Result of SIM4 for
pF1KB7344
seq1 = pF1KB7344.tfa, 3147 bp
seq2 = pF1KB7344/gi568815580f_31218301.tfa (gi568815580f:31218301_31455343), 237043 bp
>pF1KB7344 3147
>gi568815580f:31218301_31455343 (Chr18)
1-48 (100001-100048) 100% ->
49-84 (108281-108316) 100% ->
85-216 (108574-108705) 100% ->
217-372 (109889-110044) 100% ->
373-517 (111592-111736) 100% ->
518-684 (113401-113567) 100% ->
685-819 (115289-115423) 99% ->
820-1005 (115717-115902) 100% ->
1006-1265 (118054-118313) 100% ->
1266-1405 (120015-120154) 100% ->
1406-1687 (121444-121725) 100% ->
1688-1821 (125150-125283) 100% ->
1822-1891 (125626-125695) 100% ->
1892-2100 (127690-127898) 100% ->
2101-3147 (135997-137043) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGACTGGAGTTTCTTCAGAGTAGTTGCAATGCTGTTCATTTTTCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
100001 ATGGACTGGAGTTTCTTCAGAGTAGTTGCAATGCTGTTCATTTTTCTGGT
50 . : . : . : . : . :
49 GTGGTGGTAGAAGTTAACAGTGAATTCCGAATCCAG
>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
100051 G...CAGGTGGTGGTAGAAGTTAACAGTGAATTCCGAATCCAGGTA...A
100 . : . : . : . : . :
85 GTAAGAGATTATAACACTAAAAATGGCACCATCAAATGGCATTCAATC
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108572 AGGTAAGAGATTATAACACTAAAAATGGCACCATCAAATGGCATTCAATC
150 . : . : . : . : . :
133 CGAAGGCAGAAACGTGAATGGATCAAGTTCGCAGCAGCCTGTCGTGAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108622 CGAAGGCAGAAACGTGAATGGATCAAGTTCGCAGCAGCCTGTCGTGAAGG
200 . : . : . : . : . :
183 TGAAGACAACTCAAAGAGGAACCCAATCGCCAAA ATTCACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
108672 TGAAGACAACTCAAAGAGGAACCCAATCGCCAAAGTA...CAGATTCACT
250 . : . : . : . : . :
224 CAGATTGTGCTGCAAACCAGCAAGTTACATACCGCATCTCTGGAGTAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109896 CAGATTGTGCTGCAAACCAGCAAGTTACATACCGCATCTCTGGAGTAGGA
300 . : . : . : . : . :
274 ATTGATCAGCCACCATATGGGATCTTTGTCATTAATCAGAAAACTGGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109946 ATTGATCAGCCACCATATGGGATCTTTGTCATTAATCAGAAAACTGGTGA
350 . : . : . : . : . :
324 AATTAATATAACATCCATAGTTGATCGAGAGGTCACTCCTTTCTTCATT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
109996 AATTAATATAACATCCATAGTTGATCGAGAGGTCACTCCTTTCTTCATTG
400 . : . : . : . : . :
373 ATCTACTGCCGAGCTCTGAACTCAATGGGCCAAGATTTAGAG
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110046 TA...CAGATCTACTGCCGAGCTCTGAACTCAATGGGCCAAGATTTAGAG
450 . : . : . : . : . :
415 AGGCCTCTAGAGCTCAGAGTCAGGGTTTTGGATATAAATGACAACCCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111634 AGGCCTCTAGAGCTCAGAGTCAGGGTTTTGGATATAAATGACAACCCTCC
500 . : . : . : . : . :
465 AGTGTTTTCAATGGCTACATTTGCAGGACAAATAGAAGAAAATTCTAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111684 AGTGTTTTCAATGGCTACATTTGCAGGACAAATAGAAGAAAATTCTAATG
550 . : . : . : . : . :
515 CAA ATACACTGGTGATGATACTCAATGCTACTGACGCAGAT
|||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111734 CAAGTA...TAGATACACTGGTGATGATACTCAATGCTACTGACGCAGAT
600 . : . : . : . : . :
556 GAACCGAACAATTTGAACTCAAAAATAGCCTTCAAGATTATAAGACAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113439 GAACCGAACAATTTGAACTCAAAAATAGCCTTCAAGATTATAAGACAAGA
650 . : . : . : . : . :
606 ACCTTCAGATTCACCAATGTTTATTATCAACAGAAATACTGGAGAAATTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113489 ACCTTCAGATTCACCAATGTTTATTATCAACAGAAATACTGGAGAAATTC
700 . : . : . : . : . :
656 GAACGATGAATAATTTTCTAGACAGAGAG CAATACGGCCAG
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
113539 GAACGATGAATAATTTTCTAGACAGAGAGGTA...TAGCAATACGGCCAG
750 . : . : . : . : . :
697 TATGCTCTTGCTGTAAGAGGCTCTGACCGAGATGGTGGGGCAGATGGCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
115301 TATGCTCTTGCTGTAAGAGGCTCTGACCGAGATGGCGGGGCAGATGGCAT
800 . : . : . : . : . :
747 GTCAGCGGAATGTGAGTGCAACATTAAAATCCTCGATGTCAATGATAATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115351 GTCAGCGGAATGTGAGTGCAACATTAAAATCCTCGATGTCAATGATAATA
850 . : . : . : . : . :
797 TCCCTTACATGGAACAGTCTTCA TATACCATAGAAATTCAA
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
115401 TCCCTTACATGGAACAGTCTTCAGTA...CAGTATACCATAGAAATTCAA
900 . : . : . : . : . :
838 GAAAATACTCTAAATTCAAATTTGCTCGAGATTAGAGTAATTGATTTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115735 GAAAATACTCTAAATTCAAATTTGCTCGAGATTAGAGTAATTGATTTGGA
950 . : . : . : . : . :
888 TGAAGAGTTCTCAGCTAACTGGATGGCAGTAATTTTCTTTATCTCTGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115785 TGAAGAGTTCTCAGCTAACTGGATGGCAGTAATTTTCTTTATCTCTGGAA
1000 . : . : . : . : . :
938 ATGAAGGAAATTGGTTTGAGATAGAAATGAATGAAAGAACAAATGTGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115835 ATGAAGGAAATTGGTTTGAGATAGAAATGAATGAAAGAACAAATGTGGGA
1050 . : . : . : . : . :
988 ATTTTAAAGGTTGTTAAG CCCTTAGATTATGAAGCTATGCA
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
115885 ATTTTAAAGGTTGTTAAGGTA...TAGCCCTTAGATTATGAAGCTATGCA
1100 . : . : . : . : . :
1029 GAGTCTGCAACTCAGTATTGGTGTCAGAAATAAAGCTGAATTTCATCATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118077 GAGTCTGCAACTCAGTATTGGTGTCAGAAATAAAGCTGAATTTCATCATT
1150 . : . : . : . : . :
1079 CAATTATGTCTCAATATAAACTGAAAGCATCTGCAATTTCTGTGACTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118127 CAATTATGTCTCAATATAAACTGAAAGCATCTGCAATTTCTGTGACTGTG
1200 . : . : . : . : . :
1129 TTAAATGTAATTGAAGGCCCAGTGTTTCGTCCAGGTTCAAAGACATATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118177 TTAAATGTAATTGAAGGCCCAGTGTTTCGTCCAGGTTCAAAGACATATGT
1250 . : . : . : . : . :
1179 TGTAACTGGTAATATGGGATCAAATGATAAAGTGGGAGACTTTGTAGCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118227 TGTAACTGGTAATATGGGATCAAATGATAAAGTGGGAGACTTTGTAGCTA
1300 . : . : . : . : . :
1229 CTGACCTGGACACAGGTAGACCTTCAACGACTGTTAG GTAT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
118277 CTGACCTGGACACAGGTAGACCTTCAACGACTGTTAGGTA...CAGGTAT
1350 . : . : . : . : . :
1270 GTAATGGGAAATAATCCAGCTGACCTGCTAGCTGTTGATTCAAGAACAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120019 GTAATGGGAAATAATCCAGCTGACCTGCTAGCTGTTGATTCAAGAACAGG
1400 . : . : . : . : . :
1320 CAAACTCACTTTGAAAAATAAAGTTACCAAGGAACAGTACAATATGCTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120069 CAAACTCACTTTGAAAAATAAAGTTACCAAGGAACAGTACAATATGCTCG
1450 . : . : . : . : . :
1370 GAGGAAAATACCAAGGAACGATTCTCTCTATAGATG ATAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
120119 GAGGAAAATACCAAGGAACGATTCTCTCTATAGATGGTA...CAGATAAT
1500 . : . : . : . : . :
1411 CTTCAAAGAACTTGCACTGGTACAATTAATATTAACATTCAAAGTTTTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121449 CTTCAAAGAACTTGCACTGGTACAATTAATATTAACATTCAAAGTTTTGG
1550 . : . : . : . : . :
1461 TAATGACGACAGGACTAATACAGAGCCGAACACTAAAATTACTACCAATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121499 TAATGACGACAGGACTAATACAGAGCCGAACACTAAAATTACTACCAATA
1600 . : . : . : . : . :
1511 CTGGCAGACAAGAAAGTACTTCTTCCACTAACTATGATACCAGCACAACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121549 CTGGCAGACAAGAAAGTACTTCTTCCACTAACTATGATACCAGCACAACT
1650 . : . : . : . : . :
1561 TCTACTGACTCTAGCCAAGTATATTCTTCTGAACCCGGAAACGGAGCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121599 TCTACTGACTCTAGCCAAGTATATTCTTCTGAACCCGGAAACGGAGCCAA
1700 . : . : . : . : . :
1611 AGATTTGTTATCAGACAATGTACATTTTGGTCCTGCTGGCATTGGACTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121649 AGATTTGTTATCAGACAATGTACATTTTGGTCCTGCTGGCATTGGACTCC
1750 . : . : . : . : . :
1661 TCATCATGGGATTCTTGGTCTTAGGAT TGGTCCCATTTTTG
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
121699 TCATCATGGGATTCTTGGTCTTAGGATGTA...CAGTGGTCCCATTTTTG
1800 . : . : . : . : . :
1702 ATGATCTGTTGTGATTGTGGAGGTGCTCCTCGTAGTGCAGCTGGCTTTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125164 ATGATCTGTTGTGATTGTGGAGGTGCTCCTCGTAGTGCAGCTGGCTTTGA
1850 . : . : . : . : . :
1752 GCCTGTTCCCGAATGTTCAGATGGAGCAATTCATTCATGGGCAGTAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125214 GCCTGTTCCCGAATGTTCAGATGGAGCAATTCATTCATGGGCAGTAGAAG
1900 . : . : . : . : . :
1802 GACCACAGCCTGAACCCAGG GATATAACCACTGTCATACCA
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
125264 GACCACAGCCTGAACCCAGGGTA...TAGGATATAACCACTGTCATACCA
1950 . : . : . : . : . :
1843 CAAATACCACCTGATAACGCAAATATAATTGAATGCATTGACAACTCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
125647 CAAATACCACCTGATAACGCAAATATAATTGAATGCATTGACAACTCAGG
2000 . : . : . : . : . :
1892 GAGTTTATACAAATGAGTATGGTGGCAGAGAAATGCAAGATC
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125697 TA...TAGGAGTTTATACAAATGAGTATGGTGGCAGAGAAATGCAAGATC
2050 . : . : . : . : . :
1934 TGGGAGGAGGAGAGAGAATGACAGGATTTGAACTAACAGAGGGAGTTAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127732 TGGGAGGAGGAGAGAGAATGACAGGATTTGAACTAACAGAGGGAGTTAAA
2100 . : . : . : . : . :
1984 ACTTCAGGAATGCCTGAGATATGTCAAGAATACTCTGGAACATTAAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127782 ACTTCAGGAATGCCTGAGATATGTCAAGAATACTCTGGAACATTAAGAAG
2150 . : . : . : . : . :
2034 AAATTCTATGAGGGAATGTAGAGAAGGAGGTCTGAATATGAATTTCATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127832 AAATTCTATGAGGGAATGTAGAGAAGGAGGTCTGAATATGAATTTCATGG
2200 . : . : . : . : . :
2084 AAAGCTACTTCTGTCAG AAAGCATATGCTTACGCAGATGAA
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
127882 AAAGCTACTTCTGTCAGGTA...CAGAAAGCATATGCTTACGCAGATGAA
2250 . : . : . : . : . :
2125 GATGAAGGACGCCCATCTAATGACTGTTTGCTCATATATGACATCGAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136021 GATGAAGGACGCCCATCTAATGACTGTTTGCTCATATATGACATCGAAGG
2300 . : . : . : . : . :
2175 TGTAGGTTCCCCTGCTGGCTCTGTGGGTTGTTGTAGCTTCATTGGAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136071 TGTAGGTTCCCCTGCTGGCTCTGTGGGTTGTTGTAGCTTCATTGGAGAAG
2350 . : . : . : . : . :
2225 ACCTGGATGACAGCTTCTTGGATACCCTGGGACCTAAATTTAAGAAGTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136121 ACCTGGATGACAGCTTCTTGGATACCCTGGGACCTAAATTTAAGAAGTTG
2400 . : . : . : . : . :
2275 GCAGACATCAGCCTAGGAAAAGAATCATATCCAGACCTTGATCCTTCTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136171 GCAGACATCAGCCTAGGAAAAGAATCATATCCAGACCTTGATCCTTCTTG
2450 . : . : . : . : . :
2325 GCCACCACAAAGCACTGAACCAGTTTGCCTTCCTCAGGAAACAGAGCCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136221 GCCACCACAAAGCACTGAACCAGTTTGCCTTCCTCAGGAAACAGAGCCCG
2500 . : . : . : . : . :
2375 TTGTTAGTGGACACCCACCAATCTCCCCACATTTCGGCACTACCACAGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136271 TTGTTAGTGGACACCCACCAATCTCCCCACATTTCGGCACTACCACAGTA
2550 . : . : . : . : . :
2425 ATTTCTGAGAGCACCTATCCCTCGGGACCTGGTGTACTGCATCCTAAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136321 ATTTCTGAGAGCACCTATCCCTCGGGACCTGGTGTACTGCATCCTAAGCC
2600 . : . : . : . : . :
2475 TATTCTCGATCCTCTGGGCTATGGTAATGTCACTGTGACCGAGTCTTACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136371 TATTCTCGATCCTCTGGGCTATGGTAATGTCACTGTGACCGAGTCTTACA
2650 . : . : . : . : . :
2525 CCACCTCTGACACTCTGAAGCCCTCTGTGCACGTTCACGATAACCGACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136421 CCACCTCTGACACTCTGAAGCCCTCTGTGCACGTTCACGATAACCGACCA
2700 . : . : . : . : . :
2575 GCATCAAACGTGGTAGTGACAGAGAGAGTGGTCGGCCCAATCTCTGGCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136471 GCATCAAACGTGGTAGTGACAGAGAGAGTGGTCGGCCCAATCTCTGGCGC
2750 . : . : . : . : . :
2625 TGATTTGCATGGAATGTTAGAGATGCCTGACTTGCGAGATGGGTCGAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136521 TGATTTGCATGGAATGTTAGAGATGCCTGACTTGCGAGATGGGTCGAATG
2800 . : . : . : . : . :
2675 TTATAGTGACAGAAAGGGTAATAGCACCAAGCTCTAGTCTACCCACCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136571 TTATAGTGACAGAAAGGGTAATAGCACCAAGCTCTAGTCTACCCACCTCT
2850 . : . : . : . : . :
2725 CTGACTATCCATCATCCTAGAGAGTCTTCAAATGTGGTAGTGACAGAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136621 CTGACTATCCATCATCCTAGAGAGTCTTCAAATGTGGTAGTGACAGAAAG
2900 . : . : . : . : . :
2775 AGTAATCCAACCAACTTCCGGCATGATAGGTAGTCTGAGTATGCACCCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136671 AGTAATCCAACCAACTTCCGGCATGATAGGTAGTCTGAGTATGCACCCCG
2950 . : . : . : . : . :
2825 AGTTAGCCAATGCCCACAATGTCATTGTGACAGAGAGGGTTGTTTCTGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136721 AGTTAGCCAATGCCCACAATGTCATTGTGACAGAGAGGGTTGTTTCTGGT
3000 . : . : . : . : . :
2875 GCTGGCGTAACTGGAATTAGTGGCACCACTGGGATCAGCGGTGGCATAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136771 GCTGGCGTAACTGGAATTAGTGGCACCACTGGGATCAGCGGTGGCATAGG
3050 . : . : . : . : . :
2925 CAGCAGTGGCCTGGTTGGCACCAGCATGGGTGCTGGGAGCGGTGCCCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136821 CAGCAGTGGCCTGGTTGGCACCAGCATGGGTGCTGGGAGCGGTGCCCTGA
3100 . : . : . : . : . :
2975 GTGGAGCTGGCATAAGTGGTGGTGGCATTGGCCTGAGCAGCTTGGGAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136871 GTGGAGCTGGCATAAGTGGTGGTGGCATTGGCCTGAGCAGCTTGGGAGGG
3150 . : . : . : . : . :
3025 ACAGCCAGCATTGGCCACATGAGGAGTTCCTCTGACCATCACTTTAACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136921 ACAGCCAGCATTGGCCACATGAGGAGTTCCTCTGACCATCACTTTAACCA
3200 . : . : . : . : . :
3075 AACCATTGGGTCCGCCTCCCCTAGCACAGCTCGAAGTCGAATCACAAAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136971 AACCATTGGGTCCGCCTCCCCTAGCACAGCTCGAAGTCGAATCACAAAGT
3250 . : . :
3125 ATAGTACCGTGCAATATAGCAAG
|||||||||||||||||||||||
137021 ATAGTACCGTGCAATATAGCAAG