTCTAAGGAGATTCTTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 TGGCAAAAGACCTTGGCTCAGACTTTCAG         CCACCTGACTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 124261 TGGCAAAAGACCTTGGCTCAGACTTTCAGGTA...CAGCCACCTGACTTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 AGGGACCTGCCGGAATGGGAGCCCAGGATCCGAGAGGCTTTCCGCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126583 AGGGACCTGCCGGAATGGGAGCCCAGGATCCGAGAGGCTTTCCGCACTGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1665 TGACTTGGACTCTAAGCCCGACCCCAGCCGGAGCTTCAGGCCTTACCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126633 TGACTTGGACTCTAAGCCCGACCCCAGCCGGAGCTTCAGGCCTTACCGAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1715 CTGAAGACAATGATTCCTATGCCTCTGAG         ATCAAGGAGCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 126683 CTGAAGACAATGATTCCTATGCCTCTGAGGTG...CAGATCAAGGAGCTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 CAGCTGGTGCTGGCTGAGGCCCACGACAGCCTCCGGGGCTTGCAAGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129320 CAGCTGGTGCTGGCTGAGGCCCACGACAGCCTCCGGGGCTTGCAAGAGCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1806 GCTCTCCCAGGAGCGGCAGCTACGAAAGGAGGAGGCCGACAATTTCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129370 GCTCTCCCAGGAGCGGCAGCTACGAAAGGAGGAGGCCGACAATTTCAACC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1856 AGAAAATGGTCCAG         CTGAAGGAGGACCAGCAGAGGGCGCTC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 129420 AGAAAATGGTCCAGGTG...CAGCTGAAGGAGGACCAGCAGAGGGCGCTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1897 CTGAGGCGGGAGTTTGAGCTGCAGAGTCTGAGCCTCCAGCGGAGGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130699 CTGAGGCGGGAGTTTGAGCTGCAGAGTCTGAGCCTCCAGCGGAGGCTGGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1947 GCAGAAATTCTGGAGCCAGGAGAAGAACATGCTGGTGCAGGAGTCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130749 GCAGAAATTCTGGAGCCAGGAGAAGAACATGCTGGTGCAGGAGTCCCAGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1997 AATTCAAGCACAACTTCCTGCTGCTCTTCATGAAGCTCAGGTGGTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130799 AATTCAAGCACAACTTCCTGCTGCTCTTCATGAAGCTCAGGTGGTTCCTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2047 AAGCGCTGGCGGCAGGGCAAGGTTTTGCCCAGCGAAGGGGATGACTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130849 AAGCGCTGGCGGCAGGGCAAGGTTTTGCCCAGCGAAGGGGATGACTTCCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2097 CGAG         GTGAACAGCATGAAGGAGCTGTACTTGCTGATGGAGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130899 CGAGGTA...CAGGTGAACAGCATGAAGGAGCTGTACTTGCTGATGGAGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2138 AAGAGGAGATAAACGCTCAGCATTCTGATAACAAGGCCTGCACGGGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133495 AAGAGGAGATAAACGCTCAGCATTCTGATAACAAGGCCTGCACGGGGGAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2188 AGCTGGACCCAGAACACG         CCCAATGAGTACATCAAGACACT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 133545 AGCTGGACCCAGAACACGGTG...CAGCCCAATGAGTACATCAAGACACT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2229 GGCCGACATGAAGGTGACGCTGAAGGAGCTGTGCTGGCTGCTCCGGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134536 GGCCGACATGAAGGTGACGCTGAAGGAGCTGTGCTGGCTGCTCCGGGATG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2279 AACGCCGTGGTCTGACGGAGCTTCAGCAACAGTTTGCCAAGGCCAAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134586 AACGCCGTGGTCTGACGGAGCTTCAGCAACAGTTTGCCAAGGCCAAGGCT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2329 ACCTGGGAGACAGAGCGGGCAGAGCTCAAGGGCCATACCTCCCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 134636 ACCTGGGAGACAGAGCGGGCAGAGCTCAAGGGCCATACCTCCCAGGTG..

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2374     ATGGAGCTGAAGACAGGGAAGGGGGCCGGGGAGCGGGCAGGGCCCG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134686 .CAGATGGAGCTGAAGACAGGGAAGGGGGCCGGGGAGCGGGCAGGGCCCG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2420 ACTGGAAGGCAGCCCTACAGCGGGAGCGTGAGGAGCAGCAGCACCTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136354 ACTGGAAGGCAGCCCTACAGCGGGAGCGTGAGGAGCAGCAGCACCTCCTA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2470 GCTGAGTCCTACAGCGCTGTCATGGAGCTGACTCGGCAGCTGCAGATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136404 GCTGAGTCCTACAGCGCTGTCATGGAGCTGACTCGGCAGCTGCAGATCAG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2520 TGAGCGCAACTGGAGCCAGGAAAAGCTGCAGCTGGTGGAGCGGCTGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136454 TGAGCGCAACTGGAGCCAGGAAAAGCTGCAGCTGGTGGAGCGGCTGCAGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2570 GTGAGAAGCAGCAGGTGGAGCAGCAGGTGAAGGAGCTGCAGAACCGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136504 GTGAGAAGCAGCAGGTGGAGCAGCAGGTGAAGGAGCTGCAGAACCGCCTA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2620 AGCCAG         CTGCAGAAGGCTGCCGACCCCTGGGTCCTGAAGCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136554 AGCCAGGTG...CAGCTGCAGAAGGCTGCCGACCCCTGGGTCCTGAAGCA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2661 CTCGGAGCTGGAGAAGCAGGACAACAGCTGGAAGGAG         ACAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 141877 CTCGGAGCTGGAGAAGCAGGACAACAGCTGGAAGGAGGTG...CAGACAC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2702 GCAGTGAGAAGATCCACGACAAGGAGGCTGTTTCCGAAGTTGAGCTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142467 GCAGTGAGAAGATCCACGACAAGGAGGCTGTTTCCGAAGTTGAGCTTGGA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2752 GGAAATGGTTTAAAGAG         AACCAAATCTGTTTCTTCCATGTC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 142517 GGAAATGGTTTAAAGAGGTG...CAGAACCAAATCTGTTTCTTCCATGTC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2793 TGAGTTTGAAAGTTTGCTCGACTGTTCCCCTTACCTTGCTGGCGGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144840 TGAGTTTGAAAGTTTGCTCGACTGTTCCCCTTACCTTGCTGGCGGAGATG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2843 CCCGGGGCAAGAAGCTGCCTAACAACCCTGCCTTTGGCTTTGTGAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144890 CCCGGGGCAAGAAGCTGCCTAACAACCCTGCCTTTGGCTTTGTGAGCTCC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2893 GAGCCAGGGGATCCAGAGAAAGACACCAAGGAGAAGCCTGGGCTCTCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144940 GAGCCAGGGGATCCAGAGAAAGACACCAAGGAGAAGCCTGGGCTCTCGTC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2943 GAGGGACTGCAACCACCTGGGTGCCCTGGCCTGCCAGGACCCCCCAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144990 GAGGGACTGCAACCACCTGGGTGCCCTGGCCTGCCAGGACCCCCCAGGGA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2993 G         CCAGAAGCTGCCCTTCCTCCTCATCCTGGCCCCTCCCCAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145040 GGCA...GAGCCAGAAGCTGCCCTTCCTCCTCATCCTGGCCCCTCCCCAG

   3150     .    :    .
   3034 CCCCCGCCAATACTG
        |||||||||||||||
 161624 CCCCCGCCAATACTG