seq1 = pF1KB7339.tfa, 2499 bp
seq2 = pF1KB7339/gi568815579r_38493290.tfa (gi568815579r:38493290_38717895), 224606 bp

>pF1KB7339 2499
>gi568815579r:38493290_38717895 (Chr19)

(complement)

1-99  (100001-100099)   100% ->
100-157  (100271-100328)   100% ->
158-248  (100452-100542)   100% ->
249-313  (101637-101701)   100% ->
314-369  (103451-103506)   100% ->
370-417  (103604-103651)   100% ->
418-460  (103811-103853)   100% ->
461-533  (103944-104016)   100% ->
534-665  (105154-105285)   100% ->
666-728  (106591-106653)   100% ->
729-810  (106764-106845)   100% ->
811-927  (107871-107987)   100% ->
928-1006  (108222-108300)   100% ->
1007-1065  (109726-109784)   100% ->
1066-1109  (109863-109906)   100% ->
1110-1157  (109985-110032)   100% ->
1158-1200  (111681-111723)   100% ->
1201-1363  (112166-112328)   100% ->
1364-1446  (112405-112487)   100% ->
1447-1531  (116371-116455)   100% ->
1532-1608  (117743-117819)   100% ->
1609-1669  (117911-117971)   100% ->
1670-1778  (120302-120410)   100% ->
1779-1837  (120512-120570)   100% ->
1838-1941  (120759-120862)   100% ->
1942-2116  (121410-121584)   100% ->
2117-2179  (121895-121957)   100% ->
2180-2269  (122167-122256)   100% ->
2270-2340  (122341-122411)   100% ->
2341-2396  (124559-124614)   100% ->
2397-2499  (128621-128723)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACGTCGTGGACCCTGACATTTTCAATAGAGACCCCCGGGACCACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACGTCGTGGACCCTGACATTTTCAATAGAGACCCCCGGGACCACTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGACCTGCTACAGCGGCTGGGTGGCGGCACGTATGGGGAAGTCTTTAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100051 TGACCTGCTACAGCGGCTGGGTGGCGGCACGTATGGGGAAGTCTTTAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    100         GCTCGAGACAAGGTGTCAGGGGACCTGGTGGCACTGAAGATG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TG...AAGGCTCGAGACAAGGTGTCAGGGGACCTGGTGGCACTGAAGATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGAAGATGGAGCCTG         ATGATGATGTCTCCACCCTTCAGAA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100313 GTGAAGATGGAGCCTGGTG...CAGATGATGATGTCTCCACCCTTCAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGAAATCCTCATATTGAAAACTTGCCGGCACGCCAACATCGTGGCCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100477 GGAAATCCTCATATTGAAAACTTGCCGGCACGCCAACATCGTGGCCTACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGGGAGTTATCTCTG         GTTGCAGAAACTCTGGATCTGCATG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100527 ATGGGAGTTATCTCTGGTG...CAGGTTGCAGAAACTCTGGATCTGCATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GAATTCTGTGGGGCTGGTTCTCTCCAGGACATCTACCAAG         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 101662 GAATTCTGTGGGGCTGGTTCTCTCCAGGACATCTACCAAGGTT...CAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GACAGGCTCCCTGTCAGAGCTCCAGATTAGCTATGTCTGCCGGGAAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103452 GACAGGCTCCCTGTCAGAGCTCCAGATTAGCTATGTCTGCCGGGAAGTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TCCAG         GGACTGGCCTATTTGCACTCACAGAAGAAGATACAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103502 TCCAGGTA...CAGGGACTGGCCTATTTGCACTCACAGAAGAAGATACAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 AGGGACATCAAG         GGAGCTAACATCCTCATCAATGATGCTGG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103640 AGGGACATCAAGGTG...CAGGGAGCTAACATCCTCATCAATGATGCTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 GGAGGTCAGATTGG         CTGACTTTGGCATCTCGGCCCAGATTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 103840 GGAGGTCAGATTGGGTG...CAGCTGACTTTGGCATCTCGGCCCAGATTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    488 GGGCTACACTGGCCAGACGCCTCTCTTTCATTGGGACACCCTACTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 103971 GGGCTACACTGGCCAGACGCCTCTCTTTCATTGGGACACCCTACTGGTG.

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    534      GATGGCTCCGGAAGTGGCAGCTGTGGCCCTGAAGGGAGGATACAA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104021 ..CAGGATGGCTCCGGAAGTGGCAGCTGTGGCCCTGAAGGGAGGATACAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    579 TGAGCTGTGTGACATCTGGTCCCTGGGCATCACGGCCATCGAACTGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105199 TGAGCTGTGTGACATCTGGTCCCTGGGCATCACGGCCATCGAACTGGCCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    629 AGCTACAGCCACCGCTCTTTGATGTGCACCCTCTCAG         AGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 105249 AGCTACAGCCACCGCTCTTTGATGTGCACCCTCTCAGGTA...TAGAGTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    670 CTCTTCCTCATGACCAAGAGTGGCTACCAGCCTCCCCGACTGAAGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106595 CTCTTCCTCATGACCAAGAGTGGCTACCAGCCTCCCCGACTGAAGGAAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    720 AGGCAAATG         GTCGGCTGCCTTCCACAACTTCATCAAAGTCA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 106645 AGGCAAATGGTA...AAGGTCGGCTGCCTTCCACAACTTCATCAAAGTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    761 CTCTGACTAAGAGTCCCAAGAAACGACCCAGCGCCACCAAGATGCTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106796 CTCTGACTAAGAGTCCCAAGAAACGACCCAGCGCCACCAAGATGCTCAGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    811          CATCAACTGGTATCCCAGCCTGGGCTGAATCGAGGCCTGAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106846 GTA...CAGCATCAACTGGTATCCCAGCCTGGGCTGAATCGAGGCCTGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    852 CCTGGATCTTCTTGACAAACTGAAGAATCCCGGGAAAGGACCCTCCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107912 CCTGGATCTTCTTGACAAACTGAAGAATCCCGGGAAAGGACCCTCCATTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    902 GGGACATTGAGGATGAGGAGCCCGAG         CTACCCCCTGCTATC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 107962 GGGACATTGAGGATGAGGAGCCCGAGGTG...CAGCTACCCCCTGCTATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    943 CCTCGGCGGATCAGATCCACCCACCGCTCCAGCTCTCTGGGGATCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108237 CCTCGGCGGATCAGATCCACCCACCGCTCCAGCTCTCTGGGGATCCCAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    993 TGCAGACTGCTGTC         GGCGGCACATGGAGTTCAGGAAGCTCC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 108287 TGCAGACTGCTGTCGTG...TAGGGCGGCACATGGAGTTCAGGAAGCTCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1034 GAGGAATGGAGACCAGACCCCCAGCCAACACC         GCTCGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 109753 GAGGAATGGAGACCAGACCCCCAGCCAACACCGTG...CAGGCTCGCCTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1075 CAGCCTCCTCGAGACCTCAGGAGCAGCAGCCCCAG         GAAGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 109872 CAGCCTCCTCGAGACCTCAGGAGCAGCAGCCCCAGGTC...CAGGAAGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1116 ACTGTCAGAGTCGTCTGACGATGACTATGACGACGTGGACAT        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 109991 ACTGTCAGAGTCGTCTGACGATGACTATGACGACGTGGACATGTA...CA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1158  CCCCACCCCTGCAGAGGACACACCTCCTCCACTTCCCCCCAAG      
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 111680 GCCCCACCCCTGCAGAGGACACACCTCCTCCACTTCCCCCCAAGGTA...

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201    CCCAAGTTCCGTTCTCCATCAGACGAGGGTCCTGGGAGCATGGGGGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112163 AAGCCCAAGTTCCGTTCTCCATCAGACGAGGGTCCTGGGAGCATGGGGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1248 TGATGGGCAGCTGAGCCCGGGGGTGCTGGTCCGGTGTGCCAGTGGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112213 TGATGGGCAGCTGAGCCCGGGGGTGCTGGTCCGGTGTGCCAGTGGGCCCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1298 CACCAAACAGCCCCCGTCCTGGGCCTCCCCCATCCACCAGCAGCCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112263 CACCAAACAGCCCCCGTCCTGGGCCTCCCCCATCCACCAGCAGCCCCCAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1348 CTCACCGCCCATTCAG         AACCCTCACTCTGGAACCCACCCTC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 112313 CTCACCGCCCATTCAGGTA...CAGAACCCTCACTCTGGAACCCACCCTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1389 CCGGGAGCTTGACAAGCCCCCACTTCTGCCCCCCAAGAAGGAAAAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112430 CCGGGAGCTTGACAAGCCCCCACTTCTGCCCCCCAAGAAGGAAAAGATGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1439 AGAGAAAG         GGATGTGCCCTTCTCGTAAAGTTGTTCAATGGC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 112480 AGAGAAAGGTG...CAGGGATGTGCCCTTCTCGTAAAGTTGTTCAATGGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1480 TGCCCCCTCCGGATCCACAGCACGGCCGCCTGGACACATCCCTCCACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116404 TGCCCCCTCCGGATCCACAGCACGGCCGCCTGGACACATCCCTCCACCAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1530 GG         ACCAGCACCTGCTCCTGGGGGCAGAGGAAGGCATCTTCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116454 GGGTG...CAGACCAGCACCTGCTCCTGGGGGCAGAGGAAGGCATCTTCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1571 TCCTGAACCGGAATGACCAGGAGGCCACGCTGGAAATG         CTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 117782 TCCTGAACCGGAATGACCAGGAGGCCACGCTGGAAATGGTG...CAGCTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1612 TTTCCTAGCCGGACTACGTGGGTGTACTCCATCAACAACGTTCTCATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117914 TTTCCTAGCCGGACTACGTGGGTGTACTCCATCAACAACGTTCTCATGTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1662 TCTCTCAG         GAAAGACCCCCCACCTGTATTCTCATAGCATCC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 117964 TCTCTCAGGTC...CAGGAAAGACCCCCCACCTGTATTCTCATAGCATCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1703 TTGGCCTGCTGGAACGGAAAGAGACCAGAGCAGGAAACCCCATCGCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120335 TTGGCCTGCTGGAACGGAAAGAGACCAGAGCAGGAAACCCCATCGCTCAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1753 ATTAGCCCCCACCGCCTACTGGCAAG         GAAGAACATGGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 120385 ATTAGCCCCCACCGCCTACTGGCAAGGTA...CAGGAAGAACATGGTTTC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1794 CACCAAGATCCAGGACACCAAAGGCTGCCGGGCGTGCTGTGTGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 120527 CACCAAGATCCAGGACACCAAAGGCTGCCGGGCGTGCTGTGTGGGTG...

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838    CGGAGGGTGCGAGCTCTGGGGGCCCGTTCCTGTGCGGTGCATTGGAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120756 CAGCGGAGGGTGCGAGCTCTGGGGGCCCGTTCCTGTGCGGTGCATTGGAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1885 ACGTCCGTTGTCCTGCTTCAGTGGTACCAGCCCATGAACAAATTCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120806 ACGTCCGTTGTCCTGCTTCAGTGGTACCAGCCCATGAACAAATTCCTGCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1935 TGTCCGG         CAGGTGCTGTTCCCACTGCCGACGCCTCTGTCCG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120856 TGTCCGGGTA...CAGCAGGTGCTGTTCCCACTGCCGACGCCTCTGTCCG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1976 TGTTCGCGCTGCTGACCGGGCCAGGCTCTGAGCTGCCCGCTGTGTGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121444 TGTTCGCGCTGCTGACCGGGCCAGGCTCTGAGCTGCCCGCTGTGTGCATC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2026 GGCGTGAGCCCCGGGCGGCCGGGGAAGTCGGTGCTCTTCCACACGGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121494 GGCGTGAGCCCCGGGCGGCCGGGGAAGTCGGTGCTCTTCCACACGGTGCG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2076 CTTTGGCGCGCTCTCTTGCTGGCTGGGCGAGATGAGCACCG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 121544 CTTTGGCGCGCTCTCTTGCTGGCTGGGCGAGATGAGCACCGGTG...CAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2117 AGCACAGGGGACCCGTGCAGGTGACCCAGGTAGAGGAAGATATGGTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121895 AGCACAGGGGACCCGTGCAGGTGACCCAGGTAGAGGAAGATATGGTGATG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2167 GTGTTGATGGATG         GCTCTGTGAAGCTGGTGACCCCGGAGGG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 121945 GTGTTGATGGATGGTG...CAGGCTCTGTGAAGCTGGTGACCCCGGAGGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2208 GTCCCCAGTCCGGGGACTTCGCACACCTGAGATCCCCATGACCGAAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122195 GTCCCCAGTCCGGGGACTTCGCACACCTGAGATCCCCATGACCGAAGCGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2258 TGGAGGCCGTGG         CTATGGTTGGAGGTCAGCTTCAGGCCTTC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 122245 TGGAGGCCGTGGGTC...CAGCTATGGTTGGAGGTCAGCTTCAGGCCTTC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2299 TGGAAGCATGGAGTGCAGGTGTGGGCTCTAGGCTCGGATCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 122370 TGGAAGCATGGAGTGCAGGTGTGGGCTCTAGGCTCGGATCAGGTA...TA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2341  CTGCTACAGGAGCTGAGAGACCCTACCCTCACTTTCCGTCTGCTTGGCT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124558 GCTGCTACAGGAGCTGAGAGACCCTACCCTCACTTTCCGTCTGCTTGGCT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2390 CCCCCAG         GCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGCCTCACTGC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124608 CCCCCAGGTA...CAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGCCTCACTGC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2431 AACCTCCTCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128655 AACCTCCTCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGT

   2750     .    :    .
   2481 AGCTGGGATTACAGGCCTG
        |||||||||||||||  ||
 128705 AGCTGGGATTACAGGTTTG