seq1 = pF1KB7327.tfa, 2514 bp
seq2 = pF1KB7327/gi568815588f_94446376.tfa (gi568815588f:94446376_94701619), 255244 bp

>pF1KB7327 2514
>gi568815588f:94446376_94701619 (Chr10)

1-31  (99547-99577)   100% ->
32-153  (100002-100123)   100% ->
154-276  (107751-107873)   100% ->
277-333  (111764-111820)   100% ->
334-370  (116316-116352)   100% ->
371-435  (116437-116501)   100% ->
436-477  (125013-125054)   100% ->
478-705  (127585-127812)   100% ->
706-888  (128179-128361)   100% ->
889-1032  (130287-130430)   100% ->
1033-1229  (134951-135147)   100% ->
1230-1326  (136588-136684)   100% ->
1327-1488  (141854-142015)   100% ->
1489-1628  (144038-144177)   100% ->
1629-1767  (144263-144401)   100% ->
1768-1851  (145854-145937)   100% ->
1852-1971  (146020-146139)   100% ->
1972-2088  (147124-147240)   100% ->
2089-2248  (148320-148479)   100% ->
2249-2345  (150485-150581)   100% ->
2346-2422  (150660-150736)   100% ->
2423-2514  (155153-155244)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCAGCGGAACGGCCCGCGGGCAGCGGCG         GCTCGGAGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
  99547 ATGCCAGCGGAACGGCCCGCGGGCAGCGGCGGTG...CAGGCTCGGAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TCCAGCAATGGTTGAACAACTGGACACTGCTGTGATTACCCCGGCCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100012 TCCAGCAATGGTTGAACAACTGGACACTGCTGTGATTACCCCGGCCATGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TAGAAGAGGAAGAACAGCTTGAAGCTGCTGGACTAGAGAGAGAGCGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100062 TAGAAGAGGAAGAACAGCTTGAAGCTGCTGGACTAGAGAGAGAGCGGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGCTGGAAAAG         GCTCGCATGTCTTGGGATAGAGAGTCGAC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100112 ATGCTGGAAAAGGTA...TAGGCTCGCATGTCTTGGGATAGAGAGTCGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGAAATTCGGTACCGTAGACTTCAACATTTGCTTGAAAAAAGCAATATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107780 AGAAATTCGGTACCGTAGACTTCAACATTTGCTTGAAAAAAGCAATATAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACTCCAAATTTTTATTGACGAAAATGGAACAGCAACAATTAGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 107830 ACTCCAAATTTTTATTGACGAAAATGGAACAGCAACAATTAGAGGTA...

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    277    GAACAGAAGAAGAAAGAAAAATTGGAGAGAAAAAAGGAGTCTTTAAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111761 CAGGAACAGAAGAAGAAAGAAAAATTGGAGAGAAAAAAGGAGTCTTTAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGTTAAAAAG         GGTAAAAATTCAATTGATGCAAGTGAAGAGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 111811 AGTTAAAAAGGTA...TAGGGTAAAAATTCAATTGATGCAAGTGAAGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AGCCAG         TTATGAGGAAAAAAAGAGGAAGAGAAGATGAATCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116347 AGCCAGGTA...TAGTTATGAGGAAAAAAAGAGGAAGAGAAGATGAATCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 TACAATATTTCAGAGGTCATGTCAAAAGAG         GAAATTTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 116472 TACAATATTTCAGAGGTCATGTCAAAAGAGGTA...TAGGAAATTTTGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 TGTGGCTAAAAAAAATAAAAAGGAGAATGAG         GATGAAAACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 125024 TGTGGCTAAAAAAAATAAAAAGGAGAATGAGGTA...CAGGATGAAAACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    488 CCTCCTCTACTAATCTCTGTGTGGAAGATCTTCAGAAAAATAAAGATTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127595 CCTCCTCTACTAATCTCTGTGTGGAAGATCTTCAGAAAAATAAAGATTCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 AATAGTATAATTAAAGATAGATTGTCTGAAACGGTTAGGCAGAATACTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127645 AATAGTATAATTAAAGATAGATTGTCTGAAACGGTTAGGCAGAATACTAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 ATTCTTTTTTGACCCAGTCCGGAAGTGTAATGGTCAGCCAGTACCTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127695 ATTCTTTTTTGACCCAGTCCGGAAGTGTAATGGTCAGCCAGTACCTTTTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 AACAACCAAAGCACTTCACTGGAGGAGTGATGCGATGGTACCAAGTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127745 AACAACCAAAGCACTTCACTGGAGGAGTGATGCGATGGTACCAAGTAGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GGCATGGAATGGCTTAGG         ATGCTTTGGGAAAATGGAATTAA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 127795 GGCATGGAATGGCTTAGGGTA...CAGATGCTTTGGGAAAATGGAATTAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 TGGCATTTTAGCAGATGAAATGGGATTGGGTAAGACAGTTCAGTGCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128202 TGGCATTTTAGCAGATGAAATGGGATTGGGTAAGACAGTTCAGTGCATTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 CTACTATTGCATTGATGATTCAGAGAGGAGTACCAGGACCTTTTCTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128252 CTACTATTGCATTGATGATTCAGAGAGGAGTACCAGGACCTTTTCTTGTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 TGTGGCCCTTTGTCTACACTTCCTAACTGGATGGCTGAATTCAAAAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128302 TGTGGCCCTTTGTCTACACTTCCTAACTGGATGGCTGAATTCAAAAGATT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TACACCAGAT         ATCCCTACAATGTTATATCATGGAACCCAGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 128352 TACACCAGATGTA...CAGATCCCTACAATGTTATATCATGGAACCCAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 AGGAACGTCAAAAATTGGTAAGAAATATTTACAAACGGAAAGGGACTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130318 AGGAACGTCAAAAATTGGTAAGAAATATTTACAAACGGAAAGGGACTTTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 CAGATTCATCCTGTGGTAATCACGTCATTTGAAATAGCCATGAGAGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130368 CAGATTCATCCTGTGGTAATCACGTCATTTGAAATAGCCATGAGAGACCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 AAATGCGTTACAG         CATTGCTATTGGAAATACTTAATAGTAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 130418 AAATGCGTTACAGGTA...TAGCATTGCTATTGGAAATACTTAATAGTAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 ATGAAGGACACAGGATTAAGAATATGAAGTGCCGTCTAATCAGGGAGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134979 ATGAAGGACACAGGATTAAGAATATGAAGTGCCGTCTAATCAGGGAGTTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 AAACGATTCAATGCTGATAACAAACTTCTTTTGACTGGTACTCCCTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135029 AAACGATTCAATGCTGATAACAAACTTCTTTTGACTGGTACTCCCTTGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 AAACAATTTATCAGAACTTTGGTCATTGCTAAACTTTTTGTTGCCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135079 AAACAATTTATCAGAACTTTGGTCATTGCTAAACTTTTTGTTGCCAGATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 TATTTGATGACTTGAAAAG         CTTTGAGTCTTGGTTTGACATC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 135129 TATTTGATGACTTGAAAAGGTG...CAGCTTTGAGTCTTGGTTTGACATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 ACTAGTCTTTCTGAAACTGCTGAAGATATTATTGCTAAAGAAAGAGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136610 ACTAGTCTTTCTGAAACTGCTGAAGATATTATTGCTAAAGAAAGAGAACA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 GAATGTATTGCATATGCTGCACCAG         ATTTTAACACCTTTCT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 136660 GAATGTATTGCATATGCTGCACCAGGTT...TAGATTTTAACACCTTTCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 TATTGAGAAGACTGAAGTCTGATGTTGCTCTTGAAGTTCCTCCTAAACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141870 TATTGAGAAGACTGAAGTCTGATGTTGCTCTTGAAGTTCCTCCTAAACGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 GAAGTAGTCGTTTATGCTCCACTTTCAAAGAAGCAGGAGATCTTTTATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141920 GAAGTAGTCGTTTATGCTCCACTTTCAAAGAAGCAGGAGATCTTTTATAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 AGCCATTGTGAACCGTACAATTGCAAACATGTTTGGATCCAGTGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 141970 AGCCATTGTGAACCGTACAATTGCAAACATGTTTGGATCCAGTGAGGTA.

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1489      AAAGAAACAATTGAGTTAAGTCCTACTGGTCGACCAAAACGACGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142020 ..TAGAAAGAAACAATTGAGTTAAGTCCTACTGGTCGACCAAAACGACGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 ACTAGAAAATCAATAAATTACAGCAAAATAGATGATTTCCCTAATGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144083 ACTAGAAAATCAATAAATTACAGCAAAATAGATGATTTCCCTAATGAATT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 GGAAAAACTGATCAGTCAAATACAGCCAGAGGTGGACCGAGAAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 144133 GGAAAAACTGATCAGTCAAATACAGCCAGAGGTGGACCGAGAAAGGTT..

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629     AGCTGTTGTGGAAGTGAATATCCCTGTAGAATCTGAAGTTAATCTG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144183 .TAGAGCTGTTGTGGAAGTGAATATCCCTGTAGAATCTGAAGTTAATCTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 AAGCTGCAGAATATAATGATGCTACTTCGTAAATGTTGTAATCATCCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144309 AAGCTGCAGAATATAATGATGCTACTTCGTAAATGTTGTAATCATCCATA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 TTTGATTGAATATCCTATAGACCCTGTTACACAAGAATTTAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 144359 TTTGATTGAATATCCTATAGACCCTGTTACACAAGAATTTAAGGTG...A

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1768   ATCGATGAAGAATTGGTAACAAATTCTGGGAAGTTCTTGATTTTGGAT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145852 AGATCGATGAAGAATTGGTAACAAATTCTGGGAAGTTCTTGATTTTGGAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 CGAATGCTGCCAGAACTAAAAAAAAGAGGTCACAAG         GTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 145902 CGAATGCTGCCAGAACTAAAAAAAAGAGGTCACAAGGTG...CAGGTGCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 GCTTTTTTCACAAATGACAAGCATGTTGGACATTTTGATGGATTACTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146025 GCTTTTTTCACAAATGACAAGCATGTTGGACATTTTGATGGATTACTGCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 ATCTCAGAGATTTCAACTTCAGCAGGCTTGATGGGTCCATGTCTTACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146075 ATCTCAGAGATTTCAACTTCAGCAGGCTTGATGGGTCCATGTCTTACTCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 GAGAGAGAAAAAAAC         ATGCACAGCTTCAACACGGATCCAGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 146125 GAGAGAGAAAAAAACGTA...TAGATGCACAGCTTCAACACGGATCCAGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 GGTGTTTATCTTCTTAGTGAGTACACGAGCTGGTGGCCTGGGCATTAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147150 GGTGTTTATCTTCTTAGTGAGTACACGAGCTGGTGGCCTGGGCATTAATC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 TGACTGCAGCAGATACAGTTATCATTTATGATAGTGATTGG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 147200 TGACTGCAGCAGATACAGTTATCATTTATGATAGTGATTGGGTA...AAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2089 AACCCCCAGTCGGATCTTCAGGCCCAGGATAGATGTCATAGAATTGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148320 AACCCCCAGTCGGATCTTCAGGCCCAGGATAGATGTCATAGAATTGGTCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2139 GACAAAGCCAGTTGTTGTTTATCGCCTTGTTACAGCAAATACTATCGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148370 GACAAAGCCAGTTGTTGTTTATCGCCTTGTTACAGCAAATACTATCGATC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2189 AGAAAATTGTGGAAAGAGCAGCTGCTAAAAGGAAACTGGAAAAGTTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148420 AGAAAATTGTGGAAAGAGCAGCTGCTAAAAGGAAACTGGAAAAGTTGATC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2239 ATCCATAAAA         ATCATTTCAAAGGTGGTCAGTCTGGATTAAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 148470 ATCCATAAAAGTA...TAGATCATTTCAAAGGTGGTCAGTCTGGATTAAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2280 TCTGTCTAAGAATTTCTTAGATCCTAAGGAATTAATGGAATTATTAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150516 TCTGTCTAAGAATTTCTTAGATCCTAAGGAATTAATGGAATTATTAAAAT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2330 CTAGAGATTATGAAAG         GGAAATAAAAGGATCAAGAGAGAAG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 150566 CTAGAGATTATGAAAGGTG...TAGGGAAATAAAAGGATCAAGAGAGAAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2371 GTCATTAGTGATAAAGATCTAGAGTTGTTGTTAGATCGAAGTGATCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150685 GTCATTAGTGATAAAGATCTAGAGTTGTTGTTAGATCGAAGTGATCTTAT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2421 TG         ATCAAATGAATGCTTCAGGACCAATTAAAGAGAAGATGG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150735 TGGTA...TAGATCAAATGAATGCTTCAGGACCAATTAAAGAGAAGATGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2462 GGATATTCAAGATATTAGAAAATTCTGAAGATTCCAGTCCTGAATGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155192 GGATATTCAAGATATTAGAAAATTCTGAAGATTCCAGTCCTGAATGTTTG

   2700 
   2512 TTT
        |||
 155242 TTT